Siirry sisältöön
GM12878
Kudos
Perifeerinen veri
Synonyymit
GM-12878

Asiakirjat

GM12878

Cell line · Tuotenumero 305439

GM12878-solulinja on hyvin karakterisoitu ihmisen lymfoblastoidinen solulinja, joka on transformoitu Epstein-Barr-viruksella (EBV). Sitä on käytetty standardina Ti...

€550.00ilman veroja ja toimituskuluja
Varastossa
Lot
Suositeltava (tuorein erä)
  • CoA
  • CoA
1

01Yleistä tietoa

Kuvaus

GM12878-solulinja on hyvin karakterisoitu ihmisen lymfoblastoidinen solulinja, joka on muunnettu Epstein-Barr-viruksella (EBV). Sitä on käytetty ENCODE-hankkeessa (Encyclopedia of DNA Elements) vakiotason 1 solulinjana, mikä tekee siitä yhden laajimmin tutkituista malleista geneettisessä ja transkriptomitutkimuksessa. GM12878 on peräisin naispuoliselta luovuttajalta, ja se tunnetaan vakaasta karyotyypistään verrattuna yleisimmin käytettyihin solulinjoihin, kuten HeLa ja HEK293, joilla on laaja kromosomianeuploidia.

Nämä solut ovat erityisen arvokkaita kromatiinin rakenteen, geenien säätelyn ja immuunivasteen ymmärtämisessä, koska ne ovat B-lymfosyyttilinjaa. GM12878-soluja on käytetty korkean läpimenon tutkimuksissa, kuten ChIP-seq-analyyseissä transkriptiotekijöiden sitoutumiskohtien ja histonimodifikaatioiden kartoittamiseksi, MNase-seq:ssä nukleosomien kartoittamiseksi ja RNA-seq:ssä transkriptomiprofiilien määrittämiseksi. GM12878:lla tehdyissä tutkimuksissa on selvitetty transkriptiotekijöiden vuorovaikutuksen näkökohtia, kuten FOXM1:n ja sen kofaktorien sitoutumista, sekä niiden roolia solusyklissä ja immuunivasteiden reiteissä.

Lisäksi GM12878 on toiminut alustana genomin muokkauskokeille, joiden tarkoituksena on luoda vertailumateriaaleja seuraavan sukupolven sekvensoinnin (NGS) validointia varten. GM12878:aan on esimerkiksi tehty CRISPR/Cas9-välitteisiä genomimuutoksia syövän mutaatioanalyysejä varten tarkoitettujen vertailumateriaalien kehittämiseksi, mikä osoittaa sen sovellettavuuden täsmälääketieteessä ja geneettisessä testauksessa.

Kudos
Perifeerinen veri
Synonyymit
  • GM-12878

02Luokittelu

Organismi
Ihminen
Sukupuoli
Nainen
Kasvuominaisuudet
Jousitus
Bioturvallisuustaso
2

03Ominaisuudet

Morfologia
Lymfoblastien kaltaiset

04Tunnisteet

Lähdeviite
GM12878 (Cytionin luettelonumero 305439)
NCBI-verotunnus
9606
Cellosaurus
CVCL_7526

05Ilmentyminen ja alttius

Mutaatioprofiili
Mutaatio: CYP2C19, p.Pro227Pro (c.681G>A)
Virukset
Muuntaja: Epstein-Barr-virus (EBV)

06Käsittely ja viljely

Viljelyalusta
RPMI 1640, w: 2,0 mM stabiilia glutamiinia, w: 2,0 g/L NaHCO3 (Cytionin artikkelinumero 820700a)
Inkubaatioilma

37 °C, 5 %CO2, kostutettu ilmakehä.

Ravintolisät
Täydennetään elatusainetta 15 %:lla FBS:llä
Soluviljely
Ylläpidä viljelmiä lisäämällä tai vaihtamalla kasvualusta säännöllisesti. Aloita viljelyt tiheydellä 5 x 105 solua/ml ja pidä solupitoisuus välillä 3 x 105 – 1 x 106 solua/ml optimaalisen kasvun saavuttamiseksi.
Sulamisen jälkeinen palautuminen
Sulatuksen jälkeen solujen annetaan palautua pakastuksesta vähintään 24 tuntia
Sulatus ja viljely
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Laadunvalvonta ja kryosäilytys

Hedelmättömyys

Mykoplasmakontaminaatio suljetaan pois sekä PCR-pohjaisilla määrityksillä että luminesenssiin perustuvilla mykoplasman osoitusmenetelmillä.

Bakteeri-, sieni- tai hiivakontaminaation välttämiseksi soluviljelmät tarkastetaan päivittäin silmämääräisesti.

Jäädytysaine
Kryosäilytysmediana käytämme täydellistä kasvualustaa (mukaan lukien FBS) + 10 % DMSO:ta riittävän sulatuksen jälkeisen elinkelpoisuuden varmistamiseksi tai CM-1:tä (Cytionin luettelonumero 800100), joka sisältää optimoituja osmoprotectantteja ja metabolisia stabilisaattoreita, jotka parantavat elpymistä ja vähentävät kryosäilytyksen aiheuttamaa stressiä.
Säilytysolosuhteet

Pitkäaikaissäilytystä varten injektiopullot asetetaan höyryfaasissa olevaan nestemäiseen typpeen noin -150 - -196 °C:een. Säilytys -80 °C:ssa on hyväksyttävää vain lyhyenä välivaiheena ennen siirtoa nestemäiseen typpeen.

Toimitusehdot

Kryosäilytetyt solulinjat kuljetetaan kuivajäässä validoidussa, eristetyssä pakkauksessa, jossa on riittävästi kylmäainetta, jotta lämpötila pysyy noin -78 °C:ssa koko kuljetuksen ajan. Pakkaus on tarkastettava välittömästi sen vastaanottamisen jälkeen ja injektiopullot on siirrettävä viipymättä asianmukaiseen varastoon.

08Lahjoittaja

Luovuttajan ikä
Määrittelemätön