Mine otse sisu juurde
U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1
Kude
Bone
Haigus
Osteosarkoom
Metastaaside asukoht
Esmane kasvaja asukoht (luu)

Dokumendid

U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1

Cell line · Toote number 300664

U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 is a genome-edited human osteosarcoma cell line derived from U2OS cells in which the endogenous SEH1L (SEH1) gene has been modified...

€800.00ilma käibemaksu ja saatmiskuludeta
Tellimusel valmistatud
1

01Üldine teave

Kirjeldus

U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 on genoomi redigeeritud inimese osteosarkoomi rakuliin, mis on saadud U2OS rakkudest, milles endogeenne SEH1L (SEH1) geen on modifitseeritud CRISPR/Cas9 tehnoloogia abil, et kodeerida in-frame SNAPf märgistust. SEH1 on Y-kompleksi (tuntud ka kui NUP107-160 kompleks) komponent, tuumapooride kompleksi (NPC) keskne struktuurimoodul, mis aitab kaasa pooride raamistiku kokkupanekule ja stabiilsusele. SNAPf kodeeriva järjestuse sisestamisega endogeensesse lokusesse ekspresseeritakse märgistatud SEH1 valku loomuliku regulatiivse kontrolli all, säilitades füsioloogilised ekspressioonitasemed ja minimeerides tuumapooride koostise häireid.

SNAPf-märgis on SNAP-märgise insenereeritud, kiiresti reageeriv variant, mis seondub kovalentselt bentsüülguaniiniga konjugeeritud substraatidega, võimaldades selektiivset ja stabiilset fluorestsentsmärgistamist elusates või fikseeritud rakkudes. U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 rakkudes lokaliseerub fusioonvalk tuumaümbrise punktide mustris, mis on iseloomulik NPC jaotusele. Kuna märgistamine toimub endogeensete valkude tasemel, sobib see süsteem hästi kvantitatiivseks fluorestsentsmikroskoopiasse, üliresolutsioonilisse pildistamisse ja ühe osakese jälgimise analüüsidesse, mille eesmärk on NPC organisatsiooni ja stoikiomeetria analüüsimine. U2OS rakkude lame morfoloogia ja suured tuumad hõlbustavad veelgi tuumaümbrise struktuuride kõrge resolutsiooniga visualiseerimist.

SEH1 osaleb NPC biogeneesis ja on seotud ka mitootiliste protsessidega, mis on seotud kinetokooridega. Seega pakub see rakuliin tugeva platvormi raku tsüklist sõltuva NPC kokkupaneku ja lahtivõtmise, Y-kompleksi ruumilise organiseerumise pooride raamistikus ning SEH1 potentsiaalse kahepoolse rolli uurimiseks tuumaümbrise ja mitootiliste kinetokooride puhul. U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 võimaldab uurida tuumapooride arhitektuuri ja dünaamikat füsioloogiliselt asjakohastes ekspressioonitingimustes.

Kude
Bone
Haigus
Osteosarkoom
Metastaaside asukoht
Esmane kasvaja asukoht (luu)
Rakendused
Y-kompleksi/NUP107-160 kompleksi bioloogia; SEH1 NPC raamistiku moodustumisel; kinetokooriga seotud NPC komponendid; NPC stoikiomeetria; SNAP-impulss-jälgimise märgistamine; üliresolutsiooniline mikroskoopia; NPC biogenees; mitootiline NPC lagunemine ja taaskogunemine

02Klassifikatsioon

Organism
Inimene
Sugu
Naine
Kasvuvõime
Järgija
GMO-staatus
GMO-S1
GMO-staatuse üksikasjad
GMO-S1: This human osteosarcoma cell line (U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1) contains a CRISPR-mediated SNAPf-SEH1 fusion that allows selective labeling of the SEH1 nucleoporin. The modification is stably present. This classification applies only within Germany and may differ elsewhere.
Bioloogilise ohutuse tase
1

03Omadused

Morfoloogia
Epiteelilaadsed
Rakutüüp
Epiteelrakud (osteosarkoom)
Kahekordistumisaeg
umbes 24–36 tundi

04Tunnused

Viide
U2OS-CRISPR-SNAPf-SEH1 (Cytioni katalooginumber 300664)
NCBI maksukood
9606
Hoiustaja
Ellenbergi labor (EMBL)

05Avaldumine ja vastuvõtlikkus

Valgu ekspressioon
SEH1, SNAPf-tag

06Käsitlemine ja kasvatamine

Kasvatuskeskkond
McCoys 5a, w: 3,0 g/L glükoos, w: stabiilne glutamiin, w: 2,0 mM naatriumpüruvaat, w: 2,2 g/L NaHCO3 (Cytioni artikli number 820200a)
Inkubatsiooni keskkond

37°C, 5%CO2, niisutatud atmosfäär.

Toidulisandid
Täiendada söötme 10% FBS, 3,0 g/L glükoosi, stabiilse glutamiini, 2,0 mM naatriumpüruvaadi, 2,2 g/L NaHCO3, 1% NEAAga
Dissotsiatsioonireaktiiv
Accutase
Kultuuri edasikasvatamine
Eemaldage kleepunud rakkudelt vana söötme ja peske neid PBS-ga, milles puudub kaltsium ja magneesium. T25 kolbide puhul kasutage 3-5 ml PBS-i ja T75 kolbide puhul 5-10 ml. Seejärel katke rakud täielikult Accutase'iga, kasutades 1-2 ml T25 kolbide puhul ja 2,5 ml T75 kolbide puhul. Laske rakkudel inkubeerida 8-10 minutit toatemperatuuril, et need eralduksid. Pärast inkubeerimist segage rakud ettevaatlikult 10 ml söötmega, et neid resuspenseerida, seejärel tsentrifuugige 3 minutit 300xg juures. Visake supernatant ära, suspenseerige rakud uuesti värskes keskkonnas ja viige need uutesse kolvidesse, mis sisaldavad juba värsket keskkonda.
Jagamissuhe
1–3
Külvitihedus
1–3 × 10⁴ rakku/cm²
Vedeliku vahetus
2 kuni 3 korda nädalas
Sulatamine ja kasvatamine
  1. Confirm that the vial remains deeply frozen upon delivery, as cells are shipped on dry ice to maintain optimal temperatures during transit.

  2. Upon receipt, either store the cryovial immediately at temperatures below -150°C to ensure the preservation of cellular integrity, or proceed to step 3 if immediate culturing is required.

  3. For immediate culturing, swiftly thaw the vial by immersing it in a 37°C water bath with clean water and an antimicrobial agent, agitating gently for 40-60 seconds until a small ice clump remains.

  4. Perform all subsequent steps under sterile conditions in a flow hood, disinfecting the cryovial with 70% ethanol before opening.

  5. Carefully open the disinfected vial and transfer the cell suspension into a 15 ml centrifuge tube containing 8 ml of room-temperature culture medium, mixing gently.

  6. Centrifuge the mixture at 300 x g for 3 minutes to separate the cells and carefully discard the supernatant containing residual freezing medium.

  7. Gently resuspend the cell pellet in 10 ml of fresh culture medium. For adherent cells, divide the suspension between two T25 culture flasks; for suspension cultures, transfer all the medium into one T25 flask to promote effective cell interaction and growth.

  8. Adhere to established subculture protocols for continued growth and maintenance of the cell line, ensuring reliable experimental outcomes.

07Kvaliteedikontroll ja krüokonserveerimine

Viljatus

Mükoplasmakontaminatsioon on välistatud nii PCR-põhiste analüüside kui ka luminestsentsil põhinevate mükoplasma tuvastamise meetodite abil.

Bakteriaalse, seene- või pärmsaaste puudumise tagamiseks kontrollitakse rakukultuure iga päev visuaalselt.

Külmutuskeskkond
Krüosäilitusvedelikusena kasutame täielikku kasvukeskkonda (sh FBS) + 10% DMSO, et tagada piisav elujõulisus pärast sulatamist, või CM-1 (Cytioni katalooginumber 800100), mis sisaldab optimeeritud osmoprotektante ja metaboolseid stabilisaatoreid, et parandada taastumist ja vähendada krüostressi.
Säilitamistingimused

Pikaajaliseks säilitamiseks asetage viaalid aurufaasis vedela lämmastikuga umbes -150 kuni -196 °C juures. Säilitamine temperatuuril -80 °C on vastuvõetav ainult lühikese vaheetapina enne vedela lämmastikuga üleviimist.

Tarne- ja kohaletoimetamistingimused

Krüokonserveeritud rakuliinid transporditakse kuiva jääga valideeritud, isoleeritud pakendis, milles on piisavalt külmutusainet, et säilitada kogu transpordi jooksul ligikaudu -78 °C. Vastuvõtmisel kontrollige konteinerit kohe ja viige viaalid viivitamatult sobivasse hoiuruumi.

08Annetaja

Doonori vanus
15 aastat
Etniline kuuluvus
Kaukaasia