Skip to content
GM12878
Tissue
Máu ngoại vi
Synonyms
GM-12878

Documents

GM12878

Cell line · Product number 305439

The GM12878 cell line is a well-characterized human lymphoblastoid cell line, transformed with Epstein-Barr virus (EBV). It has been used as a standard Ti...

€550.00excl. tax and shipping

Customization / Recommendations

In stock
Lot
Recommended (freshest lot)
  • CoA
  • CoA
1

01General information

Description

Dòng tế bào GM12878 là một dòng tế bào lymphoblastoid người được đặc trưng rõ ràng, được biến đổi bởi virus Epstein-Barr (EBV). Nó đã được sử dụng làm dòng tế bào tiêu chuẩn cấp 1 trong dự án Bách khoa toàn thư về các yếu tố DNA (ENCODE), khiến nó trở thành một trong những mô hình được nghiên cứu rộng rãi nhất cho nghiên cứu di truyền và chuyển mã. Xuất phát từ một người hiến tặng nữ, GM12878 nổi tiếng với bộ nhiễm sắc thể ổn định so với các dòng tế bào được sử dụng phổ biến hơn như HeLa và HEK293, vốn có sự bất thường nhiễm sắc thể nghiêm trọng.

Các tế bào này đặc biệt có giá trị trong việc hiểu cấu trúc chromatin, điều hòa gen và phản ứng miễn dịch do nguồn gốc từ dòng tế bào lympho B. Tế bào GM12878 đã được sử dụng trong các nghiên cứu quy mô lớn, bao gồm phân tích ChIP-seq để xác định vị trí gắn kết của các yếu tố chuyển dịch và sửa đổi histone, MNase-seq để lập bản đồ nucleosome, và RNA-seq để phân tích biểu hiện gen. Các nghiên cứu liên quan đến GM12878 đã làm sáng tỏ các khía cạnh của tương tác giữa các yếu tố chuyển dịch, chẳng hạn như sự gắn kết của FOXM1 và các yếu tố đồng tác động của nó, cũng như vai trò của chúng trong các con đường chu kỳ tế bào và phản ứng miễn dịch.

Hơn nữa, GM12878 đã được sử dụng làm nền tảng cho các thí nghiệm chỉnh sửa gen nhằm tạo ra vật liệu tham chiếu cho việc xác thực trình tự gen thế hệ tiếp theo (NGS). Ví dụ, các sửa đổi gen bằng CRISPR/Cas9 đã được đưa vào GM12878 để phát triển vật liệu đối chứng cho phân tích đột biến ung thư, minh họa ứng dụng của nó trong y học chính xác và xét nghiệm di truyền.

Tissue
Máu ngoại vi
Synonyms
  • GM-12878

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Suspension
Biosafety level
2

03Characteristics

Morphology
Tế bào lymphoblast-like

04Identifiers

Citation
GM12878 (Số catalog Cytion 305439)
NCBI TaxID
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expression and susceptibility

Mutational profile
Biến đổi gen: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Viruses
Biến thể: Virus Epstein-Barr (EBV)

06Handling and culture

Culture medium
RPMI 1640, chứa: 2,0 mM glutamine ổn định, chứa: 2,0 g/L NaHCO₃ (Số hiệu sản phẩm Cytion 820700a)
Incubation atmosphere

37°C, 5%CO₂, môi trường ẩm.

Supplements
Bổ sung 15% huyết thanh bò phôi (FBS) vào môi trường nuôi cấy
Subculturing
Bảo quản các dòng tế bào bằng cách định kỳ bổ sung hoặc thay thế môi trường nuôi cấy. Khởi tạo các dòng tế bào với mật độ 5 x 10⁵ tế bào/ml và duy trì nồng độ tế bào trong khoảng từ 3 x 10⁵ đến 1 x 10⁶ tế bào/ml để đạt được sự phát triển tối ưu.
Post-thaw recovery
Sau khi rã đông, hãy để các tế bào phục hồi sau quá trình đông lạnh trong ít nhất 24 giờ
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

Sự nhiễm khuẩn Mycoplasma được loại trừ bằng cả các phương pháp xét nghiệm dựa trên PCR và các phương pháp phát hiện Mycoplasma dựa trên phát quang.

Để đảm bảo không có nhiễm khuẩn vi khuẩn, nấm hoặc men, các mẫu nuôi cấy tế bào được kiểm tra trực quan hàng ngày.

Freeze medium
Như một môi trường bảo quản đông lạnh, chúng tôi sử dụng môi trường tăng trưởng hoàn chỉnh (bao gồm FBS) + 10% DMSO để đảm bảo độ sống sau khi rã đông, hoặc CM-1 (mã sản phẩm Cytion 800100), bao gồm các chất bảo vệ thẩm thấu và chất ổn định chuyển hóa được tối ưu hóa để cải thiện quá trình phục hồi và giảm stress do đông lạnh gây ra.
Storage conditions

Để bảo quản lâu dài, hãy đặt ống nghiệm vào nitơ lỏng ở pha hơi ở nhiệt độ khoảng −150 đến −196 °C. Việc bảo quản ở −80 °C chỉ được chấp nhận như một bước trung gian ngắn hạn trước khi chuyển sang nitơ lỏng.

Shipping conditions

Các dòng tế bào được bảo quản bằng phương pháp đông lạnh được vận chuyển trên đá khô trong bao bì cách nhiệt đã được kiểm định, kèm theo lượng chất làm lạnh đủ để duy trì nhiệt độ khoảng −78 °C trong suốt quá trình vận chuyển. Khi nhận hàng, hãy kiểm tra ngay lập tức bao bì và chuyển các ống nghiệm sang nơi lưu trữ phù hợp mà không chậm trễ.

08Donor

Donor age
Không xác định