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GM12878
Gewebe
Peripheres Blut
Synonyme
GM-12878

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GM12878

Cell line · Artikelnummer 305439

Die Zelllinie GM12878 ist eine gut charakterisierte humane lymphoblastische Zelllinie, die mit dem Epstein-Barr-Virus (EBV) transformiert wurde. Sie wird als Standard-Ti… verwendet.

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01Allgemeine Informationen

Beschreibung

Die Zelllinie GM12878 ist eine gut charakterisierte menschliche lymphoblastoide Zelllinie, die mit dem Epstein-Barr-Virus (EBV) transformiert wurde. Sie wurde als Standard-Zelllinie der Stufe 1 im Rahmen des ENCODE-Projekts (Encyclopedia of DNA Elements) verwendet und ist damit eines der am häufigsten untersuchten Modelle für die genetische und transkriptomische Forschung. GM12878 stammt von einer weiblichen Spenderin und ist bekannt für ihren stabilen Karyotyp im Vergleich zu häufiger verwendeten Zelllinien wie HeLa und HEK293, die eine starke chromosomale Aneuploidie aufweisen.

Diese Zellen sind aufgrund ihrer B-Lymphozyten-Linie besonders wertvoll für das Verständnis der Chromatinstruktur, der Genregulation und der Immunantwort. GM12878-Zellen wurden in Hochdurchsatzstudien eingesetzt, darunter ChIP-seq-Analysen zur Kartierung von Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen und Histonmodifikationen, MNase-seq für die Nukleosomkartierung und RNA-seq für die Transkriptom-Profilierung. Studien mit GM12878 haben Aspekte der Interaktionen von Transkriptionsfaktoren aufgeklärt, wie z. B. die Bindung von FOXM1 und seinen Kofaktoren sowie deren Rolle im Zellzyklus und bei der Immunantwort.

Darüber hinaus diente GM12878 als Plattform für Genom-Editierungsexperimente mit dem Ziel, Referenzmaterialien für die Validierung der Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) zu schaffen. So wurden beispielsweise CRISPR/Cas9-vermittelte Genomveränderungen in GM12878 eingeführt, um Kontrollmaterialien für die Analyse von Krebsmutationen zu entwickeln, was seine Anwendung in der Präzisionsmedizin und bei Gentests verdeutlicht.

Gewebe
Peripheres Blut
Synonyme
  • GM-12878

02Klassifizierung

Organismus
Mensch
Sex
Weiblich
Wachstumseigenschaften
Aussetzung
Biologische Sicherheitsstufe
2

03Merkmale

Morphologie
Lymphoblasten-ähnlich

04Bezeichner

Quellenangabe
GM12878 (Cytion-Katalognummer 305439)
NCBI-Steuer-ID
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expression und Anfälligkeit

Mutationsprofil
Mutation: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Viren
Transformant: Epstein-Barr-Virus (EBV)

06Handhabung und Kultur

Nährmedium
RPMI 1640, w: 2,0 mM stabiles Glutamin, w: 2,0 g/L NaHCO3 (Cytion-Artikelnummer 820700a)
Inkubationsatmosphäre

37°C, 5%CO2, befeuchtete Atmosphäre.

Nahrungsergänzungsmittel
Ergänzen Sie das Medium mit 15% FBS
Subkultivierung
Halten Sie die Kulturen aufrecht, indem Sie regelmäßig Medium hinzufügen oder austauschen. Beginnen Sie die Kulturen mit einer Dichte von 5 x 105 Zellen/ml und halten Sie die Zellkonzentration im Bereich von 3 x 105 bis 1 x 106 Zellen/ml, um ein optimales Wachstum zu erzielen.
Erholung nach dem Auftauen
Nach dem Auftauen müssen sich die Zellen mindestens 24 Stunden lang vom Einfrieren erholen
Auftauen und Kultivierung
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Qualitätskontrolle und Kryokonservierung

Sterilität

Eine Kontamination mit Mykoplasmen wird sowohl durch PCR-basierte Assays als auch durch lumineszenzbasierte Mykoplasmen-Nachweisverfahren ausgeschlossen.

Um sicherzustellen, dass keine Kontamination mit Bakterien, Pilzen oder Hefen vorliegt, werden die Zellkulturen täglich visuell überprüft.

Gefriermedium
Als Kryokonservierungsmedium verwenden wir komplettes Wachstumsmedium (einschließlich FBS) + 10 % DMSO für eine angemessene Lebensfähigkeit nach dem Auftauen oder CM-1 (Cytion Katalognummer 800100), das optimierte Osmoprotektoren und Stoffwechselstabilisatoren enthält, um die Erholung zu verbessern und kryoinduzierten Stress zu reduzieren.
Lagerbedingungen

Zur Langzeitkonservierung werden die Fläschchen in flüssigem Stickstoff bei etwa -150 bis -196 °C gelagert. Eine Lagerung bei -80 °C ist nur als kurzer Zwischenschritt vor der Überführung in flüssigen Stickstoff akzeptabel.

Versandbedingungen

Kryokonservierte Zelllinien werden auf Trockeneis in einer validierten, isolierten Verpackung mit ausreichend Kühlmittel versandt, um während des gesamten Transports eine Temperatur von etwa -78 °C aufrechtzuerhalten. Prüfen Sie den Behälter bei Erhalt sofort und bringen Sie die Fläschchen unverzüglich in ein geeignetes Lager.

08Spender

Alter des Spenders
Nicht spezifiziert