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U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133
Tissue
Osso
Disease
Osteossarcoma
Metastatic site
Localização do tumor primário (osso)

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U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133

Cell line · Product number 300666

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 is a genetically engineered human osteosarcoma cell line derived from the parental U2OS background in which the endogenous NUP133...

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1

01General information

Description

A U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 é uma linhagem celular de osteossarcoma humano geneticamente modificada, derivada da linhagem parental U2OS, na qual o locus endógeno NUP133 foi modificado por meio da edição do genoma mediada por CRISPR/Cas9 para codificar uma etiqueta SNAPf no extremo C-terminal. A NUP133 é um componente central do complexo Y (complexo NUP107-160), um subcomplexo estrutural essencial para a montagem e manutenção do complexo de poros nucleares (NPC). Ao introduzir a sequência codificadora da SNAPf em fase no locus endógeno, a proteína de fusão é expressa sob controle regulatório nativo, preservando os níveis fisiológicos de expressão e a localização subcelular.

A etiqueta SNAPf é uma variante de marcação rápida da etiqueta SNAP, uma O6-alquilguanina-DNA-alquiltransferase modificada que reage covalentemente com substratos conjugados à benzilguanina. Isso permite a marcação fluorescente altamente específica e versátil da Nup133 em células vivas ou fixadas, utilizando substratos SNAP permeáveis ou impermeáveis às células. Nas células U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133, a proteína de fusão se localiza no envelope nuclear em um padrão pontilhado característico dos complexos de poros nucleares. Como a marcação ocorre no locus endógeno, a estequiometria e a arquitetura dos complexos de poros nucleares (NPC) são minimamente perturbadas, tornando este modelo adequado para microscopia quantitativa de super-resolução, rastreamento de moléculas únicas e análises cinéticas da montagem e renovação dos NPCs.

Essa linhagem celular oferece uma plataforma robusta para o estudo do transporte nuclear, da dinâmica do tráfego nucleocitoplasmático, da biogênese dos NPCs durante a interfase e da remontagem nuclear pós-mitótica, bem como da organização estrutural do complexo Y dentro da estrutura dos poros. A linhagem U2OS apresenta morfologia plana e núcleos grandes, facilitando a obtenção de imagens de alta resolução. As células U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 são particularmente adequadas para experimentos de marcação do tipo “pulse-chase”, microscopia correlativa de luz e eletrônica, e abordagens de imagem multicolorida em combinação com nucleoporinas ou fatores de transporte adicionalmente marcados de forma endógena.

Tissue
Osso
Disease
Osteossarcoma
Metastatic site
Localização do tumor primário (osso)
Applications
Biologia do complexo de poros nucleares (NPC); Arquitetura do complexo Nup133/Y; biogênese do NPC; transporte nucleocitoplasmático; microscopia de super-resolução (STORM/PALM/STED); rastreamento de partículas individuais; marcação SNAP por pulso-perseguição; microscopia correlativa de luz e eletrônica; estequiometria quantitativa do NPC

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Adherent
GMO status
GMO-S1
GMO status details
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133) contains a CRISPR-introduced SNAPf-Nup133 fusion, enabling fluorescent tagging of the Nup133 nucleoporin. The insert is stably present. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Biosafety level
1

03Characteristics

Morphology
De tipo epitelial
Cell type
Células epiteliais (osteossarcoma)
Doubling time
aproximadamente 24 a 36 horas

04Identifiers

Citation
U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 (número de catálogo da Cytion 300666)
NCBI TaxID
9606
Depositor
Laboratório Ellenberg (EMBL)

05Expression and susceptibility

Protein expression
Nup133, SNAPf-tag

06Handling and culture

Culture medium
McCoys 5a, p: 3,0 g/L de glicose, p: glutamina estável, p: 2,0 mM de piruvato de sódio, p: 2,2 g/L de NaHCO₃ (número de artigo da Cytion 820200a)
Incubation atmosphere

37 °C, 5% de CO₂, atmosfera umidificada.

Supplements
Adicione ao meio 10% de FBS, 3,0 g/L de glicose, glutamina estável, 2,0 mM de piruvato de sódio, 2,2 g/L de NaHCO₃ e 1% de NEAA
Dissociation reagent
Accutase
Subculturing
Remova o meio antigo das células aderentes e lave-as com PBS sem cálcio nem magnésio. Para frascos T25, use 3 a 5 ml de PBS; para frascos T75, use 5 a 10 ml. Em seguida, cubra as células completamente com Accutase, utilizando 1 a 2 ml para frascos T25 e 2,5 ml para frascos T75. Deixe as células incubarem à temperatura ambiente por 8 a 10 minutos para que se desprendam. Após a incubação, misture delicadamente as células com 10 ml de meio para ressuspender, depois centrifugue a 300xg por 3 minutos. Descarte o sobrenadante, ressuspenda as células em meio fresco e transfira-as para novos frascos que já contenham meio fresco.
Split ratio
1 a 3
Seeding density
1 a 3 × 10⁴ células/cm²
Fluid renewal
2 a 3 vezes por semana
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

A contaminação por micoplasma é descartada por meio de ensaios baseados em PCR e de métodos de detecção de micoplasma baseados em luminescência.

Para garantir que não haja contaminação por bactérias, fungos ou leveduras, as culturas celulares são submetidas a inspeções visuais diárias.

Freeze medium
Como meio de criopreservação, utilizamos meio de crescimento completo (incluindo FBS) + 10% de DMSO para garantir viabilidade adequada após o descongelamento, ou CM-1 (número de catálogo da Cytion 800100), que inclui osmoprotetores e estabilizadores metabólicos otimizados para melhorar a recuperação e reduzir o estresse induzido pela criopreservação.
Storage conditions

Para preservação a longo prazo, coloque os frascos em nitrogênio líquido em fase de vapor a uma temperatura entre aproximadamente −150 e −196 °C. O armazenamento a −80 °C é aceitável apenas como uma etapa intermediária de curta duração antes da transferência para o nitrogênio líquido.

Shipping conditions

As linhagens celulares criopreservadas são enviadas em gelo seco, em embalagens isoladas e validadas, com refrigerante suficiente para manter a temperatura em aproximadamente −78 °C durante todo o transporte. Ao receber a remessa, inspecione o recipiente imediatamente e transfira os frascos sem demora para o local de armazenamento adequado.

08Donor

Donor age
15 anos
Ethnicity
caucasiano