Skip to content
GM12878
Tissue
Sangue periférico
Synonyms
GM-12878

Documents

GM12878

Cell line · Product number 305439

The GM12878 cell line is a well-characterized human lymphoblastoid cell line, transformed with Epstein-Barr virus (EBV). It has been used as a standard Ti...

US$800.00excl. tax and shipping
In stock
Lot
Recommended (freshest lot)
  • CoA
  • CoA
1

01General information

Description

A linhagem celular GM12878 é uma linhagem de células linfoblastoides humanas bem caracterizada, transformada pelo vírus de Epstein-Barr (EBV). Ela tem sido utilizada como linha celular padrão de Nível 1 no projeto Enciclopédia dos Elementos de DNA (ENCODE), tornando-se um dos modelos mais amplamente estudados para pesquisas genéticas e transcriptômicas. Originária de uma doadora, a GM12878 é conhecida por seu cariótipo estável em comparação com linhas celulares mais comumente utilizadas, como HeLa e HEK293, que apresentam aneuploidia cromossômica extensa.

Essas células são particularmente valiosas para a compreensão da estrutura da cromatina, da regulação gênica e da resposta imunológica devido à sua linhagem de linfócitos B. As células GM12878 têm sido empregadas em estudos de alto rendimento, incluindo análises de ChIP-seq para mapear locais de ligação de fatores de transcrição e modificações de histonas, MNase-seq para mapeamento de nucleossomos e RNA-seq para perfilagem do transcriptoma. Estudos envolvendo as células GM12878 esclareceram aspectos das interações dos fatores de transcrição, como a ligação do FOXM1 e de seus cofatores, e seus papéis nas vias do ciclo celular e da resposta imunológica.

Além disso, o GM12878 tem servido como plataforma para experimentos de edição genômica com o objetivo de criar materiais de referência para validação de sequenciamento de última geração (NGS). Por exemplo, modificações genômicas mediadas por CRISPR/Cas9 foram introduzidas no GM12878 para desenvolver materiais de controle para a análise de mutações oncológicas, ilustrando sua aplicação na medicina de precisão e nos testes genéticos.

Tissue
Sangue periférico
Synonyms
  • GM-12878

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Suspension
Biosafety level
2

03Characteristics

Morphology
Do tipo linfoblasto

04Identifiers

Citation
GM12878 (número de catálogo da Cytion 305439)
NCBI TaxID
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expression and susceptibility

Mutational profile
Mutação: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Viruses
Transformante: vírus de Epstein-Barr (EBV)

06Handling and culture

Culture medium
RPMI 1640, com 2,0 mM de glutamina estável e 2,0 g/L de NaHCO₃ (número de artigo da Cytion: 820700a)
Incubation atmosphere

37 °C, 5% de CO₂, atmosfera umidificada.

Supplements
Adicione 15% de FBS ao meio
Subculturing
Mantenha as culturas adicionando ou substituindo periodicamente o meio. Inicie as culturas com uma densidade de 5 x 10⁵ células/ml e mantenha a concentração celular dentro do intervalo de 3 x 10⁵ a 1 x 10⁶ células/ml para um crescimento ideal.
Post-thaw recovery
Após a descongelamento, deixe as células se recuperarem do processo de congelamento por pelo menos 24 horas
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

A contaminação por micoplasma é descartada por meio de ensaios baseados em PCR e de métodos de detecção de micoplasma baseados em luminescência.

Para garantir que não haja contaminação por bactérias, fungos ou leveduras, as culturas celulares são submetidas a inspeções visuais diárias.

Freeze medium
Como meio de criopreservação, utilizamos meio de crescimento completo (incluindo FBS) + 10% de DMSO para garantir viabilidade adequada após o descongelamento, ou CM-1 (número de catálogo da Cytion 800100), que inclui osmoprotetores e estabilizadores metabólicos otimizados para melhorar a recuperação e reduzir o estresse induzido pela criopreservação.
Storage conditions

Para preservação a longo prazo, coloque os frascos em nitrogênio líquido em fase de vapor a uma temperatura entre aproximadamente −150 e −196 °C. O armazenamento a −80 °C é aceitável apenas como uma etapa intermediária de curta duração antes da transferência para o nitrogênio líquido.

Shipping conditions

As linhagens celulares criopreservadas são enviadas em gelo seco, em embalagens isoladas e validadas, com refrigerante suficiente para manter a temperatura em aproximadamente −78 °C durante todo o transporte. Ao receber a remessa, inspecione o recipiente imediatamente e transfira os frascos sem demora para o local de armazenamento adequado.

08Donor

Donor age
Não especificado