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U2OS-CRISPR-TPR-SNAP
Tissue
Osso
Disease
Osteossarcoma
Metastatic site
Localização do tumor primário (osso)

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U2OS-CRISPR-TPR-SNAP

Cell line · Product number 300667

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous TPR (Translocated Promoter Region) ge...

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01General information

Description

A U2OS-CRISPR-TPR-SNAP é uma linhagem celular de osteossarcoma humano editada genômicamente, derivada de células U2OS, na qual o gene endógeno TPR (Região Promotora Translocada) foi modificado por meio da tecnologia CRISPR/Cas9 para codificar uma marca SNAP em-quadro. A TPR é uma grande nucleoporina do tipo coiled-coil que se localiza na cesta nuclear, no lado nucleoplásmico do complexo de poros nucleares (NPC). Ao marcar a TPR em seu locus endógeno, a proteína de fusão é expressa sob controle regulatório nativo, preservando os níveis fisiológicos de expressão e mantendo a incorporação adequada à estrutura da cesta nuclear.

A etiqueta SNAP permite a marcação covalente da TPR com substratos fluorescentes conjugados à benzilguanina em células vivas ou fixadas, possibilitando uma visualização altamente específica e estável. Em células U2OS-CRISPR-TPR-SNAP, a TPR marcada exibe uma distribuição pontilhada característica em forma de anel no envelope nuclear, correspondendo às estruturas da cesta nuclear associadas ao NPC. Esse sistema é adequado para microscopia de fluorescência quantitativa, imagens de super-resolução, marcação por pulso-perseguição e estudos dinâmicos da montagem e renovação da cesta nuclear. A morfologia achatada e os núcleos grandes das células U2OS facilitam a imagem de alta resolução das estruturas associadas ao envelope nuclear.

A TPR desempenha papéis críticos na exportação de mRNA, na regulação do transporte nuclear, na organização da cromatina na periferia nuclear e na organização espacial do genoma. A TPR também está implicada na formação de subcompartimentos relacionados ao transporte nuclear e na exclusão da heterocromatina de regiões associadas aos poros nucleares. O U2OS-CRISPR-TPR-SNAP oferece um modelo fisiologicamente relevante para analisar a arquitetura e a dinâmica da cesta nuclear, investigar mecanismos de tráfego nucleocitoplasmático e estudar as interações da cromatina associadas ao envelope nuclear em condições de expressão endógena.

Tissue
Osso
Disease
Osteossarcoma
Metastatic site
Localização do tumor primário (osso)
Applications
Biologia da cesta nuclear; exportação de mRNA mediada por TPR; regulação do transporte nucleocitoplasmático; organização da cromatina na periferia nuclear; subcompartimentos do transporte nuclear; organização espacial do genoma; microscopia de super-resolução; marcação SNAP por pulso-perseguição; exclusão da heterocromatina das regiões associadas aos poros

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Adherent
GMO status
GMO-S1
GMO status details
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-TPR-SNAP) contains a CRISPR-engineered TPR-SNAP fusion enabling fluorescent and chemical labeling of the TPR nuclear basket protein. The construct is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Biosafety level
1

03Characteristics

Morphology
De tipo epitelial
Cell type
Células epiteliais (osteossarcoma)
Doubling time
aproximadamente 24 a 36 horas

04Identifiers

Citation
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP (número de catálogo da Cytion 300667)
NCBI TaxID
9606
Depositor
Laboratório Ellenberg (EMBL)

05Expression and susceptibility

Protein expression
TPR, SNAP-tag

06Handling and culture

Culture medium
McCoys 5a, p: 3,0 g/L de glicose, p: glutamina estável, p: 2,0 mM de piruvato de sódio, p: 2,2 g/L de NaHCO₃ (número de artigo da Cytion 820200a)
Incubation atmosphere

37 °C, 5% de CO₂, atmosfera umidificada.

Supplements
Adicione ao meio 10% de FBS, 3,0 g/L de glicose, glutamina estável, 2,0 mM de piruvato de sódio, 2,2 g/L de NaHCO₃ e 1% de NEAA
Dissociation reagent
Accutase
Subculturing
Remova o meio antigo das células aderentes e lave-as com PBS sem cálcio nem magnésio. Para frascos T25, use 3 a 5 ml de PBS; para frascos T75, use 5 a 10 ml. Em seguida, cubra as células completamente com Accutase, utilizando 1 a 2 ml para frascos T25 e 2,5 ml para frascos T75. Deixe as células incubarem à temperatura ambiente por 8 a 10 minutos para que se desprendam. Após a incubação, misture delicadamente as células com 10 ml de meio para ressuspender, depois centrifugue a 300xg por 3 minutos. Descarte o sobrenadante, ressuspenda as células em meio fresco e transfira-as para novos frascos que já contenham meio fresco.
Split ratio
1 a 3
Seeding density
1 a 3 × 10⁴ células/cm²
Fluid renewal
2 a 3 vezes por semana
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

A contaminação por micoplasma é descartada por meio de ensaios baseados em PCR e de métodos de detecção de micoplasma baseados em luminescência.

Para garantir que não haja contaminação por bactérias, fungos ou leveduras, as culturas celulares são submetidas a inspeções visuais diárias.

Freeze medium
Como meio de criopreservação, utilizamos meio de crescimento completo (incluindo FBS) + 10% de DMSO para garantir viabilidade adequada após o descongelamento, ou CM-1 (número de catálogo da Cytion 800100), que inclui osmoprotetores e estabilizadores metabólicos otimizados para melhorar a recuperação e reduzir o estresse induzido pela criopreservação.
Storage conditions

Para preservação a longo prazo, coloque os frascos em nitrogênio líquido em fase de vapor a uma temperatura entre aproximadamente −150 e −196 °C. O armazenamento a −80 °C é aceitável apenas como uma etapa intermediária de curta duração antes da transferência para o nitrogênio líquido.

Shipping conditions

As linhagens celulares criopreservadas são enviadas em gelo seco, em embalagens isoladas e validadas, com refrigerante suficiente para manter a temperatura em aproximadamente −78 °C durante todo o transporte. Ao receber a remessa, inspecione o recipiente imediatamente e transfira os frascos sem demora para o local de armazenamento adequado.

08Donor

Donor age
15 anos
Ethnicity
caucasiano