Patient-Derived SNU Models for Personalized Gastric Cancer Treatment

위암은 분자 아형, 치료 반응 및 임상 결과에서 현저한 이질성을 보이며 여전히 전 세계적으로 심각한 건강 부담을 안고 있습니다. 싸이티온은 개인 맞춤형 의학의 시대에 이러한 다양성을 포착하고 환자별 치료 최적화를 가능하게 하는 전임상 모델이 필요하다는 것을 잘 알고 있습니다. 다양한 임상 병리학적 특징을 가진 한국인 환자 코호트로부터 확립된 서울대학교 위암 세포주는 이 까다로운 악성 종양에서 개인 맞춤형 치료 전략을 개발하고 검증할 수 있는 독보적인 자원을 제공합니다.

주요 내용

• 정밀의학 연구를 가능하게 하는 다양한 분자 아형을 대표하는 서울대학교 위암 라인
• 유전자 프로파일링을 통해 세포주 모델과 환자 종양 특성을 일치시킬 수 있습니다
• 약물 민감도 프로파일링을 통해 표적 치료 및 기존 치료법에 대한 반응 예측
• 바이오마커 기반 치료법 선택으로 치료 결과 개선
• 패널 기반 스크리닝으로 특정 분자적 맥락에 맞는 최적의 치료법 식별

분자 아형 분류 및 세포주 선택

암 게놈 아틀라스(TCGA) 분류는 위암을 뚜렷한 생물학적 특징과 치료적 의미를 지닌 네 가지 분자 하위 유형으로 나눕니다: EBV 양성, 미세위성체 불안정성(MSI-H), 유전적으로 안정(GS), 염색체 불안정(CIN)입니다. 효과적인 개인 맞춤형 치료를 위해서는 각 하위 유형을 대표하는 모델이 필요합니다.

당사의 AGS 세포(300408)는 유전적 특징이 잘 정의된 위선암 모델로, 분자 프로파일이 일치하는 환자 종양의 대리자로 사용할 수 있습니다. AGS 세포는 약물 민감도 데이터와 상관관계가 있는 특징적인 돌연변이와 유전자 발현 패턴을 가지고 있습니다.

차세대 시퀀싱을 통한 환자 종양 분자 프로파일링은 HER2 증폭, MET 증폭, FGFR2 증폭, 마이크로위성체 불안정성 상태 등 실행 가능한 변이를 식별합니다. 일치하는 분자 특징을 기반으로 세포주를 선택하면 개별 환자 상황에 가장 적합한 예측 약물 스크리닝이 가능합니다.

약물 민감도 프로파일링 접근법

위암 세포주 패널 전반에 걸친 고처리량 약물 민감도 스크리닝은 약물 민감도와 분자적 특징의 상관관계가 있는 포괄적인 반응 프로파일을 생성합니다. 이 접근법은 약물 반응에 대한 예측 바이오마커와 특정 치료법의 혜택을 받을 가능성이 높은 환자 집단을 모두 식별합니다.

용량 범위에 걸쳐 수행되는 표준 세포 독성 분석(MTT, CellTiter-Glo)은 수백 가지 화합물에 대한 IC50 값을 생성합니다. 민감도 패턴은 분자 하위 유형에 따라 군집화되어 하위 유형별 치료 취약성을 드러냅니다. 예를 들어, MSI-H 라인은 종종 면역 체크포인트 억제제에 대한 민감도가 향상되고 5-플루오로우라실에 대한 민감도가 감소하는 것으로 나타났습니다.

병용 약물 매트릭스는 단일 요법 이상의 결과를 개선할 수 있는 시너지 요법을 식별합니다. 화학 요법과 표적 약제 조합에 대한 체계적인 테스트를 통해 임상 개발을 위해 우선순위를 정할 수 있는 상호 작용을 밝혀냅니다.

실시간 임피던스(xCELLigence) 또는 라이브 세포 이미징을 사용한 시간 분해능 세포 독성 측정은 엔드포인트 분석 이상의 동역학 정보를 제공하여 세포 억제 효과와 세포 독성 효과를 구별하고 지연된 반응을 식별합니다.

바이오마커 기반 치료법 선택

예측 바이오마커는 특정 치료법에 반응할 가능성이 높은 환자를 식별하여 합리적인 치료법을 선택할 수 있게 해줍니다. 위암에는 임상 진료를 안내하는 몇 가지 확립된 바이오마커와 새로운 바이오마커가 있습니다.

위암의 약 15~20%에서 나타나는 HER2 증폭은 트라스투주맙 함유 요법에 대한 반응을 예측합니다. HER2 증폭이 있는 세포주는 HER2 표적 약제에 대해 정교한 민감도를 보여 전임상 모델에서 이 바이오마커의 유효성을 입증합니다.

마이크로위성체 불안정성 상태는 면역 관문 억제제에 대한 반응을 예측합니다. MSI-H 위암은 돌연변이 부담과 신항원 부하가 높아 항종양 면역을 촉진합니다. MSI-H 세포주 모델은 면역치료 반응에 대한 기계적인 연구를 가능하게 합니다.

PD-L1 발현은 단일 바이오마커로는 불완전하지만 면역치료 반응 예측에 기여합니다. 세포주 PD-L1 발현은 면역 효과 세포와의 공동 배양 시스템에서 체크포인트 차단에 대한 민감도와 상관관계가 있을 수 있습니다.

내성 메커니즘 특성화

내성 메커니즘을 이해하는 것은 치료 실패를 극복하기 위한 전략을 개발하는 데 필수적입니다. 만성 약물 노출 모델을 통해 생성된 약물 내성 세포주 변이체는 내성을 획득한 반면, 본질적으로 내성이 있는 세포주는 일차 내성 메커니즘이 밝혀졌습니다.

내성 세포의 게놈 및 전사체 프로파일링은 내성을 유발하는 변이를 식별합니다. 일반적인 메커니즘에는 표적 유전자 증폭 또는 돌연변이, 우회 경로 활성화, 약물 유출 수송체 상향 조절이 포함됩니다.

기능적 CRISPR 스크리닝은 내성 세포를 치료에 민감하게 만드는 녹아웃 유전자를 식별하여 내성을 극복할 수 있는 조합 파트너를 추천합니다. 이러한 유전적 접근 방식은 내성 역전 전략을 위한 약리학적 스크린을 보완합니다.

위암 맞춤의학 연구를 위한 추천 제품:

• AGS 세포(300408 ) - 잘 특성화된 위 선암종
• HGC-27 세포(300436 ) - 미분화 위암종
• DMEM 고포도당(820300a ) - 표준 배양 배지
• 동결배지 CM-ACF (800650) - 냉동 보존 용액