Gå til innholdet

Autentisering av cellelinjer (STR)

Bekreft identiteten til cellelinjen din

Vit hva du arbeider med

Gitt den utbredte forekomsten av krysskontaminasjon og feilidentifisering er cellenes autentisitet i vitenskapelig forskning en vesentlig bekymring. Det anslås at 15 til 36 % av cellelinjene er feilidentifisert eller kontaminert1,2,3.

STR-analyse fastslår profilen til en cellelinje og er avgjørende for pålitelig og reproduserbar forskning. Et økende antall tidsskrifter krever også verifisering av cellelinjer før de godtar en artikkel.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Tjenesten vår omfatter

Autentisering av cellelinjer
STR-profilering av prøven din for celler fra menneske, mus, rotte, hund og hamster.
Sammenligning med nettbaserte databaser
Profilen din sammenlignes med Cellosaurus-databasen.
Publiseringsklar rapport
En oversiktlig analyserapport som du kan bruke til publikasjoner og tidsskriftkrav.

Markører

Art
Typebestemmelse
Humane celler
16 STR-markører, typebestemt med PowerPlex System fra Promega
Museceller
18 STR-markører
Rotteceller
14 STR-markører og én kjønnsspesifikk markør
Hundeceller
11 STR-markører
Hamsterceller
10 STR-markører

Slik fungerer det

Enkel å bruke

01
Bestillingsskjema
Last ned bestillingsskjemaet, fyll det ut og skriv det ut.
02
Prøve
Klargjør prøven din som genomisk DNA eller som en cellepellet.
03
Forsendelse
Send prøven sammen med det utskrevne skjemaet i en polstret konvolutt ved romtemperatur.
04
Resultater
Du mottar resultatene på e-post innen 2 uker.

Krav til prøven

Genomisk DNA
Minst 50 µl gDNA ved 50 ng/µl, oppløst i Tris eller EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Cellepellet
1.0 til 5.0 millioner celler som en cellepellet. Vask to ganger med PBS og resuspender i 0.5 ml 70 til 90 % etanol.
Last ned bestillingsskjemaet

Resultater

Innen 2 uker
Du mottar resultatene på e-post.
Databasesammenligning
Resultatene inkluderer sammenligningen av dataene dine med Cellosaurus-databasen.
Tydelig klassifisering
Cellelinjen din klassifiseres som autentisert eller feilidentifisert.

Om STR-analyse

Korte tandemrepetisjoner
En kort tandemrepetisjon er et DNA-motiv på 2 til 13 baser som gjentas opptil flere hundre ganger. Antallet repetisjoner varierer mellom individer, noe som gir ulike fragmentlengder i PCR. Cellelinjer profileres ut fra disse forskjellene ved flere loci.
Påvisning av cellelinjeblandinger
Kontaminasjon av én cellelinje med én eller flere andre cellelinjer kan påvises ned til en frekvens på 10 % av den kontaminerende cellelinjen. Blandinger viser typisk STR-profiler med tre eller flere topper ved ett eller flere loci.

Be om en konsultasjon

Fortell oss om prosjektet deres

Noen få opplysninger er nok til det første steget. Vårt vitenskapelige team gjennomgår henvendelsen deres og tar kontakt.

Jannes Steinmann
DERES KONTAKTPERSON
Jannes Steinmann
Leder for cellebiologi
Be om en konsultasjon
KILDER
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344