01General information
- Description
La línea celular GM12878 es una línea celular linfoblastoide humana bien caracterizada, transformada con el virus de Epstein-Barr (VEB). Se ha utilizado como línea celular estándar de Nivel 1 en el proyecto Enciclopedia de Elementos de ADN (ENCODE), lo que la convierte en uno de los modelos más estudiados para la investigación genética y transcriptómica. Originaria de una donante femenina, la GM12878 es conocida por su cariotipo estable en comparación con líneas celulares más comúnmente utilizadas, como HeLa y HEK293, que presentan una aneuploidía cromosómica extensa.
Estas células son particularmente valiosas para comprender la estructura de la cromatina, la regulación génica y la respuesta inmunitaria debido a su linaje de linfocitos B. Las células GM12878 se han empleado en estudios de alto rendimiento, incluyendo análisis ChIP-seq para mapear los sitios de unión de los factores de transcripción y las modificaciones de histonas, MNase-seq para el mapeo de nucleosomas y RNA-seq para la elaboración de perfiles transcriptómicos. Los estudios con GM12878 han esclarecido aspectos de las interacciones de los factores de transcripción, como la unión de FOXM1 y sus cofactores, así como sus funciones en el ciclo celular y las vías de respuesta inmunitaria.
Además, la línea GM12878 ha servido como plataforma para experimentos de edición genómica destinados a crear materiales de referencia para la validación de la secuenciación de próxima generación (NGS). Por ejemplo, se han introducido modificaciones genómicas mediadas por CRISPR/Cas9 en la cepa GM12878 para desarrollar materiales de control para el análisis de mutaciones cancerosas, lo que ilustra su aplicación en la medicina de precisión y las pruebas genéticas.
- Tissue
- Sangre periférica
- Synonyms
- GM-12878
02Classification
- Organism
- Human
- Sex
- Female
- Growth properties
- Suspension
- Biosafety level
- 2
03Characteristics
- Morphology
- De tipo linfoblástico
04Identifiers
- Citation
- GM12878 (número de catálogo de Cytion 305439)
- NCBI TaxID
- 9606
- Cellosaurus
- CVCL_7526
05Expression and susceptibility
- Mutational profile
- Mutación: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
- Viruses
- Transformante: virus de Epstein-Barr (VEB)
06Handling and culture
- Culture medium
- RPMI 1640, con 2,0 mM de glutamina estable y 2,0 g/L de NaHCO₃ (número de artículo de Cytion: 820700a)
- Incubation atmosphere
37 °C, 5 % de CO₂, atmósfera humidificada.
- Supplements
- Añade al medio un 15 % de FBS
- Subculturing
- Mantenga los cultivos agregando o reemplazando el medio periódicamente. Inicie los cultivos con una densidad de 5 × 10⁵ células/ml y mantenga la concentración celular dentro del rango de 3 × 10⁵ a 1 × 10⁶ células/ml para lograr un crecimiento óptimo.
- Post-thaw recovery
- Después de descongelarlas, deja que las células se recuperen del proceso de congelación durante al menos 24 horas
- Thawing and culturing
Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.
Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.
For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.
Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.
Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.
Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.
Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.
Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.
07Quality control and cryopreservation
- Sterility
Se descarta la contaminación por micoplasmas mediante ensayos basados en PCR y métodos de detección de micoplasmas basados en luminiscencia.
Para garantizar que no haya contaminación bacteriana, fúngica o por levaduras, los cultivos celulares se someten a inspecciones visuales diarias.
- Freeze medium
- Como medio de criopreservación, utilizamos un medio de crecimiento completo (que incluye FBS) + 10 % de DMSO para garantizar una viabilidad adecuada tras la descongelación, o CM-1 (número de catálogo de Cytion 800100), que incluye osmoprotectores y estabilizadores metabólicos optimizados para mejorar la recuperación y reducir el estrés inducido por la criopreservación.
- Storage conditions
Para la conservación a largo plazo, coloque los viales en nitrógeno líquido en fase de vapor a una temperatura de entre −150 y −196 °C, aproximadamente. El almacenamiento a −80 °C solo es aceptable como un paso intermedio breve antes de transferirlos al nitrógeno líquido.
- Shipping conditions
Las líneas celulares criopreservadas se envían en hielo seco, en un embalaje aislante validado que contiene suficiente refrigerante para mantener una temperatura de aproximadamente −78 °C durante todo el transporte. Al recibir el envío, revise el contenedor de inmediato y traslade los viales sin demora al lugar de almacenamiento adecuado.
08Donor
- Donor age
- Sin especificar
09Legal and safety
- Safety precautions
- Cuando se planea almacenar un criovial en nitrógeno líquido para su descongelación futura, es obligatorio cumplir con estrictas medidas de seguridad. Es esencial contar con guantes y ropa de protección adecuados, y se requiere el uso de una mascarilla o lentes de seguridad durante la transferencia de muestras congeladas hacia o desde el tanque de nitrógeno líquido. Esto tiene como objetivo mitigar el riesgo de lesiones por posibles explosiones de los criotubos al retirarlos, lo que puede provocar la proyección de fragmentos afilados.
- Warranty
En Cytion, respaldamos la calidad y la viabilidad de nuestros productos. Garantizamos que nuestras células serán viables al inicio del cultivo durante 60 días a partir de la fecha de envío desde nuestras instalaciones. Aseguramos que todos los materiales cumplen con las especificaciones descritas en el Certificado de Análisis y/o la Ficha del Producto.
Para obtener más detalles, consulte nuestra Declaración de garantía.
- Material Transfer Agreement required
- Yes
