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GM12878
Tecido
Sangue periférico
Sinónimos
GM-12878

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GM12878

Cell line · Número do produto 305439

A linha celular GM12878 é uma linha celular linfoblastoide humana bem caracterizada, transformada pelo vírus de Epstein-Barr (EBV). Tem sido utilizada como padrão de referência...

€550.00sem impostos nem portes de envio

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01Informações gerais

Descrição

A linha celular GM12878 é uma linha celular linfoblastóide humana bem caracterizada, transformada com o vírus Epstein-Barr (EBV). Foi utilizada como linha celular padrão de nível 1 no projeto Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE), o que a torna um dos modelos mais amplamente estudados para a investigação genética e transcriptómica. Proveniente de um dador do sexo feminino, a GM12878 é conhecida pelo seu cariótipo estável em comparação com as linhas celulares mais utilizadas, como a HeLa e a HEK293, que apresentam uma aneuploidia cromossómica extensa.

Estas células são particularmente valiosas para compreender a estrutura da cromatina, a regulação dos genes e a resposta imunitária devido à sua linhagem de linfócitos B. As células GM12878 foram utilizadas em estudos de elevado rendimento, incluindo análises ChIP-seq para mapear os locais de ligação dos factores de transcrição e as modificações das histonas, MNase-seq para mapear os nucleossomas e RNA-seq para caraterizar o transcriptoma. Os estudos com o GM12878 elucidaram aspectos das interações dos factores de transcrição, como a ligação do FOXM1 e dos seus co-factores, e os seus papéis no ciclo celular e nas vias de resposta imunitária.

Além disso, a GM12878 serviu de plataforma para experiências de edição do genoma destinadas a criar materiais de referência para a validação da sequenciação de nova geração (NGS). Por exemplo, as modificações do genoma mediadas por CRISPR/Cas9 foram introduzidas na GM12878 para desenvolver materiais de controlo para a análise de mutações no cancro, ilustrando a sua aplicação na medicina de precisão e nos testes genéticos.

Tecido
Sangue periférico
Sinónimos
  • GM-12878

02Classificação

Organismo
Humano
Sexo
Feminino
Propriedades de crescimento
Suspensão
Nível de biossegurança
2

03Características

Morfologia
Tipo linfoblasto

04Identificadores

Referência
GM12878 (número de catálogo Cytion 305439)
Número de identificação fiscal do NCBI
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Expressão e suscetibilidade

Perfil mutacional
Mutação: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Vírus
Transformante: Vírus Epstein-Barr (EBV)

06Manuseamento e cultura

Meio de cultura
RPMI 1640, com: 2,0 mM de glutamina estável, com: 2,0 g/L NaHCO3 (número de artigo Cytion 820700a)
Atmosfera de incubação

37°C, 5%CO2, atmosfera humidificada.

Suplementos
Completar o meio com 15% de FBS
Subcultura
Mantenha as culturas adicionando ou substituindo periodicamente o meio. Inicie as culturas com uma densidade de 5 x 105 células/ml e mantenha a concentração celular dentro da faixa de 3 x 105 a 1 x 106 células/ml para um crescimento ideal.
Recuperação após o descongelamento
Após a descongelação, deixar as células recuperarem do processo de congelação durante pelo menos 24 horas
Descongelamento e cultura
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Controlo de qualidade e criopreservação

Esterilidade

A contaminação por micoplasma é excluída utilizando ensaios baseados em PCR e métodos de deteção de micoplasma baseados em luminescência.

Para garantir que não há contaminação bacteriana, fúngica ou de leveduras, as culturas de células são sujeitas a inspecções visuais diárias.

Meio de congelação
Como meio de criopreservação, utilizamos um meio de crescimento completo (incluindo FBS) + 10% DMSO para uma viabilidade pós-descongelamento adequada, ou CM-1 (número de catálogo Cytion 800100), que inclui osmoprotectores optimizados e estabilizadores metabólicos para melhorar a recuperação e reduzir o stress induzido pela crio.
Condições de armazenamento

Para conservação a longo prazo, colocar os frascos em azoto líquido em fase de vapor a uma temperatura entre -150 e -196 °C. O armazenamento a -80 °C é aceitável apenas como um curto passo intermédio antes da transferência para azoto líquido.

Condições de envio

As linhas celulares criopreservadas são expedidas em gelo seco em embalagens validadas e isoladas com refrigerante suficiente para manter aproximadamente -78 °C durante o transporte. Aquando da receção, inspecionar imediatamente o recipiente e transferir sem demora os frascos para um local de armazenamento adequado.

08Doador

Idade do dador
Não especificado