Ga naar de inhoud
U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2
Weefsel
Bot
Ziekte
Osteosarcoom
Plaats van uitzaaiingen
Locatie van de primaire tumor (bot)

Documenten

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2

Cell line · Productnummer 300663

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous RANBP2 (also known as NUP3...

€800.00excl. btw en verzendkosten
Op voorraad
Lot
Aanbevolen (verste partij)
1

01Algemene informatie

Beschrijving

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 is een genoombewerkte menselijke osteosarcoomcellijn afgeleid van U2OS-cellen waarin de endogene RANBP2-locus (ook bekend als NUP358) is gemodificeerd door CRISPR/Cas9 om een SNAPf-tag in-frame met het natuurlijke eiwit te coderen. Nup358/RanBP2 is een groot nucleoporine dat zich bevindt in de cytoplasmatische filamenten van het nucleaire poriecomplex (NPC) en een cruciale rol speelt in nucleocytoplasmatisch transport, SUMOylatie en mitotische processen. Endogene tagging zorgt ervoor dat SNAPf-Nup358 wordt uitgedrukt onder fysiologische promotorcontrole, waardoor de natuurlijke expressieniveaus behouden blijven en artefacten die verband houden met overexpressiesystemen tot een minimum worden beperkt.

De SNAPf-tag is een snel labelende variant van de SNAP-tag die covalent bindt aan benzylguanine-geconjugeerde substraten, waardoor selectieve en stabiele fluorescerende labeling van Nup358 in levende of gefixeerde cellen mogelijk is. In U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2-cellen lokaliseert het fusie-eiwit zich in de kernmembraan in een puntvormige verdeling die kenmerkend is voor cytoplasmatische NPC-filamenten. Deze configuratie ondersteunt hoge-resolutie fluorescentiebeeldvorming, superresolutiemicroscopie, pulse-chase-labeling en single-molecule tracking-benaderingen om de architectuur en dynamica van NPC te bestuderen. De vlakke morfologie en grote kernen van U2OS-cellen vergemakkelijken bovendien kwantitatieve beeldvorming van kernmembraanstructuren.

Dit model maakt het mogelijk om de specifieke rol van Nup358 te onderzoeken in CRM1/exportine-afhankelijke nucleaire export, Ran GTPase-cyclusregulatie en de ruimtelijke organisatie van cytoplasmatische transportplatforms. Gezien de betrokkenheid van Nup358 bij de assemblage van de mitotische spindel en de kinetochorefunctie, is de cellijn ook geschikt voor het bestuderen van de celcyclusafhankelijke herverdeling van nucleoporines en NPC-demontage/herassemblage tijdens mitose. U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 biedt een fysiologisch relevant platform voor het ontleden van structurele en functionele aspecten van het cytoplasmatische oppervlak van het nucleaire poriecomplex in menselijke cellen.

Weefsel
Bot
Ziekte
Osteosarcoom
Plaats van uitzaaiingen
Locatie van de primaire tumor (bot)
Toepassingen
Biologie van de cytoplasmatische filamenten van het nucleaire poriecomplex; Nup358/RanBP2 bij de door CRM1 gemedieerde nucleaire export; Ran-GTPase-cyclus; SUMO-route; opbouw van de mitotische spindel; tracking van afzonderlijke deeltjes; superresolutiemicroscopie; SNAP-pulse-chase-markering; architectuur van het cytoplasmatische oppervlak van het NPC

02Classificatie

Organisme
Mens
Seks
Vrouw
Groei-eigenschappen
Aanhanger
GGO-status
GMO-S1
Details over de GGO-status
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2) contains a CRISPR-engineered SNAPf-Nup358/RanBP2 fusion enabling precise labeling of nuclear pore cytoplasmic fibrils. The modification is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Bioveiligheidsniveau
1

03Kenmerken

Morfologie
Epitheelachtig
Celtype
Epitheelcellen (osteosarcoom)
Verdubbelingstijd
ongeveer 24 tot 36 uur

04Identificatiegegevens

Bronvermelding
U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 (Cytion catalogusnummer 300663)
NCBI-belastingnummer
9606
Inlegger
Het Ellenberg Lab (EMBL)

05Expressie en vatbaarheid

Eiwit-expressie
Nup358/RanBP2, SNAPf-tag

06Behandeling en kweek

Kweekmedium
McCoys 5a, w: 3,0 g/L Glucose, w: stabiel Glutamine, w: 2,0 mM Natriumpyruvaat, w: 2,2 g/L NaHCO3 (Cytion artikelnummer 820200a)
Incubatieomgeving

37°C, 5%CO2, bevochtigde atmosfeer.

Supplementen
Vul het medium aan met 10% FBS, 3,0 g/L Glucose, stabiele Glutamine, 2,0 mM Natriumpyruvaat, 2,2 g/L NaHCO3, 1% NEAA
Dissociatiereagens
Accutase
Heruitplanten
Verwijder het oude medium van de adherente cellen en was ze met PBS zonder calcium en magnesium. Gebruik voor T25-flesjes 3-5 ml PBS en voor T75-flesjes 5-10 ml. Bedek de cellen vervolgens volledig met Accutase, met 1-2 ml voor T25-flesjes en 2,5 ml voor T75-flesjes. Laat de cellen gedurende 8-10 minuten bij kamertemperatuur incuberen om ze los te maken. Na incubatie de cellen voorzichtig mengen met 10 ml medium om ze te resuspenderen en vervolgens centrifugeren bij 300xg gedurende 3 minuten. Gooi het supernatant weg, resuspendeer de cellen in vers medium en breng ze over in nieuwe kolven die al vers medium bevatten.
Splitsingsverhouding
1 tot en met 3
Zaaidichtheid
1 tot 3 × 10⁴ cellen/cm²
Vloeistofverversing
2 tot 3 keer per week
Ontdooien en kweken
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kwaliteitscontrole en cryopreservatie

Onvruchtbaarheid

Mycoplasmaverontreiniging wordt uitgesloten met zowel PCR-gebaseerde testen als op luminescentie gebaseerde mycoplasmadetectiemethoden.

Om er zeker van te zijn dat er geen besmetting is met bacteriën, schimmels of gisten, worden de celculturen dagelijks onderworpen aan visuele inspecties.

Kweekmedium invriezen
Als cryoconserveringsmedium gebruiken we volledig groeimedium (inclusief FBS) + 10% DMSO voor voldoende levensvatbaarheid na het ontdooien, of CM-1 (Cytion catalogusnummer 800100), dat geoptimaliseerde osmoprotectanten en metabolische stabilisatoren bevat om het herstel te verbeteren en door cryo geïnduceerde stress te verminderen.
Opslagvoorwaarden

Voor langdurige bewaring plaatst u flesjes in vloeibare stikstof in dampfase bij ongeveer -150 tot -196 °C. Opslag bij -80 °C is alleen aanvaardbaar als korte tussenstap vóór overbrenging naar vloeibare stikstof.

Verzendvoorwaarden

Gecryopreserveerde cellijnen worden verzonden op droog ijs in gevalideerde, geïsoleerde verpakkingen met voldoende koelmiddel om gedurende het transport ongeveer -78 °C te handhaven. Inspecteer de verpakking onmiddellijk na ontvangst en breng de flacons onverwijld over naar de juiste opslagplaats.

08Donateur

Leeftijd van de donor
15 jaar
Etnische afkomst
Kaukasisch