Vězte, s čím pracujete
Vzhledem k rozšířenosti zkřížené kontaminace a nesprávné identifikace je autenticita buněk ve vědeckém výzkumu významným problémem. Odhaduje se, že 15 až 36 % buněčných linií je nesprávně identifikováno nebo kontaminováno1,2,3.
STR analýza určuje profil buněčné linie a je klíčová pro spolehlivý a opakovatelný výzkum. Rostoucí počet časopisů navíc vyžaduje ověření buněčné linie před přijetím článku.
Naše služba zahrnuje
Autentizace buněčných linií
STR profilování Vašeho vzorku pro buňky člověka, myši, potkana, psa a křečka.
Porovnání s online databázemi
Váš profil je porovnán s databází Cellosaurus.
Zpráva připravená k publikaci
Přehledná analytická zpráva, kterou můžete použít pro publikace a požadavky časopisů.
Markery
Jak to funguje
Snadné použití
01
Objednávkový formulář
Stáhněte si objednávkový formulář, vyplňte jej a vytiskněte.
02
Vzorek
Připravte svůj vzorek jako genomovou DNA nebo jako buněčnou peletu.
03
Odeslání
Zašlete vzorek s vytištěným formulářem v polstrované obálce při pokojové teplotě.
04
Výsledky
Výsledky obdržíte e-mailem do 2 týdnů.
Požadavky na vzorek
Genomová DNA
Nejméně 50 µl gDNA o koncentraci 50 ng/µl, rozpuštěné v Tris nebo EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Buněčná peleta
1.0 až 5.0 milionu buněk jako buněčná peleta. Dvakrát promyjte PBS a resuspendujte v 0.5 ml 70 až 90 % ethanolu.
Výsledky
Do 2 týdnů
Výsledky obdržíte e-mailem.
Porovnání s databází
Výsledky zahrnují porovnání Vašich dat s databází Cellosaurus.
Jednoznačná klasifikace
Vaše buněčná linie je klasifikována jako autentizovaná, nebo nesprávně identifikovaná.
O STR analýze
Krátké tandemové repetice
Krátká tandemová repetice je DNA motiv o 2 až 13 bázích, který se opakuje až několik set krát. Počet repetic se mezi jednotlivci liší, což vede k různým délkám fragmentů v PCR. Buněčné linie jsou profilovány podle těchto rozdílů na několika lokusech.
Detekce směsí buněčných linií
Kontaminaci jedné buněčné linie jednou nebo více dalšími buněčnými liniemi lze detekovat až do frekvence 10 % kontaminující buněčné linie. Směsi typicky vykazují STR profily se třemi nebo více píky na jednom nebo několika lokusech.
Požádejte o konzultaci
Řekněte nám o Vašem projektu
Pro první krok stačí několik údajů. Náš vědecký tým Váš požadavek posoudí a ozve se Vám.
VÁŠ KONTAKT
Jannes Steinmann
Vedoucí oddělení buněčné biologie
ZDROJE
- Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
- Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
- Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344