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Autenticazione delle linee cellulari (STR)

Confermi l'identità della Sua linea cellulare

Sappia con cosa lavora

Data la diffusione di contaminazioni incrociate ed errori di identificazione, l'autenticità delle cellule nella ricerca scientifica è una preoccupazione rilevante. Si stima che dal 15 al 36 % delle linee cellulari sia erroneamente identificato o contaminato1,2,3.

L'analisi STR determina il profilo di una linea cellulare ed è fondamentale per una ricerca affidabile e ripetibile. Un numero crescente di riviste richiede inoltre la verifica della linea cellulare prima di accettare un articolo.

Cell culture work in the Cytion laboratory

Il nostro servizio include

Autenticazione delle linee cellulari
Profilazione STR del Suo campione per cellule umane, di topo, ratto, cane e criceto.
Confronto con banche dati online
Il Suo profilo viene confrontato con la banca dati Cellosaurus.
Report pronto per la pubblicazione
Un chiaro report di analisi utilizzabile per pubblicazioni e requisiti delle riviste.

Marcatori

Specie
Tipizzazione
Cellule umane
16 marcatori STR, tipizzati con il sistema PowerPlex di Promega
Cellule di topo
18 marcatori STR
Cellule di ratto
14 marcatori STR e un marcatore sesso-specifico
Cellule di cane
11 marcatori STR
Cellule di criceto
10 marcatori STR

Come funziona

Facile da usare

01
Modulo d'ordine
Scarichi il modulo d'ordine, lo compili e lo stampi.
02
Campione
Prepari il Suo campione come DNA genomico o come pellet cellulare.
03
Spedizione
Invii il campione con il modulo stampato in una busta imbottita a temperatura ambiente.
04
Risultati
Riceverà i risultati via e-mail entro 2 settimane.

Requisiti del campione

DNA genomico
Almeno 50 µl di gDNA a 50 ng/µl, disciolto in Tris o EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Pellet cellulare
Da 1.0 a 5.0 milioni di cellule come pellet cellulare. Lavare due volte con PBS e risospendere in 0.5 ml di etanolo dal 70 al 90 %.
Scarichi il modulo d'ordine

Risultati

Entro 2 settimane
Riceverà i risultati via e-mail.
Confronto con banca dati
I risultati includono il confronto dei Suoi dati con la banca dati Cellosaurus.
Classificazione chiara
La Sua linea cellulare viene classificata come autenticata o erroneamente identificata.

Informazioni sull'analisi STR

Ripetizioni brevi in tandem
Una ripetizione breve in tandem è un motivo di DNA di 2-13 basi ripetuto fino a diverse centinaia di volte. Il numero di ripetizioni varia da individuo a individuo, generando lunghezze di frammento diverse in PCR. Le linee cellulari vengono profilate in base a queste differenze su più loci.
Rilevamento di miscele di linee cellulari
La contaminazione di una linea cellulare da parte di una o più linee cellulari aggiuntive può essere rilevata fino a una frequenza del 10 % della linea cellulare contaminante. Le miscele mostrano tipicamente profili STR con tre o più picchi su uno o più loci.

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Bastano pochi dettagli per il primo passo. Il nostro team scientifico esamina la Sua richiesta e Le risponde.

Jannes Steinmann
IL SUO REFERENTE
Jannes Steinmann
Responsabile di Biologia Cellulare
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FONTI
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344