Ga naar de inhoud
GM12878
Weefsel
Perifeer bloed
Synoniemen
GM-12878

Documenten

GM12878

Cell line · Productnummer 305439

De GM12878-cellijn is een goed gekarakteriseerde menselijke lymfoblastoïde cellijn, getransformeerd met het Epstein-Barr-virus (EBV). Deze cellijn wordt gebruikt als standaard Ti...

€550.00excl. btw en verzendkosten

Maatwerk / Aanbevelingen

Op voorraad
Lot
Aanbevolen (verste partij)
  • CoA
  • CoA
1

01Algemene informatie

Beschrijving

De GM12878 cellijn is een goed gekarakteriseerde menselijke lymfoblastoïde cellijn, getransformeerd met het Epstein-Barr virus (EBV). Het is gebruikt als een standaard Tier 1 cellijn in de Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project, waardoor het een van de meest bestudeerde modellen voor genetisch en transcriptomisch onderzoek. GM12878 is afkomstig van een vrouwelijke donor en staat bekend om zijn stabiele karyotype in vergelijking met meer algemeen gebruikte cellijnen zoals HeLa en HEK293, die uitgebreide chromosomale aneuploïdie hebben.

Deze cellen zijn bijzonder waardevol voor het begrijpen van de chromatinestructuur, genregulatie en immuunrespons vanwege hun B-lymfocyt afstamming. GM12878 cellen zijn gebruikt in high-throughput studies, waaronder ChIP-seq analyses om bindingsplaatsen van transcriptiefactoren en histonmodificaties in kaart te brengen, MNase-seq om nucleosomen in kaart te brengen en RNA-seq voor transcriptoom profilering. Studies met GM12878 hebben aspecten van transcriptiefactorinteracties opgehelderd, zoals de binding van FOXM1 en zijn co-factoren en hun rol in celcyclus- en immuunresponspaden.

Bovendien heeft GM12878 gediend als een platform voor genoombewerkingsexperimenten gericht op het creëren van referentiematerialen voor NGS-validatie (next-generation sequencing). Zo zijn CRISPR/Cas9-gemedieerde genoommodificaties geïntroduceerd in GM12878 om controlematerialen te ontwikkelen voor de analyse van kankermutaties, wat de toepassing in precisiegeneeskunde en genetische tests illustreert.

Weefsel
Perifeer bloed
Synoniemen
  • GM-12878

02Classificatie

Organisme
Mens
Seks
Vrouw
Groei-eigenschappen
Ophanging
Bioveiligheidsniveau
2

03Kenmerken

Morfologie
Lymfoblast-achtig

04Identificatiegegevens

Bronvermelding
GM12878 (Cytion catalogusnummer 305439)
NCBI-belastingnummer
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expressie en vatbaarheid

Mutatieprofiel
Mutatie: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Virussen
Transformant: Epstein-Barr virus (EBV)

06Behandeling en kweek

Kweekmedium
RPMI 1640, w: 2,0 mM stabiele Glutamine, w: 2,0 g/L NaHCO3 (Cytion artikelnummer 820700a)
Incubatieomgeving

37°C, 5%CO2, bevochtigde atmosfeer.

Supplementen
Vul het medium aan met 15% FBS
Heruitplanten
Onderhoud de culturen door het medium periodiek toe te voegen of te vervangen. Start de culturen met een dichtheid van 5 x 105 cellen/ml en houd de celconcentratie binnen het bereik van 3 x 105 tot 1 x 106 cellen/ml voor een optimale groei.
Herstel na ontdooiing
Laat de cellen na het ontdooien minstens 24 uur bijkomen van het vriesproces
Ontdooien en kweken
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kwaliteitscontrole en cryopreservatie

Onvruchtbaarheid

Mycoplasmaverontreiniging wordt uitgesloten met zowel PCR-gebaseerde testen als op luminescentie gebaseerde mycoplasmadetectiemethoden.

Om er zeker van te zijn dat er geen besmetting is met bacteriën, schimmels of gisten, worden de celculturen dagelijks onderworpen aan visuele inspecties.

Kweekmedium invriezen
Als cryoconserveringsmedium gebruiken we volledig groeimedium (inclusief FBS) + 10% DMSO voor voldoende levensvatbaarheid na het ontdooien, of CM-1 (Cytion catalogusnummer 800100), dat geoptimaliseerde osmoprotectanten en metabolische stabilisatoren bevat om het herstel te verbeteren en door cryo geïnduceerde stress te verminderen.
Opslagvoorwaarden

Voor langdurige bewaring plaatst u flesjes in vloeibare stikstof in dampfase bij ongeveer -150 tot -196 °C. Opslag bij -80 °C is alleen aanvaardbaar als korte tussenstap vóór overbrenging naar vloeibare stikstof.

Verzendvoorwaarden

Gecryopreserveerde cellijnen worden verzonden op droog ijs in gevalideerde, geïsoleerde verpakkingen met voldoende koelmiddel om gedurende het transport ongeveer -78 °C te handhaven. Inspecteer de verpakking onmiddellijk na ontvangst en breng de flacons onverwijld over naar de juiste opslagplaats.

08Donateur

Leeftijd van de donor
Ongespecificeerd