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U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1
Tissue
Os
Disease
Ostéosarcome
Metastatic site
Site de la tumeur primaire (os)

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U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1

Cell line · Product number 300664

U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous SEH1L (SEH1) gene has been modified...

US$800.00excl. tax and shipping
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1

01General information

Description

U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 est une lignée cellulaire d’ostéosarcome humain modifiée génomiquement, dérivée de cellules U2OS, dans laquelle le gène endogène SEH1L (SEH1) a été modifié à l’aide de la technologie CRISPR/Cas9 afin de coder pour un marqueur SNAPf sans décalage de cadre de lecture. SEH1 est un composant du complexe Y (également appelé complexe NUP107-160), un module structurel central du complexe des pores nucléaires (NPC) qui contribue à l’assemblage et à la stabilité de la charpente des pores. En insérant la séquence codante du SNAPf au locus endogène, la protéine SEH1 marquée est exprimée sous le contrôle régulateur natif, ce qui préserve les niveaux d’expression physiologiques et minimise les perturbations de la composition des pores nucléaires.

La balise SNAPf est une variante modifiée et à réaction rapide de la balise SNAP qui se lie de manière covalente à des substrats conjugués à la benzylguanine, permettant un marquage fluorescent sélectif et stable dans des cellules vivantes ou fixées. Dans les cellules U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1, la protéine de fusion se localise sur l’enveloppe nucléaire selon un motif ponctuel caractéristique de la distribution des NPC. Comme le marquage se fait aux niveaux des protéines endogènes, ce système est particulièrement adapté à la microscopie à fluorescence quantitative, à l’imagerie à super-résolution et aux analyses de suivi de particules individuelles visant à disséquer l’organisation et la stœchiométrie des NPC. La morphologie aplatie et les gros noyaux des cellules U2OS facilitent encore davantage la visualisation à haute résolution des structures de l’enveloppe nucléaire.

SEH1 participe à la biogenèse des NPC et a également été impliqué dans des processus associés au kinétochore au cours de la mitose. Par conséquent, cette lignée cellulaire offre une plateforme robuste pour étudier l’assemblage et le désassemblage des NPC en fonction du cycle cellulaire, l’organisation spatiale du complexe Y au sein de la charpente des pores, ainsi que les doubles rôles potentiels de SEH1 au niveau de l’enveloppe nucléaire et des kinétochores mitotiques. La lignée U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 permet de mener des études mécanistiques sur l’architecture et la dynamique des pores nucléaires dans des conditions d’expression physiologiquement pertinentes.

Tissue
Os
Disease
Ostéosarcome
Metastatic site
Site de la tumeur primaire (os)
Applications
Biologie du complexe Y/complexe NUP107-160; rôle de SEH1 dans l'assemblage de la structure portante du NPC; composants du NPC associés au kinétochore; stœchiométrie du NPC; marquage par la technique « pulse-chase » avec SNAP; microscopie à super-résolution; biogenèse du NPC; désassemblage et réassemblage du NPC pendant la mitose

02Classification

Organism
Human
Sex
Female
Growth properties
Adherent
GMO status
GMO-S1
GMO status details
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1) contains a CRISPR-mediated SNAPf-SEH1 fusion that allows selective labeling of the SEH1 nucleoporin. The modification is stably present. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Biosafety level
1

03Characteristics

Morphology
De type épithélial
Cell type
Cellules épithéliales (ostéosarcome)
Doubling time
environ 24 à 36 heures

04Identifiers

Citation
U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 (numéro de catalogue Cytion 300664)
NCBI TaxID
9606
Depositor
Le laboratoire Ellenberg (EMBL)

05Expression and susceptibility

Protein expression
SEH1, marqueur SNAPf

06Handling and culture

Culture medium
McCoys 5a, w : 3,0 g/L de glucose, w : stable; glutamine, w : 2,0 mM de pyruvate de sodium, w : 2,2 g/L de NaHCO₃ (référence Cytion 820200a)
Incubation atmosphere

37 °C, 5 % de CO₂, atmosphère humidifiée.

Supplements
Ajouter au milieu 10 % de FBS, 3,0 g/L de glucose, de la glutamine stable, 2,0 mM de pyruvate de sodium, 2,2 g/L de NaHCO₃ et 1 % de NEAA.
Dissociation reagent
Accutase
Subculturing
Retirez l’ancien milieu des cellules adhérentes et lavez-les avec du PBS sans calcium ni magnésium. Pour les flacons T25, utilisez 3 à 5 ml de PBS, et pour les flacons T75, utilisez 5 à 10 ml. Ensuite, recouvrez complètement les cellules d’Accutase, en utilisant 1 à 2 ml pour les flacons T25 et 2,5 ml pour les flacons T75. Laissez les cellules incuber à température ambiante pendant 8 à 10 minutes afin de les détacher. Après l’incubation, mélangez délicatement les cellules avec 10 ml de milieu pour les remettre en suspension, puis centrifugez à 300 x g pendant 3 minutes. Éliminez le surnageant, remettez les cellules en suspension dans du milieu frais, puis transférez-les dans de nouveaux flacons contenant déjà du milieu frais.
Split ratio
1 à 3
Seeding density
de 1 à 3 × 10⁴ cellules/cm²
Fluid renewal
2 à 3 fois par semaine
Thawing and culturing
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Quality control and cryopreservation

Sterility

La contamination par les mycoplasmes est exclue à l'aide de tests basés sur la PCR et de méthodes de détection des mycoplasmes par luminescence.

Afin de s’assurer qu’il n’y a aucune contamination bactérienne, fongique ou par des levures, les cultures cellulaires font l’objet d’inspections visuelles quotidiennes.

Freeze medium
Comme milieu de cryoconservation, nous utilisons un milieu de croissance complet (contenant du sérum fœtal bovin) + 10 % de DMSO pour assurer une viabilité adéquate après décongélation, ou du CM-1 (référence Cytion 800100), qui contient des osmoprotecteurs et des stabilisateurs métaboliques optimisés pour améliorer la récupération et réduire le stress induit par la cryoconservation.
Storage conditions

Pour une conservation à long terme, placez les flacons dans de l’azote liquide en phase vapeur à une température comprise entre environ −150 et −196 °C. L’entreposage à −80 °C n’est acceptable qu’à titre d’étape intermédiaire de courte durée avant le transfert dans l’azote liquide.

Shipping conditions

Les lignées cellulaires cryoconservées sont expédiées dans de la glace sèche, dans un emballage isotherme validé contenant suffisamment de réfrigérant pour maintenir une température d’environ −78 °C pendant tout le transport. À la réception, inspectez immédiatement le conteneur et transférez sans délai les flacons dans un lieu de stockage approprié.

08Donor

Donor age
15 ans
Ethnicity
caucasien