Pāriet uz saturu

Šūnu līniju autentifikācija (STR)

Apstipriniet savas šūnu līnijas identitāti

Ziniet, ar ko strādājat

Ņemot vērā savstarpējā piesārņojuma un nepareizas identifikācijas izplatību, šūnu autentiskums zinātniskajos pētījumos ir nopietna problēma. Tiek lēsts, ka no 15 līdz 36 % šūnu līniju ir nepareizi identificētas vai piesārņotas1,2,3.

STR analīze nosaka šūnu līnijas profilu un ir būtiska uzticamiem un atkārtojamiem pētījumiem. Arvien vairāk žurnālu pieprasa arī šūnu līnijas pārbaudi pirms raksta pieņemšanas.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Mūsu pakalpojums ietver

Šūnu līniju autentifikācija
Jūsu parauga STR profilēšana cilvēka, peles, žurkas, suņa un kāmja šūnām.
Salīdzinājums ar tiešsaistes datubāzēm
Jūsu profils tiek salīdzināts ar Cellosaurus datubāzi.
Publicēšanai gatavs pārskats
Skaidrs analīzes pārskats, ko varat izmantot publikācijām un žurnālu prasībām.

Marķieri

Sugas
Tipēšana
Cilvēka šūnas
16 STR marķieri, tipēti ar Promega PowerPlex System
Peles šūnas
18 STR marķieri
Žurkas šūnas
14 STR marķieri un viens dzimumam specifisks marķieris
Suņa šūnas
11 STR marķieri
Kāmja šūnas
10 STR marķieri

Kā tas darbojas

Vienkārši lietojams

01
Pasūtījuma veidlapa
Lejupielādējiet pasūtījuma veidlapu, aizpildiet to un izdrukājiet.
02
Paraugs
Sagatavojiet savu paraugu kā genoma DNA vai kā šūnu granulu.
03
Nosūtīšana
Nosūtiet paraugu kopā ar izdrukāto veidlapu polsterētā aploksnē istabas temperatūrā.
04
Rezultāti
Rezultātus pa e-pastu saņemsiet 2 nedēļu laikā.

Prasības paraugam

Genoma DNA
Vismaz 50 µl gDNA ar koncentrāciju 50 ng/µl, izšķīdināta Tris vai EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Šūnu granula
No 1.0 līdz 5.0 miljoniem šūnu kā šūnu granula. Divreiz mazgājiet ar PBS un resuspendējiet 0.5 ml 70–90 % etanola.
Lejupielādēt pasūtījuma veidlapu

Rezultāti

2 nedēļu laikā
Rezultātus saņemsiet pa e-pastu.
Salīdzinājums ar datubāzi
Rezultātos ir iekļauts jūsu datu salīdzinājums ar Cellosaurus datubāzi.
Skaidra klasifikācija
Jūsu šūnu līnija tiek klasificēta kā autentificēta vai nepareizi identificēta.

Par STR analīzi

Īsie tandēma atkārtojumi
Īsais tandēma atkārtojums ir 2 līdz 13 bāzu DNA motīvs, kas atkārtojas līdz pat vairākiem simtiem reižu. Atkārtojumu skaits atšķiras starp indivīdiem, kas PCR laikā rada dažāda garuma fragmentus. Šūnu līnijas tiek profilētas pēc šīm atšķirībām vairākos lokusos.
Šūnu līniju maisījumu noteikšana
Vienas šūnu līnijas piesārņojumu ar vienu vai vairākām papildu šūnu līnijām var noteikt līdz pat 10 % piesārņojošās šūnu līnijas biežumam. Maisījumi parasti uzrāda STR profilus ar trim vai vairāk pīķiem vienā vai vairākos lokusos.

Pieprasīt konsultāciju

Pastāstiet mums par savu projektu

Pirmajam solim pietiek ar dažām detaļām. Mūsu zinātniskā komanda izskata jūsu pieprasījumu un sazinās ar jums.

Jannes Steinmann
JŪSU KONTAKTPERSONA
Jannes Steinmann
Šūnu bioloģijas nodaļas vadītājs
Pieprasīt konsultāciju
AVOTI
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344