Gå til innholdet
GM12878
Vev
Perifert blod
Synonymer
GM-12878

Dokumenter

GM12878

Cell line · Produktnummer 305439

Cellelinjen GM12878 er en godt karakterisert human lymfoblastoidcellelinje som er transformert med Epstein-Barr-virus (EBV). Den har blitt brukt som en standard Ti...

€550.00ekskl. mva. og frakt

Tilpasning / Anbefalinger

På lager
Lot
Anbefalt (det ferskeste partiet)
  • CoA
  • CoA
1

01Generell informasjon

Beskrivelse

GM12878-cellelinjen er en velkarakterisert human lymfoblastoid cellelinje som er transformert med Epstein-Barr-virus (EBV). Den har blitt brukt som en standard Tier 1-cellelinje i Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE)-prosjektet, noe som gjør den til en av de mest studerte modellene for genetisk og transkriptomisk forskning. GM12878 stammer fra en kvinnelig donor og er kjent for sin stabile karyotype sammenlignet med mer brukte cellelinjer som HeLa og HEK293, som har omfattende kromosomal aneuploidi.

Disse cellene er spesielt verdifulle for å forstå kromatinstruktur, genregulering og immunrespons på grunn av deres B-lymfocyttlinje. GM12878-celler har blitt brukt i høykapasitetsstudier, inkludert ChIP-seq-analyser for å kartlegge bindingssteder for transkripsjonsfaktorer og histonmodifikasjoner, MNase-seq for nukleosomkartlegging og RNA-seq for transkriptomprofilering. Studier med GM12878 har belyst aspekter ved transkripsjonsfaktorinteraksjoner, for eksempel bindingen av FOXM1 og dens kofaktorer, og deres roller i cellesyklus og immunresponsveier.

GM12878 har dessuten fungert som en plattform for genomredigeringseksperimenter med sikte på å skape referansemateriale for validering av neste generasjons sekvensering (NGS). For eksempel har CRISPR/Cas9-medierte genomiske modifikasjoner blitt introdusert i GM12878 for å utvikle kontrollmaterialer for kreftmutasjonsanalyse, noe som illustrerer anvendelsen av GM12878 i presisjonsmedisin og genetisk testing.

Vev
Perifert blod
Synonymer
  • GM-12878

02Klassifisering

Organisme
Menneske
Sex
Kvinne
Vekstegenskaper
Oppheng
Biosikkerhetsnivå
2

03Egenskaper

Morfologi
Lymfoblastlignende

04Identifikatorer

Kildehenvisning
GM12878 (Cytion-katalognummer 305439)
NCBI-skattenummer
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Uttrykk og mottakelighet

Mutasjonsprofil
Mutasjon: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Virus
Transformant: Epstein-Barr-virus (EBV)

06Håndtering og kultur

Næringsmedium
RPMI 1640, m: 2,0 mM stabil glutamin, m: 2,0 g/L NaHCO3 (Cytion artikkelnummer 820700a)
Inkubasjonsatmosfære

37 °C, 5 %CO2, befuktet atmosfære.

Kosttilskudd
Suppler mediet med 15 % FBS
Subkultivering
Oppretthold kulturene ved å tilsette eller skifte ut mediet med jevne mellomrom. Start kulturene med en tetthet på 5 x 105 celler/ml og hold cellekonsentrasjonen innenfor området 3 x 105 til 1 x 106 celler/ml for optimal vekst.
Gjenoppretting etter tining
Etter tining, la cellene restituere seg fra fryseprosessen i minst 24 timer
Tining og dyrking
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kvalitetskontroll og kryokonservering

Sterilitet

Mykoplasma-kontaminering utelukkes ved hjelp av både PCR-baserte analyser og luminescensbaserte metoder for påvisning av mykoplasma.

For å sikre at det ikke finnes bakterie-, sopp- eller gjærkontaminering, blir cellekulturene inspisert visuelt hver dag.

Frysemedium
Som kryopreserveringsmedium bruker vi komplett vekstmedium (inkludert FBS) + 10 % DMSO for tilstrekkelig levedyktighet etter opptining, eller CM-1 (Cytion-katalognummer 800100), som inneholder optimaliserte osmobeskyttende midler og metabolske stabilisatorer for å øke utvinningen og redusere kryoindusert stress.
Oppbevaringsbetingelser

For langtidsoppbevaring plasseres hetteglassene i flytende nitrogen i dampfase ved ca. -150 til -196 °C. Lagring ved -80 °C er kun akseptabelt som et kort mellomtrinn før overføring til flytende nitrogen.

Fraktvilkår

Kryopreserverte cellelinjer sendes på tørris i validert, isolert emballasje med tilstrekkelig kjølemiddel til å opprettholde en temperatur på ca. -78 °C under hele transporten. Ved mottak skal beholderen inspiseres umiddelbart, og hetteglassene skal straks overføres til egnet lagringsplass.

08Donor

Donorens alder
Uspesifisert