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GM12878
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GM-12878

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GM12878

Cell line · Référence du produit 305439

La lignée cellulaire GM12878 est une lignée de cellules lymphoblastiques humaines bien caractérisée, transformée par le virus d'Epstein-Barr (EBV). Elle a été utilisée comme référence Ti...

€550.00hors taxes et frais de port

Personnalisation / Recommandations

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1

01Informations générales

Description

La lignée cellulaire GM12878 est une lignée cellulaire lymphoblastoïde humaine bien caractérisée, transformée par le virus d'Epstein-Barr (EBV). Elle a été utilisée comme lignée cellulaire standard de niveau 1 dans le cadre du projet ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements), ce qui en fait l'un des modèles les plus étudiés pour la recherche génétique et transcriptomique. Provenant d'un donneur de sexe féminin, GM12878 est connue pour son caryotype stable par rapport aux lignées cellulaires plus couramment utilisées, telles que HeLa et HEK293, qui présentent une aneuploïdie chromosomique importante.

Ces cellules sont particulièrement utiles pour comprendre la structure de la chromatine, la régulation des gènes et la réponse immunitaire en raison de leur lignée lymphocytaire B. Les cellules GM12878 ont été utilisées dans des études à haut débit, y compris des analyses ChIP-seq pour cartographier les sites de liaison des facteurs de transcription et les modifications des histones, MNase-seq pour la cartographie des nucléosomes et RNA-seq pour le profilage du transcriptome. Les études impliquant GM12878 ont élucidé certains aspects des interactions des facteurs de transcription, tels que la liaison de FOXM1 et de ses cofacteurs, et leurs rôles dans les voies du cycle cellulaire et de la réponse immunitaire.

En outre, le GM12878 a servi de plateforme pour des expériences d'édition du génome visant à créer des matériaux de référence pour la validation du séquençage de nouvelle génération (NGS). Par exemple, des modifications du génome médiées par CRISPR/Cas9 ont été introduites dans GM12878 afin de développer des matériaux de contrôle pour l'analyse des mutations cancéreuses, illustrant ainsi son application dans la médecine de précision et les tests génétiques.

Tissu
Sang périphérique
Synonymes
  • GM-12878

02Classification

Organisme
Humain
Sexe
Femme
Propriétés de croissance
Suspension
Niveau de biosécurité
2

03Caractéristiques

Morphologie
De type lymphoblaste

04Identifiants

Référence
GM12878 (numéro de catalogue 305439 de Cytion)
Numéro d'identification fiscale NCBI
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expression et sensibilité

Profil mutationnel
Mutation : CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Virus
Transformant : Virus d'Epstein-Barr (EBV)

06Manipulation et culture

Milieu de culture
RPMI 1640, w : 2.0 mM Glutamine stable, w : 2.0 g/L NaHCO3 (numéro d'article Cytion 820700a)
Atmosphère d'incubation

37°C, 5%CO2, atmosphère humidifiée.

Compléments alimentaires
Compléter le milieu avec 15 % de FBS
Repiquage
Entretenez les cultures en ajoutant ou en remplaçant périodiquement le milieu. Démarrez les cultures avec une densité de 5 x 105 cellules/ml et maintenez la concentration cellulaire dans une fourchette comprise entre 3 x 105 et 1 x 106 cellules/ml pour une croissance optimale.
Récupération après le dégel
Après décongélation, laisser les cellules se remettre du processus de congélation pendant au moins 24 heures
Décongélation et mise en culture
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Contrôle qualité et cryoconservation

Stérilité

La contamination par les mycoplasmes est exclue à l'aide de tests basés sur la PCR et de méthodes de détection des mycoplasmes basées sur la luminescence.

Pour s'assurer de l'absence de contamination bactérienne, fongique ou levurienne, les cultures cellulaires font l'objet d'inspections visuelles quotidiennes.

Milieu de congélation
Comme milieu de cryoconservation, nous utilisons un milieu de croissance complet (comprenant du FBS) + 10 % de DMSO pour une viabilité adéquate après décongélation, ou CM-1 (numéro de catalogue 800100 de Cytion), qui comprend des osmoprotectants et des stabilisateurs métaboliques optimisés pour améliorer la récupération et réduire le stress induit par la cryogénisation.
Conditions de stockage

Pour une conservation à long terme, placer les flacons dans de l'azote liquide en phase vapeur à une température comprise entre -150 et -196 °C environ. Le stockage à -80 °C n'est acceptable qu'en tant qu'étape intermédiaire de courte durée avant le transfert dans l'azote liquide.

Conditions de livraison

Les lignées cellulaires cryoconservées sont expédiées sur glace sèche dans des emballages isolés et validés, avec suffisamment de réfrigérant pour maintenir une température d'environ -78 °C tout au long du transport. À la réception, inspecter immédiatement le conteneur et transférer sans délai les flacons dans un lieu de stockage approprié.

08Donateur

Âge du donneur
Non spécifié