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Autenticação de linhas celulares (STR)

Confirme a identidade da sua linha celular

Saiba com o que trabalha

Dada a prevalência da contaminação cruzada e da identificação incorreta, a autenticidade das células na investigação científica é uma preocupação importante. Estima-se que 15 a 36 % das linhas celulares estão identificadas incorretamente ou contaminadas1,2,3.

A análise STR determina o perfil de uma linha celular e é crucial para uma investigação fiável e reprodutível. Um número crescente de revistas exige também a verificação da linha celular antes de aceitar um artigo.

Cell culture work in the Cytion laboratory

O nosso serviço inclui

Autenticação de linhas celulares
Perfilamento STR da sua amostra para células humanas, de ratinho, de ratazana, de cão e de hamster.
Comparação com bases de dados online
O seu perfil é comparado com a base de dados Cellosaurus.
Relatório pronto para publicação
Um relatório de análise claro que pode utilizar para publicações e para os requisitos das revistas.

Marcadores

Espécie
Tipagem
Células humanas
16 marcadores STR, tipados com o PowerPlex System da Promega
Células de ratinho
18 marcadores STR
Células de ratazana
14 marcadores STR e um marcador específico do sexo
Células de cão
11 marcadores STR
Células de hamster
10 marcadores STR

Como funciona

Fácil de utilizar

01
Formulário de encomenda
Transfira o formulário de encomenda, preencha-o e imprima-o.
02
Amostra
Prepare a sua amostra como DNA genómico ou como um pellet de células.
03
Envio
Envie a amostra com o formulário impresso num envelope almofadado à temperatura ambiente.
04
Resultados
Recebe os resultados por e-mail no prazo de 2 semanas.

Requisitos da amostra

DNA genómico
Pelo menos 50 µl de gDNA a 50 ng/µl, dissolvido em Tris ou EDTA (10 mM Tris, 0.1 mM EDTA).
Pellet de células
1.0 a 5.0 milhões de células na forma de pellet de células. Lave duas vezes com PBS e ressuspenda em 0.5 ml de etanol a 70 a 90 %.
Transfira o formulário de encomenda

Resultados

No prazo de 2 semanas
Recebe os resultados por e-mail.
Comparação com base de dados
Os resultados incluem a comparação dos seus dados com a base de dados Cellosaurus.
Classificação clara
A sua linha celular é classificada como autenticada ou identificada incorretamente.

Sobre a análise STR

Repetições curtas em tandem
Uma repetição curta em tandem é um motivo de DNA de 2 a 13 bases que se repete até várias centenas de vezes. O número de repetições varia entre indivíduos, o que origina comprimentos de fragmento diferentes na PCR. As linhas celulares são perfiladas a partir destas diferenças em vários loci.
Deteção de misturas de linhas celulares
A contaminação de uma linha celular por uma ou mais linhas celulares adicionais pode ser detetada até uma frequência de 10 % da linha celular contaminante. As misturas apresentam normalmente perfis STR com três ou mais picos num ou em vários loci.

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Fale-nos do seu projeto

Bastam alguns dados para o primeiro passo. A nossa equipa científica analisa o seu pedido e entra em contacto consigo.

Jannes Steinmann
O SEU CONTACTO
Jannes Steinmann
Diretor de Biologia Celular
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FONTES
  1. Lorsch JR, Collins FS, Lippincott-Schwartz J. Fixing problems with cell lines. Science. 2014;346(6216):1452–1453. pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5101941
  2. Hughes P, Marshall D, Reid Y, Parkes H, Gelber C. The costs of using unauthenticated, over-passaged cell lines: how much more data do we need? BioTechniques. 2007;43(5):575–586. doi:10.2144/000112598
  3. Freedman LP, Gibson MC, Wisman R, Ethier SP, Soule HR, Reid YA, Neve RM. The culture of cell culture practices and authentication: results from a 2015 survey. BioTechniques. 2015;59(4):189–192. doi:10.2144/000114344