U2OS-CRISPR-TPR-SNAP
Cell line · Product number 300667
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous TPR (Translocated Promoter Region) ge...
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01General information
- Description
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP est une lignée cellulaire d’ostéosarcome humain modifiée génomiquement, dérivée de cellules U2OS, dans laquelle le gène endogène TPR (région promotrice translocée) a été modifié à l’aide de la technologie CRISPR/Cas9 afin de coder pour un marqueur SNAP en cadre de lecture. La TPR est une grande nucléoporine à structure en hélice enroulée qui se localise dans le panier nucléaire, du côté nucléoplasmique du complexe des pores nucléaires (NPC). En marquant la TPR à son locus endogène, la protéine de fusion est exprimée sous le contrôle régulateur natif, ce qui préserve les niveaux d’expression physiologiques et assure son intégration adéquate dans la structure du panier nucléaire.
Le marqueur SNAP permet le marquage covalent de la TPR avec des substrats fluorescents conjugués à la benzylguanine dans des cellules vivantes ou fixées, ce qui permet une visualisation hautement spécifique et stable. Dans les cellules U2OS-CRISPR-TPR-SNAP, la protéine TPR marquée présente une distribution ponctuelle caractéristique en forme d’anneau au niveau de l’enveloppe nucléaire, correspondant aux structures du panier nucléaire associées au NPC. Ce système est particulièrement adapté à la microscopie à fluorescence quantitative, à l’imagerie à super-résolution, au marquage par impulsion-poursuite et aux études dynamiques de l’assemblage et du renouvellement du panier nucléaire. La morphologie aplatie et les gros noyaux des cellules U2OS facilitent l’imagerie à haute résolution des structures associées à l’enveloppe nucléaire.
La protéine TPR joue un rôle essentiel dans l’exportation de l’ARNm, la régulation du transport nucléaire, l’organisation de la chromatine à la périphérie du noyau et l’organisation spatiale du génome. Elle est également impliquée dans la formation de sous-compartiments liés au transport nucléaire et dans l’exclusion de l’hétérochromatine des régions associées aux pores nucléaires. U2OS-CRISPR-TPR-SNAP offre un modèle physiologiquement pertinent pour analyser l’architecture et la dynamique du panier nucléaire, étudier les mécanismes de trafic nucléocytoplasmique et examiner les interactions entre la chromatine et l’enveloppe nucléaire dans des conditions d’expression endogènes.
- Tissue
- Os
- Disease
- Ostéosarcome
- Metastatic site
- Site de la tumeur primaire (os)
- Applications
- Biologie du panier nucléaire; exportation de l’ARNm médiée par la TPR; régulation du transport nucléocytoplasmique; organisation de la chromatine à la périphérie du noyau; sous-compartiments du transport nucléaire; organisation spatiale du génome; microscopie à super-résolution; marquage SNAP par impulsion-poursuite; exclusion de l’hétérochromatine des régions associées aux pores
02Classification
- Organism
- Human
- Sex
- Female
- Growth properties
- Adherent
- GMO status
- GMO-S1
- GMO status details
- GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-TPR-SNAP) contains a CRISPR-engineered TPR-SNAP fusion enabling fluorescent and chemical labeling of the TPR nuclear basket protein. The construct is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
- Biosafety level
- 1
03Characteristics
- Morphology
- De type épithélial
- Cell type
- Cellules épithéliales (ostéosarcome)
- Doubling time
- environ 24 à 36 heures
04Identifiers
- Citation
- U2OS-CRISPR-TPR-SNAP (numéro de catalogue Cytion 300667)
- NCBI TaxID
- 9606
- Depositor
- Le laboratoire Ellenberg (EMBL)
05Expression and susceptibility
- Protein expression
- TPR, SNAP-tag
06Handling and culture
- Culture medium
- McCoys 5a, w : 3,0 g/L de glucose, w : stable; glutamine, w : 2,0 mM de pyruvate de sodium, w : 2,2 g/L de NaHCO₃ (référence Cytion 820200a)
- Incubation atmosphere
37 °C, 5 % de CO₂, atmosphère humidifiée.
- Supplements
- Ajouter au milieu 10 % de FBS, 3,0 g/L de glucose, de la glutamine stable, 2,0 mM de pyruvate de sodium, 2,2 g/L de NaHCO₃ et 1 % de NEAA.
- Dissociation reagent
- Accutase
- Subculturing
- Retirez l’ancien milieu des cellules adhérentes et lavez-les avec du PBS sans calcium ni magnésium. Pour les flacons T25, utilisez 3 à 5 ml de PBS, et pour les flacons T75, utilisez 5 à 10 ml. Ensuite, recouvrez complètement les cellules d’Accutase, en utilisant 1 à 2 ml pour les flacons T25 et 2,5 ml pour les flacons T75. Laissez les cellules incuber à température ambiante pendant 8 à 10 minutes afin de les détacher. Après l’incubation, mélangez délicatement les cellules avec 10 ml de milieu pour les remettre en suspension, puis centrifugez à 300 x g pendant 3 minutes. Éliminez le surnageant, remettez les cellules en suspension dans du milieu frais, puis transférez-les dans de nouveaux flacons contenant déjà du milieu frais.
- Split ratio
- 1 à 3
- Seeding density
- de 1 à 3 × 10⁴ cellules/cm²
- Fluid renewal
- 2 à 3 fois par semaine
- Thawing and culturing
Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.
Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.
For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.
Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.
Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.
Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.
Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.
Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.
07Quality control and cryopreservation
- Sterility
La contamination par les mycoplasmes est exclue à l'aide de tests basés sur la PCR et de méthodes de détection des mycoplasmes par luminescence.
Afin de s’assurer qu’il n’y a aucune contamination bactérienne, fongique ou par des levures, les cultures cellulaires font l’objet d’inspections visuelles quotidiennes.
- Freeze medium
- Comme milieu de cryoconservation, nous utilisons un milieu de croissance complet (contenant du sérum fœtal bovin) + 10 % de DMSO pour assurer une viabilité adéquate après décongélation, ou du CM-1 (référence Cytion 800100), qui contient des osmoprotecteurs et des stabilisateurs métaboliques optimisés pour améliorer la récupération et réduire le stress induit par la cryoconservation.
- Storage conditions
Pour une conservation à long terme, placez les flacons dans de l’azote liquide en phase vapeur à une température comprise entre environ −150 et −196 °C. L’entreposage à −80 °C n’est acceptable qu’à titre d’étape intermédiaire de courte durée avant le transfert dans l’azote liquide.
- Shipping conditions
Les lignées cellulaires cryoconservées sont expédiées dans de la glace sèche, dans un emballage isotherme validé contenant suffisamment de réfrigérant pour maintenir une température d’environ −78 °C pendant tout le transport. À la réception, inspectez immédiatement le conteneur et transférez sans délai les flacons dans un lieu de stockage approprié.
08Donor
- Donor age
- 15 ans
- Ethnicity
- caucasien
09Legal and safety
- Safety precautions
- Lorsqu’on prévoit entreposer un cryotube dans de l’azote liquide en vue d’une décongélation ultérieure, il est impératif de respecter des mesures de sécurité rigoureuses. Le port de gants et de vêtements de protection appropriés est essentiel, et l’utilisation d’un masque facial ou de lunettes de protection est obligatoire lors du transfert d’échantillons congelés vers ou depuis le réservoir d’azote liquide. Cette précaution vise à réduire le risque de blessure causé par d’éventuelles explosions de cryotubes lors de leur retrait, pouvant entraîner la projection de fragments coupants.
- Warranty
Chez Cytion, nous garantissons la qualité et la viabilité de nos produits. Nous garantissons que nos cellules seront viables au début de la culture pendant 60 jours à compter de leur expédition depuis nos installations. Nous assurons que tous les matériaux sont conformes aux spécifications décrites dans le certificat d’analyse et/ou la fiche technique du produit.
Pour plus de détails, veuillez consulter notre déclaration de garantie.
- Third-party agreements apply
- Yes


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