Preskoči na vsebino

Avtentikacija celične linije (STR)

Potrdite identiteto svoje celične linije

Vedite, s čim delate

Glede na razširjenost navzkrižne kontaminacije in napačne identifikacije je avtentičnost celic v znanstvenih raziskavah velika skrb. Ocenjuje se, da je 15 do 36 % celičnih linij napačno identificiranih ali kontaminiranih1,2,3.

Analiza STR določi profil celične linije in je ključnega pomena za zanesljive in ponovljive raziskave. Vse več revij pred sprejemom članka zahteva tudi preverjanje celične linije.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Naša storitev vključuje

Avtentikacija celične linije
Profiliranje STR Vašega vzorca za človeške, mišje, podganje, pasje in hrčkove celice.
Primerjava s spletnimi zbirkami podatkov
Vaš profil se primerja z zbirko podatkov Cellosaurus.
Poročilo, pripravljeno za objavo
Jasno analitično poročilo, ki ga lahko uporabite za publikacije in zahteve revij.

Označevalci

Vrsta
Tipizacija
Človeške celice
16 označevalcev STR, tipiziranih s sistemom PowerPlex podjetja Promega
Mišje celice
18 označevalcev STR
Podganje celice
14 označevalcev STR in en spolno specifičen označevalec
Pasje celice
11 označevalcev STR
Hrčkove celice
10 označevalcev STR

Kako poteka

Enostavno za uporabo

01
Naročilnica
Prenesite naročilnico, jo izpolnite in natisnite.
02
Vzorec
Pripravite svoj vzorec kot genomsko DNA ali kot celično peleto.
03
Pošiljka
Pošljite vzorec z natisnjenim obrazcem v oblazinjeni ovojnici pri sobni temperaturi.
04
Rezultati
Rezultate prejmete po e-pošti v 2 tednih.

Zahteve za vzorec

Genomska DNA
Vsaj 50 µl gDNA pri 50 ng/µl, raztopljene v Tris ali EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Celična peleta
1.0 do 5.0 milijona celic kot celična peleta. Dvakrat sperite s PBS in resuspendirajte v 0.5 ml 70 do 90 % etanola.
Prenesite naročilnico

Rezultati

V 2 tednih
Rezultate prejmete po e-pošti.
Primerjava z zbirko podatkov
Rezultati vključujejo primerjavo Vaših podatkov z zbirko podatkov Cellosaurus.
Jasna razvrstitev
Vaša celična linija je razvrščena kot avtenticirana ali napačno identificirana.

O analizi STR

Kratke tandemske ponovitve
Kratka tandemska ponovitev je motiv DNA z 2 do 13 bazami, ki se ponovi do nekaj sto krat. Število ponovitev se med posamezniki razlikuje, kar vodi do različnih dolžin fragmentov v PCR. Celične linije se profilirajo glede na te razlike na več lokusih.
Odkrivanje mešanic celičnih linij
Kontaminacijo ene celične linije z eno ali več dodatnimi celičnimi linijami je mogoče zaznati do frekvence 10 % kontaminirajoče celične linije. Mešanice običajno kažejo profile STR s tremi ali več vrhovi na enem ali več lokusih.

Zaprosite za posvet

Povejte nam o Vašem projektu

Za prvi korak zadostuje nekaj podatkov. Naša znanstvena ekipa preuči Vašo zahtevo in se Vam oglasi.

Jannes Steinmann
VAŠA KONTAKTNA OSEBA
Jannes Steinmann
Vodja celične biologije
Zaprosite za posvet
VIRI
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344