Mine otse sisu juurde
GM12878
Kude
Perifeerne veri
Sünonüümid
GM-12878

Dokumendid

GM12878

Cell line · Toote number 305439

Rakuliin GM12878 on hästi iseloomustatud inimese lümfoblastoidne rakuliin, mis on transformeeritud Epstein-Barr-viirusega (EBV). Seda on kasutatud standardina Ti...

€550.00ilma käibemaksu ja saatmiskuludeta
Laos
Lot
Soovitatav (värskeim partii)
  • CoA
  • CoA
1

01Üldine teave

Kirjeldus

GM12878 rakuliin on hästi iseloomustatud inimese lümfoblastoidne rakuliin, mis on transformeeritud Epstein-Barri viirusega (EBV). Seda on kasutatud standardse 1. taseme rakuliinina DNA-elementide entsüklopeedia (ENCODE) projektis, mis teeb sellest ühe kõige laialdasemalt uuritud mudeli geneetilisteks ja transkriptoomilisteks uuringuteks. GM12878 pärineb naissoost doonorilt ja on tuntud oma stabiilse karüotüübi poolest võrreldes sagedamini kasutatavate rakuliinidega, nagu HeLa ja HEK293, millel on ulatuslik kromosoomide aneuploidsus.

Need rakud on eriti väärtuslikud kromatiini struktuuri, geeniregulatsiooni ja immuunvastuse mõistmiseks nende B-lümfotsüütide liini tõttu. GM12878 rakke on kasutatud kõrge läbilaskevõimega uuringutes, sealhulgas ChIP-seq analüüsid transkriptsioonifaktorite seondumiskohtade ja histoonmodifikatsioonide kaardistamiseks, MNase-seq nukleosoomide kaardistamiseks ja RNA-seq transkriptoomi profiilide koostamiseks. GM12878 uuringutes on selgitatud transkriptsioonifaktorite koostoimete aspekte, näiteks FOXM1 ja selle kaasfaktoritega seondumist ning nende rolli rakutsüklis ja immuunreaktsiooniradadel.

Lisaks on GM12878 olnud platvormiks genoomi redigeerimise katsetele, mille eesmärk on luua võrdlusmaterjalid järgmise põlvkonna sekveneerimise (NGS) valideerimiseks. Näiteks CRISPR/Cas9-vahendatud genoomimuudatused on viidud GM12878-sse, et töötada välja kontrollmaterjalid vähimutatatsioonide analüüsiks, mis illustreerib selle kasutamist täppismeditsiinis ja geneetilistes testides.

Kude
Perifeerne veri
Sünonüümid
  • GM-12878

02Klassifikatsioon

Organism
Inimene
Sugu
Naine
Kasvuvõime
Vedrustus
Bioloogilise ohutuse tase
2

03Omadused

Morfoloogia
Lümfoblastilaadsed

04Tunnused

Viide
GM12878 (Cytioni katalooginumber 305439)
NCBI maksukood
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Avaldumine ja vastuvõtlikkus

Mutatsiooniprofiil
Mutatsioon: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Viirused
Transformant: Epstein-Barri viirus (EBV)

06Käsitlemine ja kasvatamine

Kasvatuskeskkond
RPMI 1640, w: 2,0 mM stabiilne glutamiin, w: 2,0 g/L NaHCO3 (Cytioni artikli number 820700a)
Inkubatsiooni keskkond

37°C, 5%CO2, niisutatud atmosfäär.

Toidulisandid
Täiendada keskkonda 15% FBS-ga
Kultuuri edasikasvatamine
Säilitage kultuure, lisades või asendades perioodiliselt kasvukeskkonda. Alustage kultuuride kasvatamist tihedusega 5 x 105 rakku/ml ja hoidke rakkude kontsentratsioon vahemikus 3 x 105 kuni 1 x 106 rakku/ml optimaalse kasvu tagamiseks.
Taastumine pärast sulamist
Pärast sulatamist laske rakkudel vähemalt 24 tundi külmutusprotsessist taastuda
Sulatamine ja kasvatamine
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kvaliteedikontroll ja krüokonserveerimine

Viljatus

Mükoplasmakontaminatsioon on välistatud nii PCR-põhiste analüüside kui ka luminestsentsil põhinevate mükoplasma tuvastamise meetodite abil.

Bakteriaalse, seene- või pärmsaaste puudumise tagamiseks kontrollitakse rakukultuure iga päev visuaalselt.

Külmutuskeskkond
Krüosäilitusvedelikusena kasutame täielikku kasvukeskkonda (sh FBS) + 10% DMSO, et tagada piisav elujõulisus pärast sulatamist, või CM-1 (Cytioni katalooginumber 800100), mis sisaldab optimeeritud osmoprotektante ja metaboolseid stabilisaatoreid, et parandada taastumist ja vähendada krüostressi.
Säilitamistingimused

Pikaajaliseks säilitamiseks asetage viaalid aurufaasis vedela lämmastikuga umbes -150 kuni -196 °C juures. Säilitamine temperatuuril -80 °C on vastuvõetav ainult lühikese vaheetapina enne vedela lämmastikuga üleviimist.

Tarne- ja kohaletoimetamistingimused

Krüokonserveeritud rakuliinid transporditakse kuiva jääga valideeritud, isoleeritud pakendis, milles on piisavalt külmutusainet, et säilitada kogu transpordi jooksul ligikaudu -78 °C. Vastuvõtmisel kontrollige konteinerit kohe ja viige viaalid viivitamatult sobivasse hoiuruumi.

08Annetaja

Doonori vanus
Täpsustamata