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COX
Tissue
Sang périphérique
Disease
Lymphome de Burkitt
Synonyms
LCL (DR3)

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COX

Cell line · Product number 302138

The COX cell line is a reference B-lymphoblastoid cell line (B-LCL) derived from a human donor and transformed with Epstein-Barr virus (EBV). It is freque...

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01General information

Description

La lignée cellulaire COX est une lignée cellulaire lymphoblastoïde B (B-LCL) de référence, dérivée d’un donneur humain et transformée par le virus d’Epstein-Barr (EBV). Elle est fréquemment utilisée dans la recherche en immunogénétique et en histocompatibilité, car elle fait partie des panels de l’International Histocompatibility Working Group (IHWG). La lignée cellulaire COX représente un haplotype spécifique du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH), HLA-A1-B8-Cw7-DR3-DQ2, associé à une prédisposition aux maladies auto-immunes telles que le diabète de type 1, le lupus érythémateux systémique et la myasthénie grave. Cet haplotype se distingue par son degré élevé de déséquilibre de liaison, ce qui fait de cette lignée cellulaire un modèle essentiel pour l’étude des associations génétiques liées au CMH.

La séquence génomique de l’haplotype COX a été entièrement caractérisée dans le cadre du projet « MHC Haplotype Project ». Elle s’étend sur environ 4,8 Mb, englobant les régions de classe I, II et III du CMH, ainsi que la région étendue de classe I. Un séquençage détaillé a révélé plus de 16 000 polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) et de nombreuses variations structurelles, fournissant ainsi des informations sur l’architecture génétique de cette région. La caractérisation complète du CMH de la lignée cellulaire COX en fait une ressource clé pour comprendre le fonctionnement du système immunitaire et les bases génétiques des maladies associées au HLA.

En recherche, la lignée cellulaire COX est utilisée pour la cartographie fine des loci associés à des maladies au sein du CMH, ainsi que pour des études fonctionnelles sur le traitement et la présentation des antigènes. Son profil génétique bien défini permet des études comparatives avec d’autres haplotypes du CMH, facilitant l’identification de variants de risque de maladie et de cibles thérapeutiques potentielles. De plus, cette lignée cellulaire est utilisée dans l’évaluation de nouvelles technologies de séquençage et de génotypage, servant de référence standard dans les études immunogénétiques.

Tissue
Sang périphérique
Disease
Lymphome de Burkitt
Synonyms
  • LCL (DR3)

02Classification

Organism
Human
Sex
Male
Growth properties
Suspension
Biosafety level
2

03Characteristics

Morphology
Cellules rondes
Cell type
Lymphoblaste B

04Identifiers

Citation
COX (numéro de catalogue Cytion 302138)
NCBI TaxID
9606
Cellosaurus
CVCL_E534

05Expression and susceptibility

Viruses
Transformé par l'EBV

06Handling and culture

Culture medium
RPMI 1640, contenant 2,0 mM de glutamine stable et 2,0 g/L de NaHCO₃ (numéro d'article Cytion 820700a)
Incubation atmosphere

37 °C, 5 % de CO₂, atmosphère humidifiée.

Supplements
Ajouter au milieu 10 % de sérum fœtal bovin (FBS) inactivé par la chaleur
Subculturing
Homogénéisez délicatement la suspension cellulaire dans le flacon en pipettant de haut en bas, puis prélevez un échantillon représentatif afin de déterminer la densité cellulaire par ml. Diluez la suspension avec du milieu de culture frais jusqu’à obtenir une concentration cellulaire de 1 × 10⁵ cellules/ml, puis répartissez la suspension ajustée en aliquotes dans de nouveaux flacons en vue de la poursuite de la culture.
Seeding density
5 × 105 cellules/cm²
Post-thaw recovery
Après décongélation, ensemencer les cellules à une densité de 5 × 10⁵ cellules/cm² et laisser les cellules se remettre du processus de congélation et adhérer pendant au moins 24 heures.
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

La contamination par les mycoplasmes est exclue à l'aide de tests basés sur la PCR et de méthodes de détection des mycoplasmes par luminescence.

Afin de s’assurer qu’il n’y a aucune contamination bactérienne, fongique ou par des levures, les cultures cellulaires font l’objet d’inspections visuelles quotidiennes.

Freeze medium
Comme milieu de cryoconservation, nous utilisons un milieu de croissance complet (contenant du sérum fœtal bovin) + 10 % de DMSO pour assurer une viabilité adéquate après décongélation, ou du CM-1 (référence Cytion 800100), qui contient des osmoprotecteurs et des stabilisateurs métaboliques optimisés pour améliorer la récupération et réduire le stress induit par la cryoconservation.
Storage conditions

Pour une conservation à long terme, placez les flacons dans de l’azote liquide en phase vapeur à une température comprise entre environ −150 et −196 °C. L’entreposage à −80 °C n’est acceptable qu’à titre d’étape intermédiaire de courte durée avant le transfert dans l’azote liquide.

Shipping conditions

Les lignées cellulaires cryoconservées sont expédiées dans de la glace sèche, dans un emballage isotherme validé contenant suffisamment de réfrigérant pour maintenir une température d’environ −78 °C pendant tout le transport. À la réception, inspectez immédiatement le conteneur et transférez sans délai les flacons dans un lieu de stockage approprié.

08Donor

Donor age
Âge non précisé
Ethnicity
caucasien