Prejsť na obsah

Autentifikácia bunkovej línie (STR)

Potvrďte identitu svojej bunkovej línie

Vedzte, s čím pracujete

Vzhľadom na rozšírenosť krížovej kontaminácie a zámeny je autenticita buniek vo vedeckom výskume závažným problémom. Odhaduje sa, že 15 až 36 % bunkových línií je zamenených alebo kontaminovaných1,2,3.

Analýza STR určuje profil bunkovej línie a je kľúčová pre spoľahlivý a opakovateľný výskum. Rastúci počet časopisov tiež vyžaduje overenie bunkovej línie pred prijatím článku.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Naša služba zahŕňa

Autentifikácia bunkovej línie
Profilovanie STR Vašej vzorky pre ľudské, myšacie, potkanie, psie a škrečie bunky.
Porovnanie s online databázami
Váš profil sa porovnáva s databázou Cellosaurus.
Správa pripravená na publikovanie
Prehľadná analytická správa, ktorú môžete použiť pre publikácie a požiadavky časopisov.

Markery

Druh
Typizácia
Ľudské bunky
16 markerov STR, typizovaných systémom PowerPlex od spoločnosti Promega
Myšacie bunky
18 markerov STR
Potkanie bunky
14 markerov STR a jeden pohlavne špecifický marker
Psie bunky
11 markerov STR
Škrečie bunky
10 markerov STR

Ako to funguje

Jednoduché použitie

01
Objednávkový formulár
Stiahnite si objednávkový formulár, vyplňte ho a vytlačte.
02
Vzorka
Pripravte svoju vzorku ako genómovú DNA alebo ako bunkovú peletu.
03
Odoslanie
Zašlite vzorku s vytlačeným formulárom v obálke s výplňou pri izbovej teplote.
04
Výsledky
Výsledky dostanete e-mailom do 2 týždňov.

Požiadavky na vzorku

Genómová DNA
Najmenej 50 µl gDNA pri koncentrácii 50 ng/µl, rozpustenej v Tris alebo EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Bunková peleta
1.0 až 5.0 milióna buniek ako bunková peleta. Dvakrát premyte v PBS a resuspendujte v 0.5 ml 70 až 90 % etanolu.
Stiahnuť objednávkový formulár

Výsledky

Do 2 týždňov
Výsledky dostanete e-mailom.
Porovnanie s databázou
Výsledky zahŕňajú porovnanie Vašich údajov s databázou Cellosaurus.
Jednoznačná klasifikácia
Vaša bunková línia je klasifikovaná ako autentifikovaná alebo zamenená.

O analýze STR

Krátke tandemové repetície
Krátka tandemová repetícia je motív DNA s 2 až 13 bázami, ktorý sa opakuje až niekoľko stokrát. Počet repetícií sa medzi jednotlivcami líši, čo vedie k rôznym dĺžkam fragmentov v PCR. Bunkové línie sa profilujú podľa týchto rozdielov na viacerých lokusoch.
Detekcia zmesí bunkových línií
Kontamináciu jednej bunkovej línie jednou alebo viacerými ďalšími bunkovými líniami možno zistiť až do frekvencie 10 % kontaminujúcej bunkovej línie. Zmesi zvyčajne vykazujú profily STR s tromi alebo viacerými vrcholmi na jednom alebo viacerých lokusoch.

Požiadajte o konzultáciu

Povedzte nám o Vašom projekte

Na prvý krok stačí niekoľko údajov. Náš vedecký tím Vašu požiadavku posúdi a ozve sa Vám.

Jannes Steinmann
VÁŠ KONTAKT
Jannes Steinmann
Vedúci oddelenia bunkovej biológie
Požiadajte o konzultáciu
ZDROJE
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344