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U2OS-CRISPR-TPR-SNAP
Tissu
Os
Maladie
Ostéosarcome
Site métastatique
Localisation de la tumeur primaire (os)

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U2OS-CRISPR-TPR-SNAP

Cell line · Référence du produit 300667

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous TPR (Translocated Promoter Region) ge...

€800.00hors taxes et frais de port
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1

01Informations générales

Description

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP est une lignée cellulaire humaine d'ostéosarcome génétiquement modifiée dérivée de cellules U2OS dans laquelle le gène TPR (Translocated Promoter Region) endogène a été modifié à l'aide de la technologie CRISPR/Cas9 afin de coder un marqueur SNAP dans le cadre de lecture. Le TPR est une grande nucléoporine enroulée en spirale qui se localise dans le panier nucléaire du côté nucléoplasmique du complexe des pores nucléaires (NPC). En marquant le TPR à son locus endogène, la protéine de fusion est exprimée sous contrôle régulateur natif, préservant les niveaux d'expression physiologiques et maintenant une incorporation appropriée dans la structure du panier nucléaire.

Le marqueur SNAP permet le marquage covalent du TPR avec des substrats fluorescents conjugués à la benzylguanine dans des cellules vivantes ou fixées, ce qui permet une visualisation hautement spécifique et stable. Dans les cellules U2OS-CRISPR-TPR-SNAP, le TPR marqué présente une distribution caractéristique en anneaux ponctués au niveau de l'enveloppe nucléaire, correspondant aux structures du panier nucléaire associées au NPC. Ce système est bien adapté à la microscopie à fluorescence quantitative, à l'imagerie à super-résolution, au marquage par puls-chase et aux études dynamiques de l'assemblage et du renouvellement du panier nucléaire. La morphologie plate et les grands noyaux des cellules U2OS facilitent l'imagerie haute résolution des structures associées à l'enveloppe nucléaire.

Le TPR joue un rôle essentiel dans l'exportation de l'ARNm, la régulation du transport nucléaire, l'organisation de la chromatine à la périphérie nucléaire et l'organisation spatiale du génome. Le TPR est également impliqué dans la formation de sous-compartiments liés au transport nucléaire et dans l'exclusion de l'hétérochromatine des régions associées aux pores nucléaires. U2OS-CRISPR-TPR-SNAP fournit un modèle physiologiquement pertinent pour disséquer l'architecture et la dynamique du panier nucléaire, étudier les mécanismes de trafic nucléocytoplasmique et étudier les interactions entre la chromatine et l'enveloppe nucléaire dans des conditions d'expression endogènes.

Tissu
Os
Maladie
Ostéosarcome
Site métastatique
Localisation de la tumeur primaire (os)
Applications
Biologie du « panier » nucléaire ; exportation de l'ARNm médiée par la TPR ; régulation du transport nucléocytoplasmique ; organisation de la chromatine à la périphérie du noyau ; sous-compartiments du transport nucléaire ; organisation spatiale du génome ; microscopie à super-résolution ; marquage SNAP par impulsion-poursuite ; exclusion de l'hétérochromatine des régions associées aux pores

02Classification

Organisme
Humain
Sexe
Femme
Propriétés de croissance
Adepte
Statut OGM
GMO-S1
Informations détaillées sur le statut OGM
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-TPR-SNAP) contains a CRISPR-engineered TPR-SNAP fusion enabling fluorescent and chemical labeling of the TPR nuclear basket protein. The construct is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Niveau de biosécurité
1

03Caractéristiques

Morphologie
De type épithélial
Type de cellule
Cellules épithéliales (ostéosarcome)
Temps de doublement
environ 24 à 36 heures

04Identifiants

Référence
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP (numéro de catalogue Cytion 300667)
Numéro d'identification fiscale NCBI
9606
Déposant
Le laboratoire Ellenberg (EMBL)

05Expression et sensibilité

Expression des protéines
TPR, SNAP-tag

06Manipulation et culture

Milieu de culture
McCoys 5a, w : 3.0 g/L Glucose, w : Glutamine stable, w : 2.0 mM Pyruvate de sodium, w : 2.2 g/L NaHCO3 (numéro d'article Cytion 820200a)
Atmosphère d'incubation

37°C, 5%CO2, atmosphère humidifiée.

Compléments alimentaires
Compléter le milieu avec 10 % de FBS, 3,0 g/L de glucose, de la glutamine stable, 2,0 mM de pyruvate de sodium, 2,2 g/L de NaHCO3, 1 % de NEAA
Réactif de dissociation
Accutase
Repiquage
Retirer l'ancien milieu des cellules adhérentes et les laver avec du PBS dépourvu de calcium et de magnésium. Pour les flacons T25, utiliser 3-5 ml de PBS, et pour les flacons T75, 5-10 ml. Ensuite, recouvrir complètement les cellules avec Accutase, en utilisant 1 à 2 ml pour les flacons T25 et 2,5 ml pour les flacons T75. Laisser les cellules incuber à température ambiante pendant 8-10 minutes pour les détacher. Après incubation, mélanger délicatement les cellules avec 10 ml de milieu pour les remettre en suspension, puis centrifuger à 300xg pendant 3 minutes. Jeter le surnageant, remettre les cellules en suspension dans du milieu frais et les transférer dans de nouveaux flacons contenant déjà du milieu frais.
Rapport de fractionnement
1 à 3
Densité de semis
1 à 3 × 10⁴ cellules/cm²
Renouvellement des fluides
2 à 3 fois par semaine
Décongélation et mise en culture
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Contrôle qualité et cryoconservation

Stérilité

La contamination par les mycoplasmes est exclue à l'aide de tests basés sur la PCR et de méthodes de détection des mycoplasmes basées sur la luminescence.

Pour s'assurer de l'absence de contamination bactérienne, fongique ou levurienne, les cultures cellulaires font l'objet d'inspections visuelles quotidiennes.

Milieu de congélation
Comme milieu de cryoconservation, nous utilisons un milieu de croissance complet (comprenant du FBS) + 10 % de DMSO pour une viabilité adéquate après décongélation, ou CM-1 (numéro de catalogue 800100 de Cytion), qui comprend des osmoprotectants et des stabilisateurs métaboliques optimisés pour améliorer la récupération et réduire le stress induit par la cryogénisation.
Conditions de stockage

Pour une conservation à long terme, placer les flacons dans de l'azote liquide en phase vapeur à une température comprise entre -150 et -196 °C environ. Le stockage à -80 °C n'est acceptable qu'en tant qu'étape intermédiaire de courte durée avant le transfert dans l'azote liquide.

Conditions de livraison

Les lignées cellulaires cryoconservées sont expédiées sur glace sèche dans des emballages isolés et validés, avec suffisamment de réfrigérant pour maintenir une température d'environ -78 °C tout au long du transport. À la réception, inspecter immédiatement le conteneur et transférer sans délai les flacons dans un lieu de stockage approprié.

08Donateur

Âge du donneur
15 ans
Origine ethnique
Caucasien