Pendahuluan

Sel Ba/F3, yang juga dikenal dengan nama lain BA/F3, BaF3, BAF3, dan Baf3 (nomor akses Cellosaurus CVCL_0161), merupakan garis sel pro-B tikus yang bergantung pada interleukin-3 (IL-3) dan berasal dari sumsum tulang. Garis sel ini pertama kali dijelaskan oleh Palacios dan Steinmetz pada tahun 1985 sebagai bagian dari sekelompok klon sumsum tulang yang terus-menerus berkembang biak dan bergantung pada IL-3, yang membawa penanda garis keturunan sel B B-220 serta mempertahankan gen imunoglobulinnya dalam konfigurasi garis keturunan. ^[19] Awalnya dilaporkan berasal dari tikus BALB/c, namun hasil profilasi SNP array selanjutnya menunjukkan bahwa garis keturunan tersebut sebenarnya berasal dari tikus C3H. ^[1] Sejak dikembangkan, sel Ba/F3 telah menjadi salah satu sistem model yang paling banyak digunakan dalam penelitian sinyal hematopoietik dan penemuan obat onkologi. Ketergantungan sel-sel ini yang sangat ketat pada IL-3 untuk kelangsungan hidup dan proliferasi menjadikannya platform yang sangat murni: pengenalan kinase onkogenik atau protein fusi membuat sel-sel tersebut tidak lagi bergantung pada faktor tersebut, sehingga memberikan hasil yang kuat dan dapat diukur. Para peneliti secara rutin memanfaatkan sifat ini untuk mengkarakterisasi protein fusi BCR-ABL, mutasi FLT3, fusi JAK2, dan banyak onkogen kinase lain yang relevan secara klinis, serta untuk memprofilkan inhibitor kinase molekul kecil dalam format berkapasitas tinggi.

Poin-Poin Penting

• Ba/F3 adalah garis sel pro-B tikus yang bergantung pada IL-3, yang berasal dari sumsum tulang tikus C3H, dan terdaftar di Cellosaurus dengan nomor akses CVCL_0161.
• Penghentian IL-3 menghasilkan uji seleksi yang ketat: sel induk mati, sedangkan sel yang mengekspresikan kinase onkogenik aktif — atau konstruksi lain apa pun yang memberikan sinyal pertumbuhan konstitutif — bertahan hidup dan berkembang biak.
• Garis sel ini telah banyak digunakan untuk mempelajari protein fusi BCR-ABL, mutasi FLT3, jalur sinyal JAK–STAT, dan biologi reseptor sitokin.
• Sel Ba/F3 semakin banyak digunakan dalam penyaringan inhibitor kinase berkapasitas tinggi, sehingga menjadikannya salah satu pilar utama dalam penemuan obat kanker bertarget. ^[2]
• Ratusan garis sel turunan yang membawa mutasi onkogenik tertentu telah dihasilkan dari sel Ba/F3, yang mencakup EGFR, ALK, ROS1, RET, NTRK, FLT3, dan banyak target lain yang relevan secara klinis.

Apa itu Ba/F₃?

Ba/F3 adalah garis sel pro-B murin yang bergantung pada faktor, yang diisolasi dari sumsum tulang tikus C3H; jenis kelamin dan usia donor tidak tercatat dalam data Cellosaurus untuk garis sel ini. Lini induk tidak memiliki mutasi kinase pengaktif yang diketahui dan memerlukan IL-3 eksogen untuk bertahan hidup. Waktu penggandaan selnya sekitar 20 jam dalam kondisi kultur standar. Karakteristik utama yang menjadi ciri khas lini ini adalah ketergantungannya yang ketat pada IL-3, yang berarti bahwa manipulasi genetik apa pun yang menyebabkan pertumbuhan yang tidak bergantung pada faktor dapat dideteksi dengan cepat dan jelas. Sifat ini, dikombinasikan dengan tidak adanya mutasi kinase endogen yang mengganggu, telah menjadikan sel Ba/F3 sebagai alat yang tak tergantikan untuk menganalisis potensi onkogenik dari fusi kinase, mutasi titik, dan molekul sinyal yang aktif secara konstitutif dalam biologi tumor hematopoietik dan tumor padat. Perlu dicatat bahwa tidak adanya anotasi mutasi tidak sama dengan latar belakang genetik yang murni: Cellosaurus juga mencatat data variasi yang diperoleh dari SNP array untuk garis sel ini.

Profiling menggunakan SNP array telah memperbaiki kesalahan identifikasi asal-usul garis keturunan ini yang telah berlangsung lama. Literatur awal menyebutkan bahwa Ba/F3 berasal dari tikus BALB/c, namun analisis genomik menegaskan bahwa garis keturunan ini berasal dari C3H. ^[1] Dari 99 garis sel tikus yang diteliti dalam studi tersebut, Ba/F3 adalah satu-satunya garis sel yang latar belakang genetiknya tidak sesuai dengan strain asal yang dilaporkan; perbedaan tersebut dikonfirmasi secara independen oleh RIKEN, distributor garis sel tersebut, dan perbandingan morfologis dengan garis sel lain yang berasal dari C3H menunjukkan bahwa Ba/F3 merupakan garis sel yang berbeda, bukan hasil kontaminasi silang. Temuan ini menekankan pentingnya otentikasi garis sel secara rutin, terutama untuk garis sel tikus di mana profil STR saja mungkin tidak cukup untuk membedakan strain inbred. Para peneliti yang menggunakan Ba/F3 disarankan untuk merujuk pada akses Cellosaurus CVCL_0161 guna memastikan identifikasi yang jelas dalam publikasi.

Informasi tentang Kultur Sel

Keunggulan Sel Ba/F₃

Keunggulan paling signifikan dari sel Ba/F3 adalah mekanisme kelangsungan hidup biner yang bergantung pada IL-3. Tanpa adanya IL-3, sel induk Ba/F3 dengan cepat mengalami apoptosis. Pengenalan kinase onkogenik atau protein fusi menyelamatkan sel dari kematian, sehingga memungkinkan seleksi klon yang telah mengalami transformasi secara stabil dengan mudah tanpa perlu menggunakan konstruksi reporter yang rumit. Sifat ini telah dimanfaatkan dalam berbagai format uji, mulai dari uji kelangsungan hidup koloni klasik hingga skrining proliferasi berkapasitas tinggi modern untuk profilasi senyawa. ^[2] Kesederhanaan dan keandalan pembacaan hasil menjadikan uji berbasis Ba/F₃ sebagai sistem awal yang banyak digunakan untuk menentukan peringkat potensi penghambat kinase, meskipun nilai potensi absolut tetap bergantung pada jenis uji dan laboratorium yang digunakan, sehingga perlu dibandingkan antarpenelitian dengan hati-hati. ^[21]

Sel Ba/F3 juga bersifat fleksibel secara genetik dan mudah ditransfeksi atau ditransduksi. Pengantaran konstruksi ekspresi berbasis retrovirus, lentivirus, dan elektroporasi semuanya menghasilkan subgaris sel yang mengekspresikan gen secara stabil dengan efisien. Hal ini telah memungkinkan pembentukan ratusan garis sel turunan yang membawa mutasi yang relevan secara klinis pada target seperti EGFR, FLT3, BCR-ABL, EML4-ALK, dan RET, di antara banyak lainnya. Tidak adanya mutasi kinase endogen yang membingungkan pada garis induk memastikan bahwa respons fenotipik dapat dikaitkan secara spesifik dengan transgen yang dimasukkan. Selain itu, waktu penggandaan sekitar 20 jam mendukung hasil eksperimen yang cepat, sehingga mempersingkat waktu pengujian secara signifikan dibandingkan dengan kultur sel primer yang pertumbuhannya lebih lambat.

Platform Ba/F3 telah terbukti sangat cocok untuk aplikasi penemuan urutan sinyal. Kojima dan Kitamura memanfaatkan konstruksi reseptor sitokin yang secara konstitutif aktif untuk mengarahkan ketergantungan pertumbuhan Ba/F3 ke lokalisasi di permukaan sel dari protein yang mengandung peptida sinyal, sehingga memungkinkan penyaringan cDNA skala besar untuk mengidentifikasi produk gen yang disekresikan dan yang ditargetkan ke membran. ^[3] Aplikasi kreatif ini menggambarkan bagaimana ketergantungan sel Ba/F3 terhadap IL-3 dapat dimanfaatkan kembali jauh melampaui penelitian onkogen kinase konvensional, sehingga menjadikan garis sel tersebut sebagai platform penyaringan genetik yang serbaguna.

Keterbatasan Sel Ba/F₃

Terlepas dari berbagai kelebihannya, sel Ba/F3 memiliki keterbatasan biologis bawaan yang harus dipertimbangkan saat menafsirkan data eksperimental. Sebagai lini sel pro-B tikus, sel-sel ini tidak memiliki banyak adaptor pensinyalan dan ko-reseptor yang terdapat pada sel kanker manusia. Nilai potensi inhibitor dan respons sinyal hilir yang diamati pada sel Ba/F3 mungkin tidak secara akurat mencerminkan aktivitas pada sel tumor manusia primer atau bahan yang berasal dari pasien. Para peneliti yang mempelajari resistensi terhadap terapi bertarget untuk adenokarsinoma paru, misalnya, harus memvalidasi temuan berbasis sel Ba/F3 pada model sel manusia yang lebih relevan secara fisiologis sebelum menarik kesimpulan klinis.

Latar belakang genomik garis keturunan tersebut juga pernah menjadi sasaran karakterisasi yang keliru. Selama beberapa dekade, Ba/F3 dianggap berasal dari BALB/c, namun profil SNP array menunjukkan bahwa garis keturunan tersebut sebenarnya berasal dari tikus C3H. ^[1] Studi yang sama menemukan bukti adanya aneuploidi pada sekitar 42% dari garis sel tikus yang diteliti, termasuk sebagian besar garis sel yang berasal dari jaringan normal, bukan jaringan tumor; Ba/F3 sendiri ditandai karena kesalahan identifikasi, bukan karena perubahan jumlah salinan, namun temuan umum ini menggambarkan betapa mudahnya pergeseran kariotipik terakumulasi dalam kultur. Ketidakstabilan semacam itu pada jumlah passage yang tinggi dapat memengaruhi hasil sinyal, pengukuran sensitivitas obat, dan reproduktibilitas fenotipe yang mengalami transformasi. Oleh karena itu, para peneliti sebaiknya bekerja pada jumlah passage yang rendah dan secara rutin memverifikasi stok sel mereka.

Terakhir, sel Ba/F3 tidak mereplikasi lingkungan mikro tumor secara utuh maupun interaksi stroma yang terdapat pada neoplasma hematologis. Sel-sel ini juga tidak memiliki ekspresi endogen dari banyak komponen pensinyalan manusia, yang berarti bahwa interaksi ko-reseptor yang penting bagi fungsi onkogen mungkin tidak ada atau berbeda. Penelitian mengenai reseptor sitokin multi-subunit yang kompleks atau reseptor yang memerlukan sinyalisasi bergantung pada glikosilasi mungkin memerlukan sistem sel manusia pelengkap untuk mencapai kesimpulan yang valid secara biologis. Meskipun terdapat keterbatasan tersebut, sel Ba/F3 tetap menjadi alat lini pertama yang kuat dan luas diterima dalam biologi kinase.

Lihat spesifikasi lengkap dan pesan

Aplikasi

Penemuan Obat Kinase dan Penyaringan Onkogen

Sel Ba/F3 telah menjadi platform seluler utama untuk penemuan obat yang menargetkan kinase. Warmuth dan rekan-rekannya memberikan penilaian komprehensif terhadap sistem Ba/F3 untuk tujuan ini, menjelaskan bagaimana uji kemandirian IL-3 dapat diadaptasi ke dalam format berkapasitas tinggi untuk mengevaluasi baik potensi onkogenik mutasi kinase maupun kemampuan inhibitor kinase molekul kecil dalam membalikkan pertumbuhan yang tidak bergantung pada faktor. ^[2]Tinjauan tersebut menyoroti bahwa sel Ba/F3 mengakomodasi berbagai macam kinase onkogenik, menjadikannya platform universal untuk profil awal varian kinom yang terkait dengan kanker sebelum dilanjutkan ke model sel manusia yang lebih kompleks.

Perangkap urutan sinyal yang dikembangkan oleh Kojima dan Kitamura menunjukkan bahwa sel Ba/F3 dapat digunakan tidak hanya untuk penelitian onkogen kinase tetapi juga untuk penyaringan perpustakaan cDNA fungsional. ^[3]Dengan menggabungkan reseptor sitokin yang aktif secara konstitutif dengan fungsi peptida sinyal, sebuah eksperimen percontohan tunggal menghasilkan 150 klon yang telah diketahui sebelumnya — semuanya mengkodekan protein yang disekresikan atau berada di permukaan sel — bersama dengan 48 klon cDNA baru, termasuk protein membran tipe II yang sebelumnya terlewatkan oleh strategi perangkap urutan sinyal. Pendekatan ini menggambarkan skalabilitas platform Ba/F3 melampaui validasi target obat klasik.

Keragaman ekstrem dari garis keturunan Ba/F3 yang kini terdaftar di Cellosaurus — mencakup ratusan varian EGFR, fusi ALK, pengaturan ulang RET, fusi NTRK, dan mutasi resistensi — menegaskan bagaimana garis induk Ba/F3 telah menjadi kerangka dasar bagi penelitian onkologi presisi. Setiap garis turunan mempertahankan latar belakang yang bersih dan bergantung pada IL-3 sambil menambahkan satu variabel genetik yang terdefinisi, sehingga memungkinkan studi hubungan struktur-aktivitas secara sistematis pada tingkat seluler.

Mutasi FLT3 dan Leukemia Mieloid Akut

Salah satu aplikasi sel Ba/F3 yang paling berdampak adalah karakterisasi mutasi FLT3 (fms-like tyrosine kinase 3) pada leukemia myeloid akut (AML). Duplikasi tandem internal FLT3 termasuk di antara lesi onkogenik yang paling sering terjadi pada AML, dilaporkan pada sekitar 20% hingga 30% kasus tergantung pada kohort dan metode deteksi. ^[4][20]Hayakawa dan rekan-rekannya menunjukkan bahwa FLT3 dengan duplikasi tandem, yang dimasukkan ke dalam dua garis sel yang bergantung pada IL-3, yaitu 32D dan Ba/F3, secara konstitutif mengaktifkan baik STAT5 maupun MAP kinase dan memberikan kemampuan pertumbuhan otonom yang yang tidak bergantung pada IL-3, sedangkan FLT3 tipe liar hanya mendukung proliferasi minimal bahkan di bawah stimulasi ligan yang berkelanjutan.^[4] Penelitian penting ini menetapkan sel Ba/F3 sebagai sistem uji fungsional utama untuk memvalidasi mutasi FLT3 dan tetap menjadi rujukan metodologis untuk bidang ini.

Penelitian-penelitian selanjutnya telah dikembangkan secara luas berdasarkan landasan ini. Studi tentang fukosilasi inti menunjukkan bahwa penghapusan gen Fut8 menggunakan CRISPR/Cas9 pada sel Ba/F3 yang mengekspresikan FLT3 tipe liar sudah cukup untuk mendorong proliferasi yang tidak bergantung pada IL-3 — suatu efek yang tidak terlihat pada sel induk — disertai dengan peningkatan fosforilasi tirosin dan aktivasi STAT5, AKT dan ERK, serta dimerisasi FLT3 yang tidak bergantung pada ligan.^[20] Hal ini mengungkap lapisan regulasi glikosilasi yang sebelumnya tidak disadari pada reseptor ini. Resistensi terhadap inhibitor FLT3 gilteritinib juga telah diteliti pada model Ba/F3 FLT3-ITD, di mana resistensi pada konsentrasi obat yang dapat dicapai secara klinis umumnya memerlukan beberapa mutasi sekunder, beberapa di antaranya belum pernah dilaporkan sebelumnya. ^[21]Penelitian yang sama secara sistematis menimbang kelebihan dan keterbatasan model Ba/F3 FLT3-ITD, dengan mencatat bahwa meskipun platform ini sangat cocok untuk mengidentifikasi dan mengklasifikasikan mutasi resistensi, platform ini tidak mereplikasi lingkungan sumsum tulang yang kompleks yang membentuk resistensi pada pasien.

Biologi BCR-ABL dan Leukemia Mieloid Kronis

Sel Ba/F3 yang ditransfeksi dengan protein fusi BCR-ABL telah berperan penting dalam memahami biologi molekuler leukemia mieloid kronis (CML). Canitrot dan rekan-rekannya menggunakan sel Ba/F3 yang mengekspresikan isoform p190 dan p210 BCR-ABL untuk menunjukkan bahwa BCR-ABL memberikan fenotipe mutator, meningkatkan frekuensi mutasi spontan tiga hingga lima kali lipat dibandingkan dengan sel induk, dan bahwa ketidakstabilan genomik ini terkait dengan peningkatan ekspresi DNA polimerase beta. ^[6]Temuan ini memberikan mekanisme yang mungkin digunakan BCR-ABL untuk mendorong perkembangan penyakit dari fase kronis CML menjadi leukemia myeloid akut.

Protein adaptor CRKL, salah satu protein fosfat tirosin utama dalam neutrofil leukemik dari pasien CML, diteliti pada sel Ba/F3 oleh Uemura dan rekan-rekannya. ^[7]Sel yang mengekspresikan CRKL utuh secara berlebihan menunjukkan peningkatan adhesi terhadap fibronektin dan perubahan morfologi pada permukaan yang dilapisi fibronektin, sedangkan mutan delesi yang kehilangan domain SH2 atau domain SH3 N-terminal tidak menunjukkan hal tersebut — yang menunjukkan bahwa kedua domain tersebut diperlukan untuk efek tersebut. Adhesi dihambat oleh antibodi anti-integrin beta1, meskipun ekspresi berlebih CRKL tidak mengubah ekspresi permukaan integrin beta1 atau secara spontan menginduksi epitop aktivasi-nya. Eksperimen ini menunjukkan keterlibatan CRKL dalam jalur sinyal yang mengatur adhesi yang dimediasi integrin di hilir BCR-ABL.

Secara keseluruhan, studi-studi BCR-ABL ini menunjukkan bagaimana sel Ba/F3 memungkinkan analisis yang jelas terhadap sinyalisasi yang didorong oleh onkogen dengan menghilangkan kompleksitas aktivitas kinase endogen. Platform ini terus mendukung karakterisasi mutasi resistensi terhadap inhibitor BCR-ABL, dengan garis sel Ba/F3 BCR-ABL dan turunan BCR-ABL-T315I yang khusus kini tersedia untuk profilasi inhibitor secara langsung dalam konteks genotipe resistensi yang relevan secara klinis.

Jalur Sinyal JAK–STAT

Sel Ba/F3 telah berfungsi sebagai model utama untuk menganalisis peristiwa sinyal mana di hilir reseptor sitokin yang sebenarnya diperlukan untuk pertumbuhan. Liu dan rekan-rekannya membangun molekul chimera (beta/JAK2) yang terdiri dari daerah ekstraseluler dan transmembran betac yang difusi dengan JAK2, dan mengekspresikannya dalam sel Ba/F3. ^[8]Molekul chimera tersebut mengalami fosforilasi konstitutif dan cukup untuk mendorong kelangsungan hidup serta proliferasi yang tidak bergantung pada IL-3. Yang menarik, STAT5, Shc, dan SHP-2 tidak mengalami fosforilasi pada sel-sel ini, dan aktivitas promotor beta-kasein serta c-fos tidak meningkat, sementara transkripsi c-myc diaktifkan secara konstitutif. Para penulis menyimpulkan bahwa aktivasi JAK2 saja sudah cukup untuk kelangsungan hidup dan proliferasi, serta bahwa aktivasi STAT5 dan MAP kinase tidak diperlukan untuk hasil-hasil spesifik ini — sebuah pengingat yang berguna bahwa pertumbuhan yang tidak bergantung pada faktor tertentu pada sel Ba/F3 tidak secara otomatis mengimplikasikan aktivasi STAT.

Peran STAT5 dalam sinyal IFN-alfa diteliti pada sel Ba/F3 oleh Jaster dan rekan-rekannya, yang menunjukkan bahwa IFN-alfa mengaktifkan ikatan DNA STAT5A dan STAT5B, namun IL-3 merupakan induktor yang jauh lebih poten bagi kedua isoform tersebut. ^[9]Mutasi JAK2 dominan-negatif menghambat aktivasi STAT5 yang dipicu oleh IL-3, namun tidak menghambat yang dipicu oleh IFN-alfa, menunjukkan bahwa kedua sitokin tersebut melibatkan mekanisme hulu yang independen untuk berkonvergensi pada faktor transkripsi yang sama; para penulis tetap menyimpulkan bahwa STAT5 tidak berperan sentral dalam sinyal IFN-alfa pada sistem ini.

Aktivasi JAK–STAT konstitutif telah dimodelkan pada sel Ba/F3 menggunakan protein fusi TEL–JAK2, sebuah fusi onkogenik yang terkait dengan leukemia limfoblastik akut sel T. Ho dan rekan-rekannya menunjukkan bahwa fusi domain pointed TEL dengan domain kinase JAK2 yang fungsional (JH1) mengubah sel Ba/F3 menjadi sel yang tidak bergantung pada faktor, sedangkan fusi dengan domain pseudokinase (JH2) atau dengan domain JH1 yang tidak aktif sebagai kinase tidak melakukannya; konstruksi aktif mendorong fosforilasi tirosin konstitutif pada STAT1, STAT3, dan STAT5.^[5] Baru-baru ini, metotreksat ditemukan dapat menekan fosforilasi STAT3 dan STAT5 oleh TEL–JAK2, fosforilasi STAT3 dan STAT5 pada sel Ba/F3 melalui mekanisme yang bergantung pada metabolisme folat: efek tersebut dibalikkan oleh asam folinat, direproduksi melalui penghapusan gen dihidrofolat reduktase dengan CRISPR/Cas9, dan tidak ditiru oleh 5-fluorouracil. ^[22]

Sinyal IL-4 melalui STAT6 diteliti oleh Gingras dan rekan-rekannya, yang menunjukkan bahwa koaktivator p300/CBP diperlukan untuk induksi transkripsi yang dimediasi STAT6 dan bahwa ekspresi berlebih p300/CBP memperkuat aktivitas gen reporter yang didorong oleh IL-4. ^[10]Sebagian besar penelitian tersebut dilakukan pada sel COS7 dan HeLa; sel Ba/F3 memberikan bukti endogen yang penting, yaitu ko-imunopresipitasi STAT6 asli bersama dengan CBP.

Sinyal Reseptor Sitokin dan Biologi Sel Hematopoietik

Sistem reseptor GM-CSF/IL-3/IL-5 telah dipetakan secara ekstensif menggunakan sel Ba/F3. Itoh dan rekan-rekannya melakukan analisis mutasi sistematis terhadap delapan residu tirosin sitoplasmik dari subunit beta umum (betac), mengekspresikan serangkaian mutan tirosin-ke-fenilalanin bersama dengan subunit alfa manusia tipe liar dalam sel Ba/F3 untuk menentukan residu mana yang memediasi keluaran sinyal spesifik. ^[12]Dalam meninjau serangkaian mutagenesis paralel, Okuda dan rekan-rekannya melaporkan bahwa mutasi pada semua delapan residu tirosin sitoplasmik pada GMR-beta mengurangi fosforilasi reseptor itu sendiri, SHP2, dan SHC, namun tidak menghentikan sinyal proliferasi jangka pendek atau fosforilasi JAK2 dan STAT5, yang menggambarkan hierarki fungsi domain reseptor. ^[13]Terbukti bahwa reseptor tirosin kinase RON mengaktifkan jalur reseptor IL-3 betac dalam sel Ba/F3 untuk menginduksi perubahan morfologis yang melibatkan redistribusi F-aktin dan perubahan bentuk nukleus yang unik, sehingga mengungkap adanya interaksi silang antara sistem reseptor tirosin kinase dan reseptor sitokin. ^[14]

Persyaratan subdomain reseptor juga telah dianalisis untuk reseptor IL-2. Dengan menggunakan garis sel Ba/F3 yang ditransfeksi, Hunt dan rekan-rekannya mengidentifikasi domain asam dan daerah kaya serin yang berdekatan dengan membran pada rantai beta reseptor IL-2 sebagai komponen yang diperlukan untuk aktivasi kinase MAP p38 dan p54, dengan Tyr338 — situs pengikatan Shc — berperan sebagai perantara kritis. ^[11]Karena domain asam tidak diperlukan untuk proliferasi yang dipicu oleh IL-2, para penulis menyimpulkan bahwa aktivasi kinase MAP p38 maupun p54 sebenarnya tidak diperlukan untuk pertumbuhan sel Ba/F3 yang dipicu oleh IL-2, suatu pemisahan yang juga berlaku pada sel T primer.

Regulasi siklus sel pada progenitor hematopoietik juga telah diteliti menggunakan sel Ba/F3. Mahmud dan rekan-rekannya menunjukkan bahwa TGF-beta1 menghambat transisi fase G1 ke fase S pada sel Ba/F3, mengaitkan perlambatan pertumbuhan ini dengan peningkatan ekspresi protein Bcl-2 dan inhibitor CDK p27. ^[15]Sinergi IL-4 dengan Raf-1 yang teraktivasi untuk mendorong proliferasi jangka panjang sel Ba/F3 diteliti oleh Levings dan rekan-rekannya, yang menemukan bahwa IL-4 sendiri tidak dapat mendukung pertumbuhan tetapi dapat bekerja sama dengan Ras atau Raf-1 yang teraktivasi untuk mempertahankan proliferasi berkelanjutan yang sebanding dengan IL-3. ^[16]

Sistem peralihan reseptor yang direkayasa telah memanfaatkan ketergantungan Ba/F3 terhadap IL-3 untuk aplikasi terapi gen. Kume dan rekan-rekannya mengembangkan reseptor G-CSF yang difusi dengan gyrase B bakteri (GcrGyr), di mana antibiotik dimerisasi coumermycin memicu proliferasi sel Ba/F3 yang tidak bergantung pada IL-3 sebagai sistem gen penguat selektif proof-of-concept untuk memperbanyak sel hematopoietik yang dimodifikasi secara genetik. ^[17]Demikian pula, protein fusi IL-11 dan reseptor IL-11 terlarut terbukti bertindak sebagai superagonis pada sel Ba/F3 yang ditransfeksi gp130 dan tidak memiliki reseptor alfa IL-11 yang terikat membran, yang menunjukkan bahwa komponen reseptor terlarut dapat secara fungsional menggantikan subunit transmembran. ^[18]

Kesimpulan

Sel Ba/F3 (CVCL_0161) merupakan salah satu platform garis sel tikus yang paling serbaguna dan telah tervalidasi secara luas dalam penelitian biomedis modern. Ketergantungan mereka yang ketat pada IL-3 menyediakan uji fungsional yang elegan dan dapat direproduksi untuk kinase onkogenik — termasuk protein fusi BCR-ABL, mutasi FLT3, dan fusi JAK2 — serta untuk inhibitor kinase molekul kecil yang memiliki relevansi klinis terhadap leukemia myeloid kronis, leukemia myeloid akut, leukemia limfoblastik sel prekursor-limfoma, dan adenokarsinoma paru. Penelitian selama beberapa dekade telah menetapkan sinyal JAK–STAT, biologi reseptor sitokin, dan regulasi sel hematopoietik sebagai bidang inti penerapan sel Ba/F3. Kemampuan adaptasi garis sel ini telah memungkinkan penciptaan ratusan model turunan yang membawa mutasi resistensi yang terdefinisi, menjadikannya tak tergantikan dalam pengembangan terapi bertarget. Jika Anda ingin memulai atau memperluas program biologi kinase atau penemuan obat, sel Ba/F3 tersedia di cytion.com — kunjungi halaman produk untuk menanyakan informasi atau melakukan pemesanan hari ini.

Publikasi Utama

1. Didion JP, Buus RJ, Naghashfar Z (2014) Profil SNP array pada garis sel tikus mengidentifikasi strain asal mereka serta mengungkap kontaminasi silang dan aneuploidi yang meluas. BMC Genomics. PMID: 25277546
2. Warmuth M, Kim S, Gu XJ (2007) Sel Ba/F3 dan penggunaannya dalam penemuan obat kinase. Current Opinion in Oncology. PMID: 17133113
3. Kojima T, Kitamura T (1999) Perangkap urutan sinyal berdasarkan reseptor sitokin yang aktif secara konstitutif. Nature Biotechnology. PMID: 10331810
4. Hayakawa F, Towatari M, Kiyoi H (2000) Flt3 yang mengalami duplikasi tandem secara konstitutif mengaktifkan STAT5 dan MAP kinase serta memicu pertumbuhan sel otonom pada garis sel yang bergantung pada IL-3. Oncogene. PMID: 10698507
5. Ho JM, Beattie BK, Squire JA (1999) Fusi faktor transkripsi ets TEL dengan Jak2 mengakibatkan sinyal Jak-Stat konstitutif. Blood. PMID: 10361134
6. Canitrot Y, Lautier D, Laurent G (1999) Fenotipe mutator pada garis sel Ba/F3 yang ditransfeksi BCR–ABL dan hubungannya dengan peningkatan ekspresi DNA polimerase beta. Oncogene. PMID: 10348341
7. Uemura N, Salgia R, Ewaniuk DS (1999) Peran protein adaptor CRKL dalam adhesi yang dimediasi oleh integrin. Oncogene. PMID: 10362355
8. Liu CB, Itoh T, Arai K (1999) Aktivasi konstitutif JAK2 memberikan kelangsungan hidup dan proliferasi sel BA/F3 yang tidak bergantung pada interleukin-3 tikus. The Journal of Biological Chemistry. PMID: 10037724
9. Jaster R, Tschirch E, Bittorf T (1999) Peran STAT5 dalam transduksi sinyal interferon-alfa pada sel Ba/F3. Cellular Signalling. PMID: 10376805
10. Gingras S, Simard J, Groner B (1999) p300/CBP diperlukan untuk induksi transkripsi oleh interleukin-4 dan berinteraksi dengan Stat6. Nucleic Acids Research. PMID: 10373589
11. Hunt AE, Lali FV, Lord JD (1999) Peran subdomain rantai beta reseptor interleukin (IL)-2 dan Shc dalam aktivasi p38 mitogen-activated protein (MAP) kinase dan p54 MAP kinase. The Journal of Biological Chemistry. PMID: 10066828
12. Itoh T, Liu R, Arai K (1999) Pengaruh yang berbeda dari residu tirosin pada subunit beta reseptor umum terhadap sinyal-sinyal yang diinduksi oleh GM-CSF manusia. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. PMID: 10329850
13. Okuda K, Foster R, Griffin JD (1999) Domain pensinyalan rantai beta c reseptor GM-CSF/IL-3/IL-5. Annals of the New York Academy of Sciences. [Ulasan] PMID: 10372132
14. Mera A, Suga M, Ando M (1999) Induksi perubahan bentuk sel melalui aktivasi reseptor rantai beta umum interleukin-3 oleh tirosin kinase tipe reseptor RON. The Journal of Biological Chemistry. PMID: 10336478
15. Mahmud N, Katayama N, Nishii K (1999) Kemungkinan keterlibatan bcl-2 dalam regulasi progres siklus sel sel hematopoietik oleh transforming growth factor-beta1. British Journal of Haematology. PMID: 10233423
16. Levings MK, Bessette DC, Schrader JW (1999) Interleukin-4 bersinergi dengan Raf-1 untuk mendorong proliferasi jangka panjang dan aktivasi c-jun N-terminal kinase. *Blood*. PMID: 10339476
17. Kume A, Ito K, Ueda Y (1999) Gen fusi reseptor G-CSF-gyrase B: Jenis baru sakelar molekuler untuk ekspansi sel hematopoietik yang dimodifikasi secara genetik. Biochemical and Biophysical Research Communications. PMID: 10381335
18. Pflanz S, Tacken I, Grötzinger J (1999) Protein fusi interleukin-11 dan reseptor interleukin-11 yang larut bertindak sebagai superagonis pada sel yang mengekspresikan gp130. FEBS Letters. PMID: 10350068
19. Palacios R, Steinmetz M (1985) Klon tikus yang bergantung pada IL-3, mengekspresikan antigen permukaan B-220, mengandung gen Ig dalam konfigurasi garis keturunan, dan menghasilkan limfosit B in vivo. Cell. PMID: 3924409
20. Duan C, Fukuda T, Isaji T (2020) Defisiensi fukosilasi inti mengaktifkan sinyal seluler yang bergantung pada ekspresi FLT3 dalam sistem sel Ba/F3. The FASEB Journal. PMID: 31908039
21. Yang J, Friedman R (2025) Kelebihan dan keterbatasan sel Ba/F3 dalam memodelkan resistensi AML yang didorong oleh FLT3. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. PMID: 41183623
22. Saito M, Takeda K, Yoshino M (2026) Metotreksat menghambat jalur TEL-JAK2-STAT melalui mekanisme yang bergantung pada metabolisme folat dalam sel Ba/F3. International Immunopharmacology. PMID: 42287956