Przejdź do treści
GM12878
Chusteczka
Krew obwodowa
Synonimy
GM-12878

Dokumenty

GM12878

Cell line · Numer produktu 305439

Linia komórkowa GM12878 to dobrze scharakteryzowana ludzka linia komórek limfoblastycznych, transformowana wirusem Epsteina-Barra (EBV). Jest ona wykorzystywana jako standardowa Ti...

€550.00bez podatku i kosztów wysyłki
W magazynie
Lot
Polecane (najświeższa partia)
  • CoA
  • CoA
1

01Informacje ogólne

Opis

Linia komórkowa GM12878 jest dobrze scharakteryzowaną ludzką linią komórek limfoblastoidalnych, transformowaną wirusem Epsteina-Barr (EBV). Została ona wykorzystana jako standardowa linia komórkowa poziomu 1 w projekcie Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE), co czyni ją jednym z najczęściej badanych modeli do badań genetycznych i transkryptomicznych. Pochodząca od żeńskiego dawcy, GM12878 jest znana ze swojego stabilnego kariotypu w porównaniu z częściej stosowanymi liniami komórkowymi, takimi jak HeLa i HEK293, które mają rozległą aneuploidię chromosomalną.

Komórki te są szczególnie cenne dla zrozumienia struktury chromatyny, regulacji genów i odpowiedzi immunologicznej ze względu na ich linię limfocytów B. Komórki GM12878 zostały wykorzystane w badaniach o wysokiej przepustowości, w tym w analizach ChIP-seq do mapowania miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych i modyfikacji histonów, MNase-seq do mapowania nukleosomów oraz RNA-seq do profilowania transkryptomu. Badania z udziałem GM12878 pozwoliły wyjaśnić aspekty interakcji czynników transkrypcyjnych, takie jak wiązanie FOXM1 i jego kofaktorów oraz ich rolę w cyklu komórkowym i szlakach odpowiedzi immunologicznej.

Ponadto GM12878 posłużył jako platforma do eksperymentów edycji genomu mających na celu stworzenie materiałów referencyjnych do walidacji sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Na przykład, modyfikacje genomu za pośrednictwem CRISPR/Cas9 zostały wprowadzone do GM12878 w celu opracowania materiałów kontrolnych do analizy mutacji nowotworowych, ilustrując jego zastosowanie w medycynie precyzyjnej i testach genetycznych.

Chusteczka
Krew obwodowa
Synonimy
  • GM-12878

02Klasyfikacja

Organizm
Człowiek
Seks
Kobieta
Właściwości związane ze wzrostem
Zawieszenie
Poziom bezpieczeństwa biologicznego
2

03Cechy charakterystyczne

Morfologia
Podobne do limfoblastów

04Identyfikatory

Źródło
GM12878 (numer katalogowy Cytion 305439)
Numer identyfikacji podatkowej NCBI
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Ekspresja i podatność

Profil mutacji
Mutacja: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Wirusy
Transformant: Wirus Epsteina-Barr (EBV)

06Postępowanie i hodowla

Pożywka hodowlana
RPMI 1640, w: 2,0 mM stabilnej glutaminy, w: 2,0 g/L NaHCO3 (numer artykułu Cytion 820700a)
Atmosfera inkubacyjna

37°C, 5%CO2, nawilżona atmosfera.

Suplementy
Uzupełnić podłoże 15% FBS
Hodowla komórek w subkulturze
Kultury należy utrzymywać poprzez okresowe dodawanie lub wymianę pożywki. Kultury należy rozpocząć od gęstości 5 x 105 komórek/ml i utrzymywać stężenie komórek w zakresie od 3 x 105 do 1 x 106 komórek/ml, aby zapewnić optymalny wzrost.
Powrót do stanu sprzed rozmrożenia
Po rozmrożeniu należy pozwolić komórkom odzyskać sprawność po procesie zamrażania przez co najmniej 24 godziny
Rozmrażanie i hodowla
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kontrola jakości i kriokonserwacja

Bezpłodność

Zanieczyszczenie mykoplazmą jest wykluczane przy użyciu zarówno testów opartych na PCR, jak i metod wykrywania mykoplazmy opartych na luminescencji.

Aby upewnić się, że nie ma zanieczyszczenia bakteriami, grzybami lub drożdżami, hodowle komórkowe są poddawane codziennym kontrolom wizualnym.

Pożywka do zamrażania
Jako pożywki do kriokonserwacji używamy kompletnej pożywki wzrostowej (w tym FBS) + 10% DMSO w celu zapewnienia odpowiedniej żywotności po rozmrożeniu lub CM-1 (numer katalogowy Cytion 800100), która zawiera zoptymalizowane osmoprotektanty i stabilizatory metaboliczne w celu zwiększenia regeneracji i zmniejszenia stresu wywołanego kriokonserwacją.
Warunki przechowywania

W celu długotrwałego przechowywania należy umieścić fiolki w ciekłym azocie w fazie lotnej w temperaturze od -150 do -196 °C. Przechowywanie w temperaturze -80 °C jest dopuszczalne tylko jako krótki etap przejściowy przed przeniesieniem do ciekłego azotu.

Warunki wysyłki

Linie komórkowe poddane kriokonserwacji są wysyłane w suchym lodzie w zatwierdzonych, izolowanych opakowaniach z wystarczającą ilością czynnika chłodniczego, aby utrzymać temperaturę około -78°C przez cały czas transportu. Po otrzymaniu przesyłki należy natychmiast sprawdzić pojemnik i bezzwłocznie przenieść fiolki do odpowiedniego miejsca przechowywania.

08Darczyńca

Wiek dawcy
Nieokreślony