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U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2
Tissue
Hueso
Disease
Osteosarcoma
Metastatic site
Localización del tumor primario (hueso)

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U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2

Cell line · Product number 300663

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous RANBP2 (also known as NUP3...

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1

01General information

Description

U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 es una línea celular de osteosarcoma humano editada genómicamente, derivada de células U2OS, en la que el locus endógeno de RANBP2 (también conocida como NUP358) ha sido modificado mediante CRISPR/Cas9 para codificar una etiqueta SNAPf en marco de lectura con la proteína nativa. Nup358/RanBP2 es una nucleoporina de gran tamaño localizada en los filamentos citoplasmáticos del complejo de poros nucleares (NPC) y desempeña funciones críticas en el transporte nucleocitoplasmático, la SUMOilación y los procesos mitóticos. El etiquetado endógeno garantiza que SNAPf-Nup358 se exprese bajo el control de un promotor fisiológico, lo que mantiene los niveles de expresión nativos y minimiza los artefactos asociados con los sistemas de sobreexpresión.

La etiqueta SNAPf es una variante de marcaje rápido de la etiqueta SNAP que se une covalentemente a sustratos conjugados con bencilguanina, lo que permite el marcaje fluorescente selectivo y estable de Nup358 en células vivas o fijadas. En las células U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2, la proteína de fusión se localiza en la envoltura nuclear con una distribución punteada característica de los filamentos citoplasmáticos del NPC. Esta configuración permite el uso de imágenes de fluorescencia de alta resolución, microscopía de superresolución, marcaje de pulso-persecución y técnicas de seguimiento de moléculas individuales para estudiar la arquitectura y la dinámica del NPC. La morfología plana y los núcleos grandes de las células U2OS facilitan aún más la obtención de imágenes cuantitativas de las estructuras de la envoltura nuclear.

Este modelo permite investigar las funciones específicas de Nup358 en la exportación nuclear dependiente de CRM1/exportina, la regulación del ciclo de la GTPasa Ran y la organización espacial de las plataformas de transporte citoplasmático. Dada la participación de Nup358 en el ensamblaje del huso mitótico y la función del cinetocoro, la línea celular también es adecuada para estudiar la redistribución de las nucleoporinas dependiente del ciclo celular y el desmontaje/reensamblaje del NPC durante la mitosis. U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 ofrece una plataforma fisiológicamente relevante para analizar los aspectos estructurales y funcionales de la cara citoplasmática del complejo de poros nucleares en células humanas.

Tissue
Hueso
Disease
Osteosarcoma
Metastatic site
Localización del tumor primario (hueso)
Applications
Biología de los filamentos citoplasmáticos del complejo de poros nucleares; Nup358/RanBP2 en la exportación nuclear mediada por CRM1; ciclo de la GTPasa Ran; vía SUMO; ensamblaje del huso mitótico; seguimiento de partículas individuales; microscopía de superresolución; marcaje SNAP por pulso-persecución; arquitectura de la cara citoplasmática del NPC

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Adherent
GMO status
GMO-S1
GMO status details
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2) contains a CRISPR-engineered SNAPf-Nup358/RanBP2 fusion enabling precise labeling of nuclear pore cytoplasmic fibrils. The modification is stably integrated. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Biosafety level
1

03Characteristics

Morphology
De tipo epitelial
Cell type
Células epiteliales (osteosarcoma)
Doubling time
aprox. de 24 a 36 horas

04Identifiers

Citation
U2OS-CRISPR-SNAPf-Nup358/RanBP2 (número de catálogo de Cytion 300663)
NCBI TaxID
9606
Depositor
El Laboratorio Ellenberg (EMBL)

05Expression and susceptibility

Protein expression
Nup358/RanBP2, etiqueta SNAPf

06Handling and culture

Culture medium
McCoys 5a, p: 3,0 g/L de glucosa, p: glutamina estable, p: 2,0 mM de piruvato de sodio, p: 2,2 g/L de NaHCO₃ (número de artículo de Cytion 820200a)
Incubation atmosphere

37 °C, 5 % de CO₂, atmósfera humidificada.

Supplements
Añade al medio un 10 % de FBS, 3,0 g/L de glucosa, glutamina estable, 2,0 mM de piruvato de sodio, 2,2 g/L de NaHCO₃ y un 1 % de NEAA.
Dissociation reagent
Accutase
Subculturing
Retira el medio usado de las células adheridas y lávalas con PBS sin calcio ni magnesio. Para los frascos T25, usa de 3 a 5 ml de PBS, y para los frascos T75, usa de 5 a 10 ml. Luego, cubra las células por completo con Accutase, utilizando de 1 a 2 ml para los frascos T25 y 2,5 ml para los frascos T75. Deje que las células se incuben a temperatura ambiente durante 8 a 10 minutos para desprenderse. Después de la incubación, mezcla suavemente las células con 10 ml de medio para resuspendarlas; luego, centrifuga a 300xg durante 3 minutos. Deseche el sobrenadante, resuspenda las células en medio fresco y transfiéralas a frascos nuevos que ya contengan medio fresco.
Split ratio
1 a 3
Seeding density
De 1 a 3 × 10⁴ células/cm²
Fluid renewal
De 2 a 3 veces por semana
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

Se descarta la contaminación por micoplasmas mediante ensayos basados en PCR y métodos de detección de micoplasmas basados en luminiscencia.

Para garantizar que no haya contaminación bacteriana, fúngica o por levaduras, los cultivos celulares se someten a inspecciones visuales diarias.

Freeze medium
Como medio de criopreservación, utilizamos un medio de crecimiento completo (que incluye FBS) + 10 % de DMSO para garantizar una viabilidad adecuada tras la descongelación, o CM-1 (número de catálogo de Cytion 800100), que incluye osmoprotectores y estabilizadores metabólicos optimizados para mejorar la recuperación y reducir el estrés inducido por la criopreservación.
Storage conditions

Para la conservación a largo plazo, coloque los viales en nitrógeno líquido en fase de vapor a una temperatura de entre −150 y −196 °C, aproximadamente. El almacenamiento a −80 °C solo es aceptable como un paso intermedio breve antes de transferirlos al nitrógeno líquido.

Shipping conditions

Las líneas celulares criopreservadas se envían en hielo seco, en un embalaje aislante validado que contiene suficiente refrigerante para mantener una temperatura de aproximadamente −78 °C durante todo el transporte. Al recibir el envío, revise el contenedor de inmediato y traslade los viales sin demora al lugar de almacenamiento adecuado.

08Donor

Donor age
15 años
Ethnicity
caucásico