Gå direkte til indholdet
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP
Væv
Knogle
Sygdom
Osteosarkom
Metastasested
Primær tumorlokalisation (knogle)

Dokumenter

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP

Cell line · Varenummer 300667

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous TPR (Translocated Promoter Region) ge...

€800.00ekskl. moms og fragt
På lager
Lot
Anbefalet (det nyeste parti)
  • CoA
1

01Generelle oplysninger

Beskrivelse

U2OS-CRISPR-TPR-SNAP er en genomredigeret human osteosarkomcellelinje afledt af U2OS-celler, hvor det endogene TPR-gen (Translocated Promoter Region) er blevet modificeret ved hjælp af CRISPR/Cas9-teknologi til at kode for et in-frame SNAP-tag. TPR er et stort coiled-coil-nukleoporin, der lokaliseres til kernekurven på den nukleoplasmatiske side af kerneporekomplekset (NPC). Ved at mærke TPR på dets endogene locus udtrykkes fusionsproteinet under naturlig regulatorisk kontrol, hvilket bevarer fysiologiske ekspressionsniveauer og opretholder korrekt inkorporering i kernekurvstrukturen.

SNAP-tagget muliggør kovalent mærkning af TPR med benzylguanin-konjugerede fluorescerende substrater i levende eller fiksede celler, hvilket giver mulighed for højt specifik og stabil visualisering. I U2OS-CRISPR-TPR-SNAP-celler viser mærket TPR en karakteristisk punktformet ringlignende fordeling ved kernehinden, svarende til NPC-associerede nukleare kurvstrukturer. Dette system er velegnet til kvantitativ fluorescensmikroskopi, superopløsningsbilleddannelse, puls-chase-mærkning og dynamiske studier af nuklear kurvsamling og omsætning. Den flade morfologi og de store kerner i U2OS-celler letter højopløsningsbilleddannelse af kernehindeassocierede strukturer.

TPR spiller en afgørende rolle i mRNA-eksport, regulering af nuklear transport, kromatinorganisation ved kerneperiferien og rumlig genomorganisation. TPR er også impliceret i dannelsen af nukleare transportrelaterede underkompartimenter og i udelukkelsen af heterokromatin fra nukleare porerelaterede regioner. U2OS-CRISPR-TPR-SNAP udgør en fysiologisk relevant model til at analysere arkitekturen og dynamikken i nukleare kurve, undersøge nukleocytoplasmatiske transportmekanismer og studere nukleare membranrelaterede kromatininteraktioner under endogene ekspressionsbetingelser.

Væv
Knogle
Sygdom
Osteosarkom
Metastasested
Primær tumorlokalisation (knogle)
Anvendelser
Kernekurvbiologi; TPR-medieret mRNA-eksport; regulering af transporten mellem kerne og cytoplasma; kromatinorganisering ved kernens periferi; underkompartimenter for kernetransport; genomets rumlige organisering; superopløsningsmikroskopi; SNAP-pulse-chase-mærkning; udelukkelse af heterokromatin fra poreassocierede områder

02Klassificering

Organisme
Menneske
Køn
Kvinde
Vækstegenskaber
Tilhænger
GMO-status
GMO-S1
Oplysninger om GMO-status
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-TPR-SNAP) contains a CRISPR-engineered TPR-SNAP fusion enabling fluorescent and chemical labeling of the TPR nuclear basket protein. The construct is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Biosikkerhedsniveau
1

03Egenskaber

Morfologi
Epitel-lignende
Celletype
Epithelceller (osteosarkom)
Fordoblingstid
ca. 24 til 36 timer

04Identifikatorer

Kildehenvisning
U2OS-CRISPR-TPR-SNAP (Cytion katalognummer 300667)
NCBI-skattenummer
9606
Indskyder
Ellenberg-laboratoriet (EMBL)

05Udtryk og modtagelighed

Proteinekspression
TPR, SNAP-tag

06Håndtering og opdræt

Næringsmedium
McCoys 5a, w: 3,0 g/L Glukose, w: stabil Glutamin, w: 2,0 mM Natriumpyruvat, w: 2,2 g/L NaHCO3 (Cytion artikelnummer 820200a)
Inkubationsatmosfære

37°C, 5%CO2, befugtet atmosfære.

Kosttilskud
Suppler mediet med 10 % FBS, 3,0 g/L glukose, stabil glutamin, 2,0 mM natriumpyruvat, 2,2 g/L NaHCO3, 1 % NEAA
Dissociationsreagens
Accutase
Oddyrkning
Fjern det gamle medium fra de klæbende celler, og vask dem med PBS, der ikke indeholder calcium og magnesium. Brug 3-5 ml PBS til T25-kolber og 5-10 ml til T75-kolber. Dæk derefter cellerne helt med Accutase, brug 1-2 ml til T25-kolber og 2,5 ml til T75-kolber. Lad cellerne inkubere ved stuetemperatur i 8-10 minutter for at løsne dem. Efter inkubationen blandes cellerne forsigtigt med 10 ml medium for at resuspendere dem, og centrifugeres derefter ved 300xg i 3 minutter. Kassér supernatanten, resuspender cellerne i frisk medium, og overfør dem til nye kolber, der allerede indeholder frisk medium.
Opdelingsforhold
1 til 3
Såtæthed
1 til 3 × 10⁴ celler/cm²
Væskeudskiftning
2 til 3 gange om ugen
Optøning og dyrkning
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kvalitetskontrol og kryopræservering

Sterilitet

Mycoplasma-kontaminering udelukkes ved hjælp af både PCR-baserede assays og luminescensbaserede mycoplasma-detektionsmetoder.

For at sikre, at der ikke er nogen bakterie-, svampe- eller gærforurening, underkastes cellekulturerne daglige visuelle inspektioner.

Frysemedium
Som kryopræserveringsmedium bruger vi komplet vækstmedium (inklusive FBS) + 10 % DMSO for tilstrækkelig levedygtighed efter optøning eller CM-1 (Cytion-katalognummer 800100), som indeholder optimerede osmobeskyttende stoffer og metaboliske stabilisatorer for at forbedre genopretningen og reducere kryo-induceret stress.
Opbevaringsbetingelser

For langtidsopbevaring anbringes hætteglas i flydende nitrogen i dampfase ved ca. -150 til -196 °C. Opbevaring ved -80 °C er kun acceptabelt som et kort mellemtrin før overførsel til flydende nitrogen.

Leveringsbetingelser

Kryopræserverede cellelinjer sendes på tøris i valideret, isoleret emballage med tilstrækkeligt kølemiddel til at opretholde ca. -78 °C under hele transporten. Ved modtagelse skal beholderen straks inspiceres, og hætteglassene skal straks overføres til passende opbevaring.

08Donor

Donorens alder
15 år
Etnisk tilhørsforhold
Kaukasisk