Skip to content
NCI-H1299-RFP 细胞
Tissue
肺部
Disease
大细胞癌
Metastatic site
原发肿瘤部位(肺)

Documents

NCI-H1299-RFP 细胞

Cell line · Product number 300272

The NCI-H1299 RFP cells, modified to include a reporter in the DAPK1 gene, are not only useful for studying specific gene activation but also provide a br...

US$800.00excl. tax and shipping
In stock
Lot
Recommended (freshest lot)
1

01General information

Description

经过改造的NCI-H1299 RFP细胞含有DAPK1基因的报告基因,它不仅有助于研究特定基因的激活,还能更广泛地了解细胞对表观遗传药物的整体反应。通过使用一种名为基因表达上限分析(CAGE)的技术,研究人员能够详细了解基因组中转录起始位置在DNMTi(DAC)、HDACi(SAHA或SB939)或它们的组合治疗后的变化。这种方法不仅揭示了 DAPK1 基因预期的重新激活,而且还发现了新的转录起始位点,即治疗诱导的非注释 TSS(TINAT),尤其是在药物治疗的情况下。这些新的转录起始位点通常位于基因组中通常不产生蛋白质的区域,从而产生了可能编码蛋白质的新 RNA 分子。

进一步分析表明,这些新的 RNA 分子有时会与现有的 RNA 分子合并,形成所谓的 TINAT 外显子融合转录本。根据这些转录本的拼接方式,它们可以转化为新的非典型蛋白质。这一过程已通过实验室技术得到证实,证明这些转录本确实可以产生新的蛋白质形式。这些蛋白质可能会在细胞内发生异常相互作用,或被免疫系统识别为异物,从而有可能成为癌症治疗的新靶点。

这些 TINATs 的激活涉及 DNA 甲基化和组蛋白修饰的复杂变化,说明在药物治疗过程中这些表观遗传因素之间存在复杂的相互作用。特别是,联合使用 DAC 和 SB939 会产生更大的效果,比单独使用其中一种药物更能促进这些新转录本的表达。了解这些相互作用及其结果有助于阐明表观遗传疗法是如何改变细胞行为的,并为利用这些复杂的分子变化进行新的癌症治疗提供了可能性。

Tissue
肺部
Disease
大细胞癌
Metastatic site
原发肿瘤部位(肺)
Applications
表观遗传疗法研究;DAPK1基因重新激活;DNMTi和HDACi药物反应研究;治疗诱导的非注释转录起始位点(TINATs);CAGE转录组学;融合转录本分析;来自隐性启动子的非典型蛋白质合成;表观遗传药物联合用药筛选

02Classification

Organism
Human
Growth properties
Adherent
GMO status
GMO-S1
GMO status details
GMO-S1: This NCI-H1299 derivative (DKFZ #P-1045) contains a stably silenced EGFP reporter in the DAPK1 locus enabling epigenetic reactivation readout. G418-resistance cassette present. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Biosafety level
1

03Characteristics

Morphology
上皮样
Cell type
上皮细胞
Doubling time
约24至36小时

04Identifiers

Citation
NCI-H1299-EGFP,具有G418抗性及沉默报告基因(DKFZ # P-1045)(Cytion货号 300272)
NCBI TaxID
9606
Cellosaurus
CVCL_XB25

05Handling and culture

Culture medium
RPMI 1640,w:2.0 mM 稳定谷氨酰胺,w:2.0 g/L NaHCO3(Cytion 文章编号 820700a)。
Incubation atmosphere

37°C, 5%CO2, 加湿环境。

Supplements
在培养基中添加 10% FBS
Dissociation reagent
Accutase
Subculturing
去除粘附细胞上的旧培养基,用不含钙和镁的 PBS 冲洗。T25 烧瓶用 3-5 毫升 PBS,T75 烧瓶用 5-10 毫升。然后用 Accutase 完全覆盖细胞,T25 烧瓶用 1-2 毫升,T75 烧瓶用 2.5 毫升。让细胞在室温下孵育 8-10 分钟,使其分离。孵育后,用 10 毫升培养基轻轻混合细胞使其重悬,然后用 300xg 离心 3 分钟。弃去上清液,用新鲜培养基重悬细胞,并将其转移到已装有新鲜培养基的新烧瓶中。
Split ratio
1 到 5
Seeding density
1 至 3 × 10⁴ 个细胞/cm²
Fluid renewal
每周 2 至 3 次
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

06Quality control and cryopreservation

Sterility

使用基于 PCR 的检测方法和基于发光的支原体检测方法排除支原体污染。

为确保没有细菌、真菌或酵母菌污染,每天都要对细胞培养物进行目视检查。

Freeze medium
我们使用完全生长培养基(包括 FBS)+10% DMSO 或 CM-1(Cytion 商品目录编号 800100)作为冷冻保存培养基,以获得足够的解冻后存活率,CM-1(Cytion 商品目录编号 800100)含有优化的渗透保护剂和代谢稳定剂,可提高恢复能力并减少冷冻引起的应激。
Storage conditions

如需长期保存,可将样品瓶放入气相液氮中,温度约为 -150 至 -196 ℃。在-80 °C下保存只能作为转入液氮前的短暂过渡。

Shipping conditions

冷冻保存的细胞系用干冰装运,并用经过验证的隔热包装和足够的制冷剂在整个运输过程中保持约 -78 °C 的温度。收到货后,应立即检查容器,并立即将小瓶转移到适当的储藏室。