Ga naar de inhoud
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP
Weefsel
Bot
Ziekte
Osteosarcoom
Plaats van uitzaaiingen
Locatie van de primaire tumor (bot)

Documenten

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP

Cell line · Productnummer 300667

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous TPR (Translocated Promoter Region) ge...

€800.00excl. btw en verzendkosten
Op voorraad
Lot
Aanbevolen (verste partij)
  • CoA
1

01Algemene informatie

Beschrijving

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is een genoombewerkte menselijke osteosarcoomcellijn afgeleid van U2OS-cellen waarin het endogene TPR-gen (Translocated Promoter Region) is gemodificeerd met behulp van CRISPR/Cas9-technologie om een in-frame SNAP-tag te coderen. TPR is een groot coiled-coil nucleoporine dat zich lokaliseert in de nucleaire mand aan de nucleoplasmatische zijde van het nucleaire poriecomplex (NPC). Door TPR op zijn endogene locus te taggen, wordt het fusie-eiwit onder natuurlijke regulerende controle tot expressie gebracht, waardoor de fysiologische expressieniveaus behouden blijven en de juiste opname in de nucleaire mandstructuur behouden blijft.

De SNAP-tag maakt covalente labeling van TPR mogelijk met benzylguanine-geconjugeerde fluorescerende substraten in levende of gefixeerde cellen, wat een zeer specifieke en stabiele visualisatie mogelijk maakt. In U2OS-CRISPR-TPR-SNAP-cellen vertoont gelabeld TPR een karakteristieke puntvormige ringachtige verdeling aan de kernmembraan, die overeenkomt met NPC-geassocieerde nucleaire mandstructuren. Dit systeem is zeer geschikt voor kwantitatieve fluorescentiemicroscopie, superresolutiebeeldvorming, pulse-chase-labeling en dynamische studies van de assemblage en omzetting van de nucleaire mand. De vlakke morfologie en grote kernen van U2OS-cellen vergemakkelijken beeldvorming met hoge resolutie van structuren die geassocieerd zijn met de kernmembraan.

TPR speelt een cruciale rol bij mRNA-export, regulering van nucleair transport, chromatine-organisatie aan de kernperiferie en ruimtelijke genoomorganisatie. TPR is ook betrokken bij de vorming van nucleair transportgerelateerde subcompartimenten en bij de uitsluiting van heterochromatine uit nucleaire poriëngerelateerde regio's. U2OS-CRISPR-TPR-SNAP biedt een fysiologisch relevant model voor het ontleden van de architectuur en dynamica van de nucleaire mand, het onderzoeken van nucleocytoplasmatische transportmechanismen en het bestuderen van nucleaire envelop-geassocieerde chromatine-interacties onder endogene expressieomstandigheden.

Weefsel
Bot
Ziekte
Osteosarcoom
Plaats van uitzaaiingen
Locatie van de primaire tumor (bot)
Toepassingen
Kernmandbiologie; TPR-gemedieerde mRNA-export; regulering van het transport tussen kern en cytoplasma; chromatine-organisatie aan de rand van de kern; subcompartimenten voor kerntransport; ruimtelijke organisatie van het genoom; superresolutiemicroscopie; SNAP-puls-chase-markering; uitsluiting van heterochromatine uit poriëngebonden gebieden

02Classificatie

Organisme
Mens
Seks
Vrouw
Groei-eigenschappen
Aanhanger
GGO-status
GMO-S1
Details over de GGO-status
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-TPR-SNAP) contains a CRISPR-engineered TPR-SNAP fusion enabling fluorescent and chemical labeling of the TPR nuclear basket protein. The construct is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Bioveiligheidsniveau
1

03Kenmerken

Morfologie
Epitheelachtig
Celtype
Epitheelcellen (osteosarcoom)
Verdubbelingstijd
ongeveer 24 tot 36 uur

04Identificatiegegevens

Bronvermelding
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP (Cytion catalogusnummer 300667)
NCBI-belastingnummer
9606
Inlegger
Het Ellenberg Lab (EMBL)

05Expressie en vatbaarheid

Eiwit-expressie
TPR, SNAP-tag

06Behandeling en kweek

Kweekmedium
McCoys 5a, w: 3,0 g/L Glucose, w: stabiel Glutamine, w: 2,0 mM Natriumpyruvaat, w: 2,2 g/L NaHCO3 (Cytion artikelnummer 820200a)
Incubatieomgeving

37°C, 5%CO2, bevochtigde atmosfeer.

Supplementen
Vul het medium aan met 10% FBS, 3,0 g/L Glucose, stabiele Glutamine, 2,0 mM Natriumpyruvaat, 2,2 g/L NaHCO3, 1% NEAA
Dissociatiereagens
Accutase
Heruitplanten
Verwijder het oude medium van de adherente cellen en was ze met PBS zonder calcium en magnesium. Gebruik voor T25-flesjes 3-5 ml PBS en voor T75-flesjes 5-10 ml. Bedek de cellen vervolgens volledig met Accutase, met 1-2 ml voor T25-flesjes en 2,5 ml voor T75-flesjes. Laat de cellen gedurende 8-10 minuten bij kamertemperatuur incuberen om ze los te maken. Na incubatie de cellen voorzichtig mengen met 10 ml medium om ze te resuspenderen en vervolgens centrifugeren bij 300xg gedurende 3 minuten. Gooi het supernatant weg, resuspendeer de cellen in vers medium en breng ze over in nieuwe kolven die al vers medium bevatten.
Splitsingsverhouding
1 tot en met 3
Zaaidichtheid
1 tot 3 × 10⁴ cellen/cm²
Vloeistofverversing
2 tot 3 keer per week
Ontdooien en kweken
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kwaliteitscontrole en cryopreservatie

Onvruchtbaarheid

Mycoplasmaverontreiniging wordt uitgesloten met zowel PCR-gebaseerde testen als op luminescentie gebaseerde mycoplasmadetectiemethoden.

Om er zeker van te zijn dat er geen besmetting is met bacteriën, schimmels of gisten, worden de celculturen dagelijks onderworpen aan visuele inspecties.

Kweekmedium invriezen
Als cryoconserveringsmedium gebruiken we volledig groeimedium (inclusief FBS) + 10% DMSO voor voldoende levensvatbaarheid na het ontdooien, of CM-1 (Cytion catalogusnummer 800100), dat geoptimaliseerde osmoprotectanten en metabolische stabilisatoren bevat om het herstel te verbeteren en door cryo geïnduceerde stress te verminderen.
Opslagvoorwaarden

Voor langdurige bewaring plaatst u flesjes in vloeibare stikstof in dampfase bij ongeveer -150 tot -196 °C. Opslag bij -80 °C is alleen aanvaardbaar als korte tussenstap vóór overbrenging naar vloeibare stikstof.

Verzendvoorwaarden

Gecryopreserveerde cellijnen worden verzonden op droog ijs in gevalideerde, geïsoleerde verpakkingen met voldoende koelmiddel om gedurende het transport ongeveer -78 °C te handhaven. Inspecteer de verpakking onmiddellijk na ontvangst en breng de flacons onverwijld over naar de juiste opslagplaats.

08Donateur

Leeftijd van de donor
15 jaar
Etnische afkomst
Kaukasisch