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U2OS-CRISPR-TPR-SNAP
Tessuto
Osso
Malattia
Osteosarcoma
Sito metastatico
Sede del tumore primario (osso)

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U2OS-CRISPR-TPR-SNAP

Cell line · Codice prodotto 300667

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous TPR (Translocated Promoter Region) ge...

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01Informazioni generali

Descrizione

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP è una linea cellulare di osteosarcoma umano modificata genomicamente derivata dalle cellule U2OS in cui il gene TPR (Translocated Promoter Region) endogeno è stato modificato utilizzando la tecnologia CRISPR/Cas9 per codificare un tag SNAP in-frame. Il TPR è una grande nucleoporina a spirale che si localizza nel basket nucleare sul lato nucleoplasmatico del complesso dei pori nucleari (NPC). Contrassegnando il TPR nel suo locus endogeno, la proteina di fusione viene espressa sotto il controllo regolatorio nativo, preservando i livelli di espressione fisiologica e mantenendo il corretto inserimento nella struttura del basket nucleare.

Il tag SNAP consente la marcatura covalente di TPR con substrati fluorescenti coniugati con benzilguanina in cellule vive o fissate, consentendo una visualizzazione altamente specifica e stabile. Nelle cellule U2OS-CRISPR-TPR-SNAP, il TPR marcato mostra una caratteristica distribuzione puntiforme ad anello sull'involucro nucleare, corrispondente alle strutture del nucleo associate all'NPC. Questo sistema è particolarmente adatto per la microscopia a fluorescenza quantitativa, l'imaging a super risoluzione, la marcatura pulse-chase e gli studi dinamici sull'assemblaggio e il ricambio del nucleo. La morfologia piatta e i nuclei di grandi dimensioni delle cellule U2OS facilitano l'imaging ad alta risoluzione delle strutture associate all'involucro nucleare.

Il TPR svolge un ruolo fondamentale nell'esportazione dell'mRNA, nella regolazione del trasporto nucleare, nell'organizzazione della cromatina alla periferia nucleare e nell'organizzazione spaziale del genoma. Il TPR è anche implicato nella formazione di sottocompartimenti legati al trasporto nucleare e nell'esclusione dell'eterocromatina dalle regioni associate ai pori nucleari. U2OS-CRISPR-TPR-SNAP fornisce un modello fisiologicamente rilevante per analizzare l'architettura e la dinamica del basket nucleare, studiare i meccanismi di traffico nucleocitoplasmatico e studiare le interazioni della cromatina associate all'involucro nucleare in condizioni di espressione endogena.

Tessuto
Osso
Malattia
Osteosarcoma
Sito metastatico
Sede del tumore primario (osso)
Applicazioni
Biologia del “cestello” nucleare; esportazione dell’mRNA mediata dal TPR; regolazione del trasporto nucleocitoplasmatico; organizzazione della cromatina alla periferia del nucleo; sottocompartimenti del trasporto nucleare; organizzazione spaziale del genoma; microscopia a super-risoluzione; marcatura SNAP con tecnica pulse-chase; esclusione dell’eterocromatina dalle regioni associate ai pori

02Classificazione

Organismo
Umano
Sesso
Donna
Proprietà di crescita
Aderente
Presenza di OGM
GMO-S1
Dettagli sullo stato degli OGM
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-TPR-SNAP) contains a CRISPR-engineered TPR-SNAP fusion enabling fluorescent and chemical labeling of the TPR nuclear basket protein. The construct is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Livello di biosicurezza
1

03Caratteristiche

Morfologia
Simile all'epitelio
Tipo di cellula
Cellule epiteliali (osteosarcoma)
Tempo di raddoppio
circa da 24 a 36 ore

04Identificatori

Riferimento bibliografico
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP (numero di catalogo Cytion 300667)
Codice fiscale NCBI
9606
Depositario
Il laboratorio Ellenberg (EMBL)

05Espressione e suscettibilità

Espressione proteica
TPR, etichetta SNAP

06Manipolazione e coltura

Terreno di coltura
McCoys 5a, w: 3,0 g/L Glucosio, w: Glutammina stabile, w: 2,0 mM Sodio piruvato, w: 2,2 g/L NaHCO3 (articolo Cytion numero 820200a)
Atmosfera di incubazione

37°C, 5%CO2, atmosfera umidificata.

Integratori
Integrare il terreno di coltura con 10% FBS, 3,0 g/L di glucosio, Glutammina stabile, 2,0 mM di piruvato di sodio, 2,2 g/L di NaHCO3, 1% di NEAA
Reagente di dissociazione
Accutase
Subcoltura
Rimuovere il vecchio terreno dalle cellule aderenti e lavarle con PBS privo di calcio e magnesio. Per le fiasche T25, utilizzare 3-5 ml di PBS e per le fiasche T75, 5-10 ml. Quindi, coprire completamente le cellule con Accutase, utilizzando 1-2 ml per le fiasche T25 e 2,5 ml per le fiasche T75. Lasciare incubare le cellule a temperatura ambiente per 8-10 minuti per staccarle. Dopo l'incubazione, mescolare delicatamente le cellule con 10 ml di terreno per risospenderle, quindi centrifugare a 300xg per 3 minuti. Scartare il surnatante, risospendere le cellule in terreno fresco e trasferirle in nuove fiasche contenenti terreno fresco.
Rapporto di frazionamento
da 1 a 3
Densità di semina
da 1 a 3 × 10⁴ cellule/cm²
Rinnovo dei fluidi
da 2 a 3 volte alla settimana
Scongelamento e coltura
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Controllo di qualità e crioconservazione

Sterilità

La contaminazione da micoplasma viene esclusa utilizzando sia saggi basati sulla PCR sia metodi di rilevamento del micoplasma basati sulla luminescenza.

Per garantire l'assenza di contaminazione batterica, fungina o da lieviti, le colture cellulari sono sottoposte a ispezioni visive quotidiane.

Terreno di coltura congelato
Come terreno di crioconservazione, utilizziamo un terreno di crescita completo (incluso FBS) + 10% DMSO per un'adeguata vitalità post-scongelamento, o CM-1 (numero di catalogo Cytion 800100), che include osmoprotettori e stabilizzatori metabolici ottimizzati per migliorare il recupero e ridurre lo stress crio-indotto.
Condizioni di conservazione

Per la conservazione a lungo termine, porre le fiale in azoto liquido in fase vapore a una temperatura compresa tra -150 e -196 °C circa. La conservazione a -80 °C è accettabile solo come breve fase intermedia prima del trasferimento in azoto liquido.

Condizioni di spedizione

Le linee cellulari crioconservate vengono spedite su ghiaccio secco in confezioni isolate e convalidate, con una quantità di refrigerante sufficiente a mantenere circa -78 °C durante il trasporto. Al ricevimento, ispezionare immediatamente il contenitore e trasferire immediatamente le fiale in un luogo di conservazione appropriato.

08Donatore

Età dei donatori
15 anni
Etnia
Caucasico