Preskoči na vsebino
GM12878
Tkivo
Periferna kri
Sinonimi
GM-12878

Dokumenti

GM12878

Cell line · Številka izdelka 305439

Celična linija GM12878 je dobro opredeljena človeška limfoblastoidna celična linija, transformirana z virusom Epstein-Barr (EBV). Uporablja se kot standardni Ti...

€550.00brez davka in stroškov poštnine
Na zalogi
Lot
Priporočeno (najsvežja pošiljka)
  • CoA
  • CoA
1

01Splošne informacije

Opis

Celična linija GM12878 je dobro opisana človeška limfoblastoidna celična linija, spremenjena z virusom Epstein-Barr (EBV). Uporablja se kot standardna celična linija stopnje 1 v projektu ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements), zato je eden najbolj preučevanih modelov za genetske in transkriptomske raziskave. GM12878, ki izvira od ženskega darovalca, je znana po svojem stabilnem kariotipu v primerjavi s pogosteje uporabljenimi celičnimi linijami, kot sta HeLa in HEK293, ki imata obsežno kromosomsko aneuploidijo.

Te celice so zaradi svoje B-limfocitne linije še posebej dragocene za razumevanje strukture kromatina, regulacije genov in imunskega odziva. Celice GM12878 so bile uporabljene v visoko zmogljivih študijah, vključno z analizami ChIP-seq za kartiranje vezavnih mest transkripcijskih faktorjev in modifikacij histonov, MNase-seq za kartiranje nukleosomov in RNA-seq za profiliranje transkriptoma. Študije z GM12878 so razjasnile vidike interakcij transkripcijskih faktorjev, kot so vezava FOXM1 in njegovih kofaktorjev, ter njihove vloge v celičnem ciklu in poteh imunskega odziva.

Poleg tega je GM12878 služil kot platforma za poskuse urejanja genoma, namenjene ustvarjanju referenčnih materialov za potrjevanje sekvenciranja naslednje generacije (NGS). V GM12878 so bile na primer uvedene spremembe genoma, posredovane s CRISPR/Cas9, za razvoj kontrolnih materialov za analizo mutacij raka, kar ponazarja njegovo uporabo v precizni medicini in genetskem testiranju.

Tkivo
Periferna kri
Sinonimi
  • GM-12878

02Razvrstitev

Organizem
Človek
Seks
Ženska
Lastnosti rasti
Vzmetenje
Stopnja biološke varnosti
2

03Značilnosti

Morfologija
Limfoblastom podobni

04Identifikatorji

Navajanje vira
GM12878 (kataloška številka Cytion 305439)
Davčna identifikacijska številka NCBI
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Izražanje in dovzetnost

Profil mutacij
Mutacija: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Virusi
Transformant: Virus Epstein-Barr (EBV)

06Ravnanje in gojenje

Gojišče
RPMI 1640, w: 2,0 mM stabilnega glutamina, w: 2,0 g/L NaHCO3 (številka izdelka Cytion 820700a)
Inkubacijska atmosfera

37 °C, 5 %CO2, vlažno ozračje.

Prehranska dopolnila
Gojišče dopolnite s 15 % FBS
Preusmeritev v drugo kulturo
Kulture vzdržujte z rednim dodajanjem ali zamenjavo gojišča. Kulture začnite z gostoto 5 x 105 celic/ml in za optimalno rast ohranjajte koncentracijo celic v območju od 3 x 105 do 1 x 106 celic/ml.
Obnova po odtaljevanju
Po odmrznitvi pustite celice, da si opomorejo od postopka zamrzovanja vsaj 24 ur
Odtaljevanje in gojenje
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kontrola kakovosti in krioprezervacija

Sterilnost

Kontaminacija z mikoplazmo se izključi z uporabo testov na podlagi PCR in metod za odkrivanje mikoplazme na podlagi luminiscence.

Da se zagotovi, da ni kontaminacije z bakterijami, glivami ali kvasovkami, se celične kulture dnevno vizualno pregledujejo.

Medij za zamrzovanje
Kot gojišče za kriokonzervacijo uporabljamo popolno rastno gojišče (vključno s FBS) + 10 % DMSO za ustrezno vitalnost po odmrznitvi ali CM-1 (kataloška številka 800100 podjetja Cytion), ki vključuje optimizirane osmoprotektante in presnovne stabilizatorje za izboljšanje okrevanja in zmanjšanje stresa, povzročenega s kriom.
Pogoji shranjevanja

Za dolgotrajno shranjevanje viale postavite v tekoči dušik v parni fazi pri približno -150 do -196 °C. Shranjevanje pri -80 °C je sprejemljivo le kot kratek vmesni korak pred prenosom v tekoči dušik.

Pogoji dostave

Kriokonzervirane celične linije se pošiljajo na suhem ledu v potrjeni, izolirani embalaži z zadostno količino hladilnega sredstva, da se med prevozom vzdržuje približno -78 °C. Ob prejemu takoj preglejte embalažo in viale nemudoma prenesite v ustrezno skladišče.

08Donator

Starost darovalca
Neopredeljeno