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U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133
Tessuto
Osso
Malattia
Osteosarcoma
Sito metastatico
Sede del tumore primario (osso)

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U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133

Cell line · Codice prodotto 300666

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 is a genetically engineered human osteosarcoma cell line derived from the parental U2OS background in which the endogenous NUP133...

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01Informazioni generali

Descrizione

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 è una linea cellulare di osteosarcoma umano geneticamente modificata derivata dal background parentale U2OS in cui il locus NUP133 endogeno è stato modificato utilizzando l'editing genomico mediato da CRISPR/Cas9 per codificare un tag SNAPf C-terminale. NUP133 è un componente fondamentale del complesso Y (complesso NUP107-160), un sottocomplesso strutturale essenziale per l'assemblaggio e il mantenimento del complesso dei pori nucleari (NPC). Introducendo la sequenza codificante SNAPf in-frame nel locus endogeno, la proteina di fusione viene espressa sotto il controllo regolatorio nativo, preservando i livelli di espressione fisiologica e la localizzazione subcellulare.

Il tag SNAPf è una variante a marcatura rapida del tag SNAP, un O6-alchilguanina-DNA alchiltransferasi ingegnerizzato che reagisce in modo covalente con substrati coniugati con benzilguanina. Ciò consente una marcatura fluorescente altamente specifica e versatile di Nup133 in cellule vive o fissate utilizzando substrati SNAP permeabili o impermeabili alle cellule. Nelle cellule U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133, la proteina di fusione si localizza nell'involucro nucleare con un pattern puntiforme caratteristico dei complessi dei pori nucleari. Poiché l'etichettatura avviene nel locus endogeno, la stechiometria e l'architettura dell'NPC sono minimamente perturbate, rendendo questo modello adatto alla microscopia quantitativa a super risoluzione, al tracciamento di singole molecole e alle analisi cinetiche dell'assemblaggio e del turnover dell'NPC.

Questa linea cellulare fornisce una solida piattaforma per lo studio del trasporto nucleare, delle dinamiche del traffico nucleocitoplasmatico, della biogenesi degli NPC durante l'interfase e il riassemblaggio nucleare post-mitotico e dell'organizzazione strutturale del complesso Y all'interno dell'impalcatura dei pori. Il background U2OS offre una morfologia piatta e nuclei di grandi dimensioni, facilitando l'imaging ad alta risoluzione. Le cellule U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 sono particolarmente adatte per esperimenti di marcatura pulse-chase, microscopia ottica ed elettronica correlativa e approcci di imaging multicolore in combinazione con nucleoporine o fattori di trasporto marcati endogenamente aggiuntivi.

Tessuto
Osso
Malattia
Osteosarcoma
Sito metastatico
Sede del tumore primario (osso)
Applicazioni
Biologia del complesso dei pori nucleari (NPC); Architettura del complesso Nup133/Y; biogenesi dell'NPC; trasporto nucleocitoplasmatico; microscopia a super-risoluzione (STORM/PALM/STED); tracciamento di singole particelle; marcatura SNAP con tecnica pulse-chase; microscopia correlativa ottica ed elettronica; stechiometria quantitativa dell'NPC

02Classificazione

Organismo
Umano
Sesso
Donna
Proprietà di crescita
Aderente
Presenza di OGM
GMO-S1
Dettagli sullo stato degli OGM
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133) contains a CRISPR-introduced SNAPf-Nup133 fusion, enabling fluorescent tagging of the Nup133 nucleoporin. The insert is stably present. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Livello di biosicurezza
1

03Caratteristiche

Morfologia
Simile all'epitelio
Tipo di cellula
Cellule epiteliali (osteosarcoma)
Tempo di raddoppio
circa da 24 a 36 ore

04Identificatori

Riferimento bibliografico
U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup133 (numero di catalogo Cytion 300666)
Codice fiscale NCBI
9606
Depositario
Il laboratorio Ellenberg (EMBL)

05Espressione e suscettibilità

Espressione proteica
Nup133, etichetta SNAPf

06Manipolazione e coltura

Terreno di coltura
McCoys 5a, w: 3,0 g/L Glucosio, w: Glutammina stabile, w: 2,0 mM Sodio piruvato, w: 2,2 g/L NaHCO3 (articolo Cytion numero 820200a)
Atmosfera di incubazione

37°C, 5%CO2, atmosfera umidificata.

Integratori
Integrare il terreno di coltura con 10% FBS, 3,0 g/L di glucosio, Glutammina stabile, 2,0 mM di piruvato di sodio, 2,2 g/L di NaHCO3, 1% di NEAA
Reagente di dissociazione
Accutase
Subcoltura
Rimuovere il vecchio terreno dalle cellule aderenti e lavarle con PBS privo di calcio e magnesio. Per le fiasche T25, utilizzare 3-5 ml di PBS e per le fiasche T75, 5-10 ml. Quindi, coprire completamente le cellule con Accutase, utilizzando 1-2 ml per le fiasche T25 e 2,5 ml per le fiasche T75. Lasciare incubare le cellule a temperatura ambiente per 8-10 minuti per staccarle. Dopo l'incubazione, mescolare delicatamente le cellule con 10 ml di terreno per risospenderle, quindi centrifugare a 300xg per 3 minuti. Scartare il surnatante, risospendere le cellule in terreno fresco e trasferirle in nuove fiasche contenenti terreno fresco.
Rapporto di frazionamento
da 1 a 3
Densità di semina
da 1 a 3 × 10⁴ cellule/cm²
Rinnovo dei fluidi
da 2 a 3 volte alla settimana
Scongelamento e coltura
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Controllo di qualità e crioconservazione

Sterilità

La contaminazione da micoplasma viene esclusa utilizzando sia saggi basati sulla PCR sia metodi di rilevamento del micoplasma basati sulla luminescenza.

Per garantire l'assenza di contaminazione batterica, fungina o da lieviti, le colture cellulari sono sottoposte a ispezioni visive quotidiane.

Terreno di coltura congelato
Come terreno di crioconservazione, utilizziamo un terreno di crescita completo (incluso FBS) + 10% DMSO per un'adeguata vitalità post-scongelamento, o CM-1 (numero di catalogo Cytion 800100), che include osmoprotettori e stabilizzatori metabolici ottimizzati per migliorare il recupero e ridurre lo stress crio-indotto.
Condizioni di conservazione

Per la conservazione a lungo termine, porre le fiale in azoto liquido in fase vapore a una temperatura compresa tra -150 e -196 °C circa. La conservazione a -80 °C è accettabile solo come breve fase intermedia prima del trasferimento in azoto liquido.

Condizioni di spedizione

Le linee cellulari crioconservate vengono spedite su ghiaccio secco in confezioni isolate e convalidate, con una quantità di refrigerante sufficiente a mantenere circa -78 °C durante il trasporto. Al ricevimento, ispezionare immediatamente il contenitore e trasferire immediatamente le fiale in un luogo di conservazione appropriato.

08Donatore

Età dei donatori
15 anni
Etnia
Caucasico