Gå direkte til indholdet

Autentificering af cellelinjer (STR)

Bekræft Deres cellelinjes identitet

Vid, hvad De arbejder med

I betragtning af udbredelsen af krydskontaminering og fejlidentifikation er cellers autenticitet i videnskabelig forskning et stort problem. Det anslås, at 15 til 36 % af cellelinjerne er fejlidentificerede eller kontaminerede1,2,3.

STR-analyse bestemmer en cellelinjes profil og er afgørende for pålidelig og reproducerbar forskning. Et stigende antal tidsskrifter kræver desuden verificering af cellelinjen, før en artikel accepteres.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Vores ydelse omfatter

Autentificering af cellelinjer
STR-profilering af Deres prøve for celler fra menneske, mus, rotte, hund og hamster.
Sammenligning med onlinedatabaser
Deres profil sammenlignes med Cellosaurus-databasen.
Publikationsklar rapport
En klar analyserapport, som De kan bruge til publikationer og tidsskriftskrav.

Markører

Arter
Typebestemmelse
Humane celler
16 STR-markører, typebestemt med PowerPlex System fra Promega
Museceller
18 STR-markører
Rotteceller
14 STR-markører og én kønsspecifik markør
Hundeceller
11 STR-markører
Hamsterceller
10 STR-markører

Sådan fungerer det

Nem at bruge

01
Bestillingsformular
Download bestillingsformularen, udfyld den og print den.
02
Prøve
Forbered Deres prøve som genomisk DNA eller som en cellepellet.
03
Forsendelse
Send prøven med den printede formular i en polstret kuvert ved stuetemperatur.
04
Resultater
De modtager resultaterne via e-mail inden for 2 uger.

Prøvekrav

Genomisk DNA
Mindst 50 µl gDNA ved 50 ng/µl, opløst i Tris eller EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Cellepellet
1.0 til 5.0 millioner celler som en cellepellet. Vask to gange med PBS og resuspender i 0.5 ml 70 til 90 % ethanol.
Download bestillingsformularen

Resultater

Inden for 2 uger
De modtager resultaterne via e-mail.
Databasesammenligning
Resultaterne omfatter sammenligningen af Deres data med Cellosaurus-databasen.
Klar klassificering
Deres cellelinje klassificeres som autentificeret eller fejlidentificeret.

Om STR-analyse

Korte tandemgentagelser
En kort tandemgentagelse er et DNA-motiv på 2 til 13 baser, som gentages op til flere hundrede gange. Antallet af gentagelser varierer mellem individer, hvilket fører til forskellige fragmentlængder i PCR. Cellelinjer profileres ud fra disse forskelle på flere loci.
Påvisning af blandinger af cellelinjer
Kontaminering af én cellelinje med en eller flere yderligere cellelinjer kan påvises ned til en frekvens på 10 % af den kontaminerende cellelinje. Blandinger viser typisk STR-profiler med tre eller flere toppe på et eller flere loci.

Anmod om en konsultation

Fortæl os om Deres projekt

Nogle få oplysninger er nok til det første skridt. Vores videnskabelige team gennemgår Deres henvendelse og vender tilbage til Dem.

Jannes Steinmann
DERES KONTAKT
Jannes Steinmann
Leder af cellebiologi
Anmod om en konsultation
KILDER
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344