Gå direkt till innehållet

Autentisering av cellinjer (STR)

Bekräfta identiteten på er cellinje

Vet vad ni arbetar med

Med tanke på hur utbredd korskontaminering och felidentifiering är, utgör cellernas autenticitet en stor angelägenhet inom vetenskaplig forskning. Det uppskattas att 15 till 36 % av cellinjerna är felidentifierade eller kontaminerade1,2,3.

STR-analys fastställer en cellinjes profil och är avgörande för tillförlitlig och repeterbar forskning. Ett växande antal tidskrifter kräver också verifiering av cellinjer innan de accepterar en artikel.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Vår tjänst omfattar

Autentisering av cellinjer
STR-profilering av ert prov för celler från människa, mus, råtta, hund och hamster.
Jämförelse med onlinedatabaser
Er profil jämförs med Cellosaurus-databasen.
Publiceringsklar rapport
En tydlig analysrapport som ni kan använda för publikationer och tidskriftskrav.

Markörer

Art
Typning
Humana celler
16 STR-markörer, typade med PowerPlex System från Promega
Musceller
18 STR-markörer
Råttceller
14 STR-markörer och en könsspecifik markör
Hundceller
11 STR-markörer
Hamsterceller
10 STR-markörer

Så fungerar det

Enkelt att använda

01
Beställningsformulär
Ladda ner beställningsformuläret, fyll i det och skriv ut det.
02
Prov
Förbered ert prov som genomiskt DNA eller som en cellpellet.
03
Försändelse
Skicka provet med det utskrivna formuläret i ett vadderat kuvert vid rumstemperatur.
04
Resultat
Ni får resultaten via e-post inom 2 veckor.

Provkrav

Genomiskt DNA
Minst 50 µl gDNA vid 50 ng/µl, löst i Tris eller EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Cellpellet
1.0 till 5.0 miljoner celler som en cellpellet. Tvätta två gånger med PBS och resuspendera i 0.5 ml 70 till 90 % etanol.
Ladda ner beställningsformuläret

Resultat

Inom 2 veckor
Ni får resultaten via e-post.
Databasjämförelse
Resultaten omfattar jämförelsen av era data med Cellosaurus-databasen.
Tydlig klassificering
Er cellinje klassificeras som autentiserad eller felidentifierad.

Om STR-analys

Korta tandemrepetitioner
En kort tandemrepetition är ett DNA-motiv på 2 till 13 baser som upprepas upp till flera hundra gånger. Antalet repetitioner varierar mellan individer, vilket leder till olika fragmentlängder i PCR. Cellinjer profileras utifrån dessa skillnader vid flera loci.
Detektion av cellinjeblandningar
Kontaminering av en cellinje av en eller flera ytterligare cellinjer kan detekteras ner till en frekvens på 10 % av den kontaminerande cellinjen. Blandningar visar vanligtvis STR-profiler med tre eller fler toppar vid ett eller flera loci.

Begär en konsultation

Berätta om ert projekt

Några få uppgifter räcker för det första steget. Vårt vetenskapliga team granskar er förfrågan och återkommer till er.

Jannes Steinmann
ER KONTAKTPERSON
Jannes Steinmann
Chef för cellbiologi
Begär en konsultation
KÄLLOR
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344