Skip to content
GM12878
Tissue
เลือดส่วนปลาย
Synonyms
GM-12878

Documents

GM12878

Cell line · Product number 305439

The GM12878 cell line is a well-characterized human lymphoblastoid cell line, transformed with Epstein-Barr virus (EBV). It has been used as a standard Ti...

€550.00excl. tax and shipping

Customization / Recommendations

In stock
Lot
Recommended (freshest lot)
  • CoA
  • CoA
1

01General information

Description

เซลล์ไลน์ GM12878 เป็นเซลล์ไลน์ลิมโฟบลาสต์ของมนุษย์ที่มีการจำแนกคุณลักษณะอย่างละเอียด ซึ่งถูกเปลี่ยนแปลงด้วยไวรัสเอปสไตน์-บาร์ (EBV) เซลล์ไลน์นี้ถูกใช้เป็นเซลล์ไลน์มาตรฐานระดับ Tier 1 ในโครงการ Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) ทำให้เป็นหนึ่งในโมเดลที่ได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางที่สุดสำหรับการวิจัยทางพันธุกรรมและทรานสคริปโตมิกส์GM12878 ซึ่งมีต้นกำเนิดจากผู้บริจาคเพศหญิง เป็นที่รู้จักกันดีในเรื่องของคาริโอไทป์ที่เสถียรเมื่อเทียบกับเซลล์ไลน์ที่ใช้กันทั่วไป เช่น HeLa และ HEK293 ซึ่งมีความผิดปกติของจำนวนโครโมโซมอย่างกว้างขวาง

เซลล์เหล่านี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการทำความเข้าใจโครงสร้างโครมาติน การควบคุมยีน และการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน เนื่องจากเป็นเซลล์ในสายพันธุ์บีลิมโฟไซต์เซลล์ GM12878 ถูกนำมาใช้ในการศึกษาแบบ high-throughput รวมถึงการวิเคราะห์ ChIP-seq เพื่อทำแผนที่ตำแหน่งการจับของปัจจัยถอดรหัสและการดัดแปลงฮิสโตน, MNase-seq สำหรับการทำแผนที่นิวคลีโอโซม, และ RNA-seq สำหรับการสร้างโปรไฟล์ทรานสคริปโตม การศึกษาที่เกี่ยวข้องกับ GM12878 ได้อธิบายแง่มุมของการปฏิสัมพันธ์ของปัจจัยถอดรหัส เช่น การจับของ FOXM1 และปัจจัยร่วมของมัน และบทบาทของพวกมันในวิถีของวัฏจักรเซลล์และการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน

นอกจากนี้ GM12878 ยังทำหน้าที่เป็นแพลตฟอร์มสำหรับการทดลองแก้ไขจีโนมที่มีเป้าหมายเพื่อสร้างวัสดุอ้างอิงสำหรับการตรวจสอบความถูกต้องของการหาลำดับจีโนมรุ่นถัดไป (NGS) ตัวอย่างเช่น การดัดแปลงจีโนมโดยใช้ CRISPR/Cas9 ได้ถูกนำมาใช้ใน GM12878 เพื่อพัฒนาวัสดุควบคุมสำหรับการวิเคราะห์การกลายพันธุ์ของมะเร็ง ซึ่งแสดงให้เห็นถึงการประยุกต์ใช้ในด้านการแพทย์แม่นยำและการทดสอบทางพันธุกรรม

Tissue
เลือดส่วนปลาย
Synonyms
  • GM-12878

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Suspension
Biosafety level
2

03Characteristics

Morphology
ลักษณะคล้ายลิมโฟบลาสต์

04Identifiers

Citation
GM12878 (หมายเลขแคตตาล็อก Cytion 305439)
NCBI TaxID
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expression and susceptibility

Mutational profile
การกลายพันธุ์: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Viruses
ทรานส์ฟอร์แมนท์: ไวรัสเอปสไตน์-บาร์ร์ (EBV)

06Handling and culture

Culture medium
RPMI 1640, w: 2.0 mM กลูตามีนเสถียร, w: 2.0 กรัม/ลิตร NaHCO3 (หมายเลขบทความ Cytion 820700a)
Incubation atmosphere

37°C, 5%CO2, บรรยากาศชื้น

Supplements
เติมอาหารเลี้ยงเชื้อด้วย FBS 15%
Subculturing
รักษาวัฒนธรรมโดยการเติมหรือเปลี่ยนอาหารเลี้ยงเชื้อเป็นระยะๆ เริ่มต้นวัฒนธรรมด้วยความหนาแน่น 5 x 105 เซลล์/มล. และรักษาความเข้มข้นของเซลล์ให้อยู่ในช่วง 3 x 105 ถึง 1 x 106 เซลล์/มล. เพื่อการเจริญเติบโตที่ดีที่สุด
Post-thaw recovery
หลังจากละลายน้ำแข็งแล้ว ให้เซลล์ฟื้นตัวจากกระบวนการแช่แข็งเป็นเวลาอย่างน้อย 24 ชั่วโมง
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

การปนเปื้อนของไมโคพลาสมาถูกตัดออกโดยใช้ทั้งการทดสอบแบบ PCR และการตรวจหาไมโคพลาสมาโดยใช้วิธีการเรืองแสง

เพื่อให้แน่ใจว่าไม่มีการปนเปื้อนของแบคทีเรีย เชื้อรา หรือยีสต์ การเพาะเลี้ยงเซลล์จะถูกตรวจสอบด้วยสายตาทุกวัน

Freeze medium
ในฐานะที่เป็นสารอาหารสำหรับการแช่แข็ง เราใช้สารอาหารสำหรับการเจริญเติบโตแบบครบถ้วน (รวมถึง FBS) + 10% DMSO เพื่อความมีชีวิตหลังการละลายที่เพียงพอ หรือ CM-1 (หมายเลขแคตตาล็อก Cytion 800100) ซึ่งรวมถึงสารป้องกันออสโมติกและสารรักษาเสถียรภาพเมตาบอลิซึมที่ได้รับการปรับให้เหมาะสมเพื่อเพิ่มการฟื้นตัวและลดความเครียดที่เกิดจากการแช่แข็ง
Storage conditions

สำหรับการเก็บรักษาในระยะยาว ให้วางหลอดบรรจุในไนโตรเจนเหลวในสถานะไอที่อุณหภูมิประมาณ −150 ถึง −196 °C การเก็บรักษาที่อุณหภูมิ −80 °C สามารถใช้ได้เฉพาะในระยะสั้นก่อนการย้ายไปยังไนโตรเจนเหลวเท่านั้น

Shipping conditions

เซลล์ไลน์ที่แช่แข็งในไนโตรเจนเหลวจะถูกจัดส่งในบรรจุภัณฑ์ที่ผ่านการตรวจสอบแล้วและมีการเก็บรักษาความเย็นด้วยน้ำแข็งแห้ง พร้อมสารทำความเย็นที่เพียงพอเพื่อรักษาอุณหภูมิประมาณ −78 °C ตลอดการขนส่ง เมื่อได้รับสินค้า ให้ตรวจสอบภาชนะทันทีและถ่ายโอนหลอดทดลองไปยังที่เก็บที่เหมาะสมโดยไม่ล่าช้า

08Donor

Donor age
ไม่ระบุ