Tietäkää, minkä kanssa työskentelette
Ristikontaminaation ja väärän tunnistuksen yleisyyden vuoksi solujen aitous tieteellisessä tutkimuksessa on merkittävä huolenaihe. Arvioiden mukaan 15–36 % solulinjoista on väärin tunnistettuja tai kontaminoituneita1,2,3.
STR-analyysi määrittää solulinjan profiilin ja on ratkaisevan tärkeä luotettavalle ja toistettavalle tutkimukselle. Yhä useampi tiedelehti vaatii myös solulinjan varmentamista ennen artikkelin hyväksymistä.
Palveluumme sisältyy
Solulinjan autentikointi
Näytteenne STR-profilointi ihmisen, hiiren, rotan, koiran ja hamsterin soluille.
Vertailu verkkotietokantoihin
Profiilianne verrataan Cellosaurus-tietokantaan.
Julkaisuvalmis raportti
Selkeä analyysiraportti, jota voitte käyttää julkaisuihin ja tiedelehtien vaatimuksiin.
Markkerit
Näin se toimii
Helppokäyttöinen
01
Tilauslomake
Ladatkaa tilauslomake, täyttäkää se ja tulostakaa.
02
Näyte
Valmistelkaa näytteenne genomisena DNA:na tai solupellettinä.
03
Lähetys
Lähettäkää näyte tulostetun lomakkeen kanssa pehmustetussa kirjekuoressa huoneenlämmössä.
04
Tulokset
Saatte tulokset sähköpostitse 2 viikon kuluessa.
Näytevaatimukset
Genominen DNA
Vähintään 50 µl gDNA:ta pitoisuudella 50 ng/µl, liuotettuna Tris- tai EDTA-liuokseen (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Solupelletti
1.0–5.0 miljoonaa solua solupellettinä. Peskää kahdesti PBS:llä ja suspendoikaa uudelleen 0.5 ml:aan 70–90 % etanolia.
Tulokset
2 viikon kuluessa
Saatte tulokset sähköpostitse.
Tietokantavertailu
Tulokset sisältävät tietojenne vertailun Cellosaurus-tietokantaan.
Selkeä luokittelu
Solulinjanne luokitellaan autentikoiduksi tai väärin tunnistetuksi.
Tietoa STR-analyysistä
Lyhyet tandemtoistot
Lyhyt tandemtoisto on 2–13 emäksen DNA-motiivi, joka toistuu jopa useita satoja kertoja. Toistojen määrä vaihtelee yksilöiden välillä, mikä johtaa erilaisiin fragmenttipituuksiin PCR:ssä. Solulinjat profiloidaan näiden erojen perusteella useissa lokuksissa.
Solulinjaseosten havaitseminen
Yhden solulinjan kontaminaatio yhdellä tai useammalla muulla solulinjalla voidaan havaita aina kontaminoivan solulinjan 10 %:n osuuteen asti. Seokset osoittavat tyypillisesti STR-profiileja, joissa on kolme tai useampi piikki yhdessä tai useammassa lokuksessa.
Konsultaatiopyyntö
Kertokaa meille projektistanne
Ensimmäiseen vaiheeseen riittää muutama tieto. Tieteellinen tiimimme tarkastelee pyyntöänne ja ottaa teihin yhteyttä.
YHTEYSHENKILÖNNE
Jannes Steinmann
Solubiologian johtaja
LÄHTEET
- Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
- Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
- Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344